MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	GAAA	2	8	39	46	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022602	AATC	2	8	55	62	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022602	GTTC	2	8	268	275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022602	TTGA	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022602	AAGA	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022602	AAAG	2	8	1015	1022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022602	TGAG	2	8	1139	1146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022602	ACTG	2	8	1221	1228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022602	TTAA	2	8	2234	2241	50 %	50 %	0 %	0 %	554639538
10	NC_022602	TATG	2	8	2265	2272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022602	AGAT	2	8	2288	2295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022602	CTAT	2	8	2558	2565	25 %	50 %	0 %	25 %	554639539
13	NC_022602	AACC	2	8	2953	2960	50 %	0 %	0 %	50 %	554639539
14	NC_022602	GAAA	2	8	3356	3363	75 %	0 %	25 %	0 %	554639513
15	NC_022602	ACCA	2	8	3705	3712	50 %	0 %	0 %	50 %	554639514
16	NC_022602	AAAC	2	8	3774	3781	75 %	0 %	0 %	25 %	554639514
17	NC_022602	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	554639514
18	NC_022602	GAAA	2	8	4393	4400	75 %	0 %	25 %	0 %	554639515
19	NC_022602	ATCA	2	8	4420	4427	50 %	25 %	0 %	25 %	554639515
20	NC_022602	TTTA	2	8	4818	4825	25 %	75 %	0 %	0 %	554639515
21	NC_022602	GAAT	2	8	5270	5277	50 %	25 %	25 %	0 %	554639515
22	NC_022602	AATC	2	8	5342	5349	50 %	25 %	0 %	25 %	554639515
23	NC_022602	GATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	25 %	0 %	554639515
24	NC_022602	AAAC	2	8	5619	5626	75 %	0 %	0 %	25 %	554639515
25	NC_022602	TACT	2	8	6745	6752	25 %	50 %	0 %	25 %	554639540
26	NC_022602	GAAT	2	8	6886	6893	50 %	25 %	25 %	0 %	554639540
27	NC_022602	CAAG	2	8	7582	7589	50 %	0 %	25 %	25 %	554639540
28	NC_022602	GAAT	2	8	7594	7601	50 %	25 %	25 %	0 %	554639540
29	NC_022602	GATC	2	8	8115	8122	25 %	25 %	25 %	25 %	554639516
30	NC_022602	TCCT	2	8	8262	8269	0 %	50 %	0 %	50 %	554639516
31	NC_022602	ATCC	2	8	8467	8474	25 %	25 %	0 %	50 %	554639516
32	NC_022602	ACTA	2	8	8610	8617	50 %	25 %	0 %	25 %	554639516
33	NC_022602	AATG	2	8	8804	8811	50 %	25 %	25 %	0 %	554639516
34	NC_022602	AATC	2	8	8978	8985	50 %	25 %	0 %	25 %	554639541
35	NC_022602	ACTG	2	8	9026	9033	25 %	25 %	25 %	25 %	554639541
36	NC_022602	CAAC	2	8	9370	9377	50 %	0 %	0 %	50 %	554639541
37	NC_022602	CAAC	2	8	9834	9841	50 %	0 %	0 %	50 %	554639542
38	NC_022602	GGGA	2	8	9847	9854	25 %	0 %	75 %	0 %	554639542
39	NC_022602	ATCA	2	8	10602	10609	50 %	25 %	0 %	25 %	554639517
40	NC_022602	AAGG	2	8	11376	11383	50 %	0 %	50 %	0 %	554639517
41	NC_022602	GATT	2	8	12132	12139	25 %	50 %	25 %	0 %	554639544
42	NC_022602	AATT	2	8	12268	12275	50 %	50 %	0 %	0 %	554639544
43	NC_022602	TATC	2	8	12385	12392	25 %	50 %	0 %	25 %	554639544
44	NC_022602	AATA	2	8	12750	12757	75 %	25 %	0 %	0 %	554639544
45	NC_022602	ATTA	2	8	13084	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	554639518
46	NC_022602	AAAC	2	8	13216	13223	75 %	0 %	0 %	25 %	554639518
47	NC_022602	TGAT	2	8	13259	13266	25 %	50 %	25 %	0 %	554639518
48	NC_022602	TTCT	2	8	13529	13536	0 %	75 %	0 %	25 %	554639518
49	NC_022602	CGTT	2	8	14001	14008	0 %	50 %	25 %	25 %	554639518
50	NC_022602	AAGA	2	8	14317	14324	75 %	0 %	25 %	0 %	554639518
