MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR12

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022601	CCA	2	6	10	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022601	CAA	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022601	CAA	2	6	66	71	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
4	NC_022601	GCA	2	6	84	89	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
5	NC_022601	GTT	2	6	93	98	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639097
6	NC_022601	TTA	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639097
7	NC_022601	ACG	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
8	NC_022601	AGA	2	6	493	498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639097
9	NC_022601	CAT	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639097
10	NC_022601	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
11	NC_022601	CAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
12	NC_022601	GCA	2	6	845	850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
13	NC_022601	AAC	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
14	NC_022601	AAC	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
15	NC_022601	GTT	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022601	TTG	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022601	TTG	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022601	TTG	2	6	1818	1823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022601	TTG	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022601	ATT	2	6	1934	1939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022601	ACA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639098
22	NC_022601	ATT	2	6	2151	2156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639098
23	NC_022601	TAA	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
24	NC_022601	AAG	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
25	NC_022601	AGA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
26	NC_022601	GTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639098
27	NC_022601	CCT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639098
28	NC_022601	AAT	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
29	NC_022601	GGT	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022601	AGA	2	6	2825	2830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
31	NC_022601	AGC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639112
32	NC_022601	GAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
33	NC_022601	ATA	2	6	2956	2961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
34	NC_022601	AAC	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639112
35	NC_022601	ATT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
36	NC_022601	TAA	3	9	3089	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
37	NC_022601	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
38	NC_022601	AAT	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
39	NC_022601	ATG	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
40	NC_022601	GAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
41	NC_022601	CAG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639099
42	NC_022601	AAC	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
43	NC_022601	TTC	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639099
44	NC_022601	AAC	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
45	NC_022601	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639099
46	NC_022601	ATG	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022601	GCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639100
48	NC_022601	ACC	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639100
49	NC_022601	AAT	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639100
50	NC_022601	GAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639100
51	NC_022601	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639100
52	NC_022601	GGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022601	TAG	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022601	AGG	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022601	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
56	NC_022601	TCA	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639101
57	NC_022601	CAG	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639101
58	NC_022601	AGT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
59	NC_022601	AGT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
60	NC_022601	GAA	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
61	NC_022601	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
62	NC_022601	TCT	3	9	5039	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
63	NC_022601	CTG	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639101
64	NC_022601	TTC	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
65	NC_022601	GAT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
66	NC_022601	AGA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
67	NC_022601	GGA	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639101
68	NC_022601	GGT	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639101
69	NC_022601	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
70	NC_022601	AGA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
71	NC_022601	AGT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
72	NC_022601	ACA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639101
73	NC_022601	CTT	2	6	5693	5698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022601	TTA	3	9	5721	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022601	ACC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639102
76	NC_022601	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
77	NC_022601	AAT	2	6	5878	5883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
78	NC_022601	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
79	NC_022601	AGC	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639102
80	NC_022601	AAG	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
81	NC_022601	AAT	2	6	6291	6296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
82	NC_022601	CTT	2	6	6337	6342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639103
83	NC_022601	ATT	2	6	6464	6469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639103
84	NC_022601	TCA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639103
85	NC_022601	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
86	NC_022601	AAT	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
87	NC_022601	AGT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639103
88	NC_022601	TCG	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
89	NC_022601	TAG	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639103
90	NC_022601	AAT	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
91	NC_022601	CTG	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
92	NC_022601	TCC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022601	TAT	2	6	6981	6986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022601	TAG	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022601	GAA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022601	AAG	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022601	CTT	2	6	7380	7385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639104
98	NC_022601	AGG	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639104
99	NC_022601	CCA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639104
100	NC_022601	CAC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639104
101	NC_022601	TGA	3	9	7632	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639104
102	NC_022601	AGA	2	6	7641	7646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639104
103	NC_022601	TCC	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639104
104	NC_022601	GGC	2	6	7675	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	554639104
105	NC_022601	GTA	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639104
106	NC_022601	GAC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022601	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022601	ATT	2	6	7907	7912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022601	AAT	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639105
110	NC_022601	CTT	2	6	8037	8042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639105
111	NC_022601	ATT	2	6	8164	8169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639105
112	NC_022601	TCA	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639105
113	NC_022601	GCT	2	6	8318	8323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639105
114	NC_022601	AAT	2	6	8391	8396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639105
115	NC_022601	AGT	2	6	8483	8488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639105
116	NC_022601	TCG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639105
117	NC_022601	TAG	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639105
118	NC_022601	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639105
119	NC_022601	CTG	2	6	8623	8628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639105
120	NC_022601	TCC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_022601	TAT	2	6	8681	8686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022601	TAG	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022601	GAA	2	6	8802	8807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022601	AAG	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022601	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639106
126	NC_022601	AGG	2	6	9096	9101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639106
127	NC_022601	CCA	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639106
128	NC_022601	CAC	2	6	9317	9322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639106
129	NC_022601	TGA	3	9	9331	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639106
130	NC_022601	AGA	2	6	9340	9345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639106
131	NC_022601	TCC	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639106
132	NC_022601	GGC	2	6	9374	9379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	554639106
133	NC_022601	GTA	2	6	9395	9400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639106
134	NC_022601	GAC	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022601	TTC	2	6	9592	9597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022601	ATT	2	6	9606	9611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022601	AAT	2	6	9690	9695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639107
138	NC_022601	CTT	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639107
139	NC_022601	ATT	2	6	9863	9868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639107
140	NC_022601	TCA	2	6	9978	9983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639107
141	NC_022601	GCT	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639107
142	NC_022601	AAT	2	6	10090	10095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639107
143	NC_022601	AGT	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639107
144	NC_022601	TCG	2	6	10216	10221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022601	CCA	2	6	10541	10546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639108
146	NC_022601	TTA	2	6	10557	10562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639108
147	NC_022601	AAG	2	6	10577	10582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639108
148	NC_022601	CTT	3	9	10623	10631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639108
149	NC_022601	CCT	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639108
150	NC_022601	TGC	2	6	10732	10737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639108
151	NC_022601	CTA	2	6	10752	10757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639108
152	NC_022601	AAT	2	6	10848	10853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639108
153	NC_022601	TCC	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_022601	TAA	2	6	11001	11006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639109
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157	NC_022601	GTA	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022601	TAT	2	6	11372	11377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022601	GGA	2	6	11453	11458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022601	GAA	2	6	11565	11570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639110
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164	NC_022601	GGA	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639110
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169	NC_022601	CAA	2	6	12219	12224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639113
170	NC_022601	AGA	2	6	12340	12345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022601	CAA	2	6	12606	12611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.