MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR47

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022602	GA	3	6	3	8	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022602	TA	3	6	2281	2286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022602	TA	3	6	2311	2316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022602	CT	3	6	2444	2449	0 %	50 %	0 %	50 %	554639539
5	NC_022602	GA	3	6	4372	4377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022602	GT	3	6	4381	4386	0 %	50 %	50 %	0 %	554639515
7	NC_022602	TC	3	6	6596	6601	0 %	50 %	0 %	50 %	554639540
8	NC_022602	GA	4	8	6658	6665	50 %	0 %	50 %	0 %	554639540
9	NC_022602	TA	3	6	7963	7968	50 %	50 %	0 %	0 %	554639516
10	NC_022602	CA	3	6	10972	10977	50 %	0 %	0 %	50 %	554639517
11	NC_022602	AC	3	6	11181	11186	50 %	0 %	0 %	50 %	554639517
12	NC_022602	AT	3	6	11674	11679	50 %	50 %	0 %	0 %	554639543
13	NC_022602	GA	3	6	11687	11692	50 %	0 %	50 %	0 %	554639543
14	NC_022602	TC	3	6	12009	12014	0 %	50 %	0 %	50 %	554639544
15	NC_022602	AT	4	8	12701	12708	50 %	50 %	0 %	0 %	554639544
16	NC_022602	AT	3	6	12774	12779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022602	AC	4	8	14493	14500	50 %	0 %	0 %	50 %	554639518
18	NC_022602	AT	3	6	15061	15066	50 %	50 %	0 %	0 %	554639519
19	NC_022602	TA	3	6	15458	15463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022602	TA	3	6	15684	15689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022602	TC	3	6	15873	15878	0 %	50 %	0 %	50 %	554639546
22	NC_022602	AT	3	6	16233	16238	50 %	50 %	0 %	0 %	554639546
23	NC_022602	AT	3	6	16358	16363	50 %	50 %	0 %	0 %	554639546
24	NC_022602	TA	3	6	16367	16372	50 %	50 %	0 %	0 %	554639546
25	NC_022602	AT	3	6	16610	16615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022602	AC	3	6	16802	16807	50 %	0 %	0 %	50 %	554639547
27	NC_022602	TA	3	6	16922	16927	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
28	NC_022602	AT	3	6	17409	17414	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
29	NC_022602	TA	3	6	17510	17515	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
30	NC_022602	AT	3	6	17579	17584	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
31	NC_022602	AT	3	6	17618	17623	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
32	NC_022602	TA	3	6	17852	17857	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
33	NC_022602	TA	3	6	17870	17875	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
34	NC_022602	TA	3	6	18106	18111	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
35	NC_022602	AT	3	6	18605	18610	50 %	50 %	0 %	0 %	554639547
36	NC_022602	TC	4	8	19477	19484	0 %	50 %	0 %	50 %	554639520
37	NC_022602	AT	4	8	20309	20316	50 %	50 %	0 %	0 %	554639548
38	NC_022602	GA	3	6	20630	20635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022602	TA	3	6	20695	20700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022602	TA	3	6	21048	21053	50 %	50 %	0 %	0 %	554639549
41	NC_022602	TA	3	6	21205	21210	50 %	50 %	0 %	0 %	554639549
42	NC_022602	AT	3	6	21419	21424	50 %	50 %	0 %	0 %	554639521
43	NC_022602	GA	3	6	21934	21939	50 %	0 %	50 %	0 %	554639521
44	NC_022602	TC	3	6	22050	22055	0 %	50 %	0 %	50 %	554639521
45	NC_022602	GA	3	6	22212	22217	50 %	0 %	50 %	0 %	554639521
46	NC_022602	AG	3	6	22349	22354	50 %	0 %	50 %	0 %	554639521
47	NC_022602	TA	3	6	22720	22725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022602	AT	3	6	24820	24825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022602	GA	3	6	26344	26349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022602	AT	3	6	26505	26510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022602	TA	3	6	27094	27099	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
52	NC_022602	AT	3	6	27272	27277	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
53	NC_022602	AG	3	6	27935	27940	50 %	0 %	50 %	0 %	554639551
54	NC_022602	AT	4	8	28718	28725	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
55	NC_022602	CA	3	6	29262	29267	50 %	0 %	0 %	50 %	554639551
56	NC_022602	GA	4	8	29878	29885	50 %	0 %	50 %	0 %	554639551
57	NC_022602	TA	3	6	30123	30128	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
58	NC_022602	AT	3	6	30220	30225	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
59	NC_022602	CT	3	6	30254	30259	0 %	50 %	0 %	50 %	554639551
60	NC_022602	AT	3	6	30692	30697	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
61	NC_022602	GA	3	6	30864	30869	50 %	0 %	50 %	0 %	554639551
62	NC_022602	AT	3	6	31077	31082	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
63	NC_022602	AT	3	6	31340	31345	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
64	NC_022602	AT	3	6	31675	31680	50 %	50 %	0 %	0 %	554639551
65	NC_022602	TA	3	6	31823	31828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022602	AC	3	6	31884	31889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022602	CT	3	6	32929	32934	0 %	50 %	0 %	50 %	554639525
68	NC_022602	AT	3	6	33634	33639	50 %	50 %	0 %	0 %	554639526
69	NC_022602	TA	3	6	33747	33752	50 %	50 %	0 %	0 %	554639526
70	NC_022602	TG	3	6	34780	34785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022602	AT	3	6	35057	35062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022602	TC	3	6	35143	35148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022602	GA	3	6	36269	36274	50 %	0 %	50 %	0 %	554639552
74	NC_022602	AC	4	8	37176	37183	50 %	0 %	0 %	50 %	554639553
75	NC_022602	TA	3	6	37234	37239	50 %	50 %	0 %	0 %	554639553
76	NC_022602	AT	4	8	37270	37277	50 %	50 %	0 %	0 %	554639553
77	NC_022602	CT	3	6	37675	37680	0 %	50 %	0 %	50 %	554639528
78	NC_022602	CA	3	6	37811	37816	50 %	0 %	0 %	50 %	554639528
79	NC_022602	GA	3	6	38472	38477	50 %	0 %	50 %	0 %	554639528
80	NC_022602	CT	3	6	38948	38953	0 %	50 %	0 %	50 %	554639529
81	NC_022602	TC	3	6	39166	39171	0 %	50 %	0 %	50 %	554639529
82	NC_022602	CA	3	6	39570	39575	50 %	0 %	0 %	50 %	554639529
83	NC_022602	GA	3	6	39591	39596	50 %	0 %	50 %	0 %	554639529
84	NC_022602	AT	3	6	39823	39828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022602	GA	3	6	40057	40062	50 %	0 %	50 %	0 %	554639530
86	NC_022602	GA	3	6	40159	40164	50 %	0 %	50 %	0 %	554639530
87	NC_022602	CT	3	6	40584	40589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022602	AT	3	6	40603	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022602	AT	3	6	40617	40622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022602	TA	3	6	41723	41728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022602	TA	3	6	41928	41933	50 %	50 %	0 %	0 %	554639555
92	NC_022602	CT	3	6	42071	42076	0 %	50 %	0 %	50 %	554639555
93	NC_022602	TC	3	6	42315	42320	0 %	50 %	0 %	50 %	554639555
94	NC_022602	AC	3	6	44865	44870	50 %	0 %	0 %	50 %	554639557
95	NC_022602	TA	3	6	45618	45623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022602	TG	3	6	46438	46443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.