51	NC_022602	CATG	2	8	14572	14579	25 %	25 %	25 %	25 %	554639518
52	NC_022602	AGTT	2	8	14676	14683	25 %	50 %	25 %	0 %	554639519
53	NC_022602	ACTA	2	8	15531	15538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022602	ATTT	2	8	16005	16012	25 %	75 %	0 %	0 %	554639546
55	NC_022602	AATT	2	8	16101	16108	50 %	50 %	0 %	0 %	554639546
56	NC_022602	AGAT	2	8	16509	16516	50 %	25 %	25 %	0 %	554639546
57	NC_022602	AGAA	2	8	16631	16638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022602	ATTA	2	8	16866	16873	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
59	NC_022602	TTAT	2	8	16991	16998	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
60	NC_022602	CAAA	2	8	17069	17076	75 %	0 %	0 %	25 %	554639547
61	NC_022602	AATT	2	8	17360	17367	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
62	NC_022602	TTTA	2	8	17393	17400	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
63	NC_022602	ACTT	2	8	18164	18171	25 %	50 %	0 %	25 %	554639547
64	NC_022602	ATTT	2	8	18445	18452	25 %	75 %	0 %	0 %	554639547
65	NC_022602	TGGT	2	8	18510	18517	0 %	50 %	50 %	0 %	554639547
66	NC_022602	CTTA	2	8	18799	18806	25 %	50 %	0 %	25 %	554639520
67	NC_022602	GTTT	2	8	19110	19117	0 %	75 %	25 %	0 %	554639520
68	NC_022602	ATTT	2	8	19497	19504	25 %	75 %	0 %	0 %	554639520
69	NC_022602	AAAG	2	8	19558	19565	75 %	0 %	25 %	0 %	554639520
70	NC_022602	ACAA	2	8	20088	20095	75 %	0 %	0 %	25 %	554639520
71	NC_022602	TGAT	2	8	20216	20223	25 %	50 %	25 %	0 %	554639520
72	NC_022602	ATTA	2	8	20593	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022602	AAGA	2	8	20604	20611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022602	TGAA	2	8	20787	20794	50 %	25 %	25 %	0 %	554639549
75	NC_022602	GAAA	2	8	20852	20859	75 %	0 %	25 %	0 %	554639549
76	NC_022602	CTTT	2	8	20879	20886	0 %	75 %	0 %	25 %	554639549
77	NC_022602	ATGT	2	8	20963	20970	25 %	50 %	25 %	0 %	554639549
78	NC_022602	AATC	2	8	21081	21088	50 %	25 %	0 %	25 %	554639549
79	NC_022602	CTAC	2	8	21227	21234	25 %	25 %	0 %	50 %	554639549
80	NC_022602	TATT	2	8	21319	21326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022602	TCTT	2	8	21767	21774	0 %	75 %	0 %	25 %	554639521
82	NC_022602	AACA	2	8	22684	22691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022602	GAAA	2	8	22936	22943	75 %	0 %	25 %	0 %	554639550
84	NC_022602	CATA	2	8	23672	23679	50 %	25 %	0 %	25 %	554639550
85	NC_022602	AAAT	2	8	23707	23714	75 %	25 %	0 %	0 %	554639550
86	NC_022602	AATT	2	8	23778	23785	50 %	50 %	0 %	0 %	554639550
87	NC_022602	TATT	2	8	23945	23952	25 %	75 %	0 %	0 %	554639550
88	NC_022602	AAAT	2	8	24006	24013	75 %	25 %	0 %	0 %	554639550
89	NC_022602	TTCA	2	8	24412	24419	25 %	50 %	0 %	25 %	554639522
90	NC_022602	ACTT	2	8	24893	24900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022602	GAAA	2	8	24994	25001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022602	TAAA	2	8	25148	25155	75 %	25 %	0 %	0 %	554639523
93	NC_022602	ATGA	2	8	25555	25562	50 %	25 %	25 %	0 %	554639523
94	NC_022602	GCTG	2	8	25700	25707	0 %	25 %	50 %	25 %	554639523
95	NC_022602	GTTT	2	8	25833	25840	0 %	75 %	25 %	0 %	554639523
96	NC_022602	GTTC	2	8	25857	25864	0 %	50 %	25 %	25 %	554639523
97	NC_022602	ATCA	2	8	25947	25954	50 %	25 %	0 %	25 %	554639523
98	NC_022602	TTTA	2	8	26046	26053	25 %	75 %	0 %	0 %	554639523
99	NC_022602	CTTC	2	8	26075	26082	0 %	50 %	0 %	50 %	554639523
100	NC_022602	AATC	2	8	26250	26257	50 %	25 %	0 %	25 %	554639523
101	NC_022602	TTAC	2	8	26850	26857	25 %	50 %	0 %	25 %	554639551
102	NC_022602	AAAT	2	8	27196	27203	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
103	NC_022602	TAAT	2	8	27289	27296	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
104	NC_022602	CAAT	2	8	27853	27860	50 %	25 %	0 %	25 %	554639551
105	NC_022602	ATTT	2	8	28075	28082	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
106	NC_022602	TTAT	2	8	28303	28310	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
107	NC_022602	AATT	2	8	28628	28635	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
108	NC_022602	TTAA	2	8	28908	28915	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
109	NC_022602	GTTT	2	8	29117	29124	0 %	75 %	25 %	0 %	554639551
110	NC_022602	ATTT	2	8	29533	29540	25 %	75 %	0 %	0 %	554639551
111	NC_022602	TGCT	2	8	29912	29919	0 %	50 %	25 %	25 %	554639551
112	NC_022602	ATAA	2	8	30294	30301	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
113	NC_022602	AAAT	2	8	30382	30389	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
114	NC_022602	ATAA	2	8	30558	30565	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
115	NC_022602	ATGA	2	8	30783	30790	50 %	25 %	25 %	0 %	554639551
116	NC_022602	AAAT	2	8	31669	31676	75 %	25 %	0 %	0 %	554639551
117	NC_022602	TGAT	2	8	31842	31849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022602	TTAA	2	8	31858	31865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022602	GATT	2	8	32046	32053	25 %	50 %	25 %	0 %	554639524
120	NC_022602	AATT	2	8	32304	32311	50 %	50 %	0 %	0 %	554639524
121	NC_022602	GCTT	2	8	32500	32507	0 %	50 %	25 %	25 %	554639524
122	NC_022602	GTTA	2	8	32941	32948	25 %	50 %	25 %	0 %	554639525
123	NC_022602	GCGT	2	8	32950	32957	0 %	25 %	50 %	25 %	554639525
124	NC_022602	ATGG	2	8	33187	33194	25 %	25 %	50 %	0 %	554639525
125	NC_022602	CTTG	2	8	33517	33524	0 %	50 %	25 %	25 %	554639526
126	NC_022602	GTGG	2	8	33733	33740	0 %	25 %	75 %	0 %	554639526
127	NC_022602	AATT	2	8	33783	33790	50 %	50 %	0 %	0 %	554639526
128	NC_022602	AGCA	2	8	33984	33991	50 %	0 %	25 %	25 %	554639526
129	NC_022602	TATT	2	8	35189	35196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022602	AATG	3	12	35235	35246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022602	GTTG	2	8	35722	35729	0 %	50 %	50 %	0 %	554639527
132	NC_022602	GAAA	2	8	35925	35932	75 %	0 %	25 %	0 %	554639527
133	NC_022602	AGTC	2	8	35959	35966	25 %	25 %	25 %	25 %	554639527
134	NC_022602	TATT	2	8	36081	36088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022602	TATT	2	8	36159	36166	25 %	75 %	0 %	0 %	554639552
136	NC_022602	AGTT	2	8	36256	36263	25 %	50 %	25 %	0 %	554639552
137	NC_022602	TCTT	2	8	36425	36432	0 %	75 %	0 %	25 %	554639552
138	NC_022602	AGGG	2	8	37131	37138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022602	TACA	2	8	37349	37356	50 %	25 %	0 %	25 %	554639553
140	NC_022602	GAAA	2	8	37627	37634	75 %	0 %	25 %	0 %	554639528
141	NC_022602	GCAA	2	8	38618	38625	50 %	0 %	25 %	25 %	554639528
142	NC_022602	TGCG	2	8	38650	38657	0 %	25 %	50 %	25 %	554639528
143	NC_022602	GAAT	2	8	39022	39029	50 %	25 %	25 %	0 %	554639529
144	NC_022602	GTTG	2	8	39376	39383	0 %	50 %	50 %	0 %	554639529
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169	NC_022602	ATAA	2	8	46266	46273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.