MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeobacter sp. JS

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022600	CCTCTG	2	12	118308	118319	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022600	GTCGGA	2	12	153634	153645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022600	TCTGCG	2	12	157596	157607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022600	TCACTG	2	12	249018	249029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022600	ATCGTT	2	12	273991	274002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022600	GCCGCA	2	12	290456	290467	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022600	TAGAGA	2	12	291989	292000	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022600	AACACA	2	12	516496	516507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022600	TACCAC	2	12	588122	588133	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022600	TTACAG	2	12	604588	604599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022600	CTGGCG	2	12	606145	606156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022600	ACGACT	2	12	606265	606276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022600	GAGGGG	2	12	614947	614958	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022600	CCCCGT	2	12	641293	641304	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022600	TAGCCA	2	12	696192	696203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022600	CAAAAA	2	12	804406	804417	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022600	TGGCTG	2	12	831253	831264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022600	AGCTGC	2	12	920562	920573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022600	CTCATC	2	12	967466	967477	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022600	GCTCCT	2	12	1014642	1014653	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022600	GCTCCT	2	12	1016347	1016358	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022600	GGTGGC	2	12	1016586	1016597	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022600	CGTCTC	2	12	1031666	1031677	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022600	AGGGCG	2	12	1035608	1035619	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022600	GTTAAA	2	12	1041569	1041580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022600	CGGGTT	2	12	1061770	1061781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022600	CAATCT	2	12	1074533	1074544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022600	CAGTGA	2	12	1095275	1095286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022600	ACCTTC	2	12	1152249	1152260	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022600	GCCGCT	2	12	1201797	1201808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022600	CTCCCT	2	12	1222361	1222372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_022600	GGTTCA	2	12	1264548	1264559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022600	AGATCT	2	12	1291850	1291861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022600	GTTGCT	2	12	1319452	1319463	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022600	TGCTGG	2	12	1443990	1444001	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022600	CAGTGA	2	12	1562754	1562765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022600	TCCTGC	2	12	1596511	1596522	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022600	CCCCTT	2	12	1609505	1609516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_022600	GCCACT	2	12	1635983	1635994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022600	GTCCTG	2	12	1692172	1692183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022600	CGACGG	2	12	1704618	1704629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022600	GAAAAA	2	12	1714714	1714725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022600	CAGTTA	2	12	1838933	1838944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022600	CTGGCT	2	12	1845512	1845523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022600	TTGAGA	2	12	1853680	1853691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022600	ATCTGG	2	12	1921762	1921773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022600	AGATAG	2	12	1933847	1933858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022600	CAGCCG	2	12	1989911	1989922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022600	GCAGCG	2	12	2176610	2176621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022600	TGCGGC	2	12	2239391	2239402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022600	ATCTAT	2	12	2318941	2318952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022600	GCGGTG	2	12	2322065	2322076	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022600	CTGCCA	2	12	2357308	2357319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022600	AAAGTA	2	12	2406033	2406044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022600	GATCGA	2	12	2435803	2435814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022600	CGCCTT	2	12	2466997	2467008	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022600	TCAAGG	2	12	2498718	2498729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022600	AGTGAA	4	24	2557519	2557542	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022600	TCGCTT	2	12	2730570	2730581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022600	GGCAAG	2	12	2784001	2784012	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022600	GCGCTG	2	12	2785001	2785012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022600	CAGTGA	2	12	2834339	2834350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022600	TCCCCT	2	12	2834643	2834654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022600	GCGAGT	2	12	2835395	2835406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022600	GCACCC	2	12	2850139	2850150	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_022600	GCTTTT	2	12	2850584	2850595	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022600	GTTTGG	2	12	2850645	2850656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022600	GGGTTT	2	12	2850664	2850675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022600	TTTTTC	2	12	2931773	2931784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022600	GGTGGC	2	12	2939929	2939940	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022600	GCAGGA	2	12	2942903	2942914	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022600	GTATCG	2	12	2961429	2961440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022600	CGAGGG	2	12	2965784	2965795	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022600	GACGCG	2	12	2981845	2981856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022600	CTGTCG	2	12	2990929	2990940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022600	AGGGGC	2	12	3059303	3059314	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022600	CTGCTT	2	12	3086107	3086118	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022600	CAAAAG	2	12	3131176	3131187	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022600	CTGCAT	2	12	3212755	3212766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022600	CAAAGA	2	12	3232942	3232953	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022600	GCCCCC	2	12	3244171	3244182	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
82	NC_022600	CAGTGA	2	12	3312877	3312888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022600	TTTTGC	2	12	3372512	3372523	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022600	CTGTTC	2	12	3449231	3449242	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022600	CTTCCA	2	12	3468658	3468669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022600	TTCCCG	2	12	3536411	3536422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022600	CAATGA	2	12	3539015	3539026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022600	GCTATT	2	12	3562199	3562210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022600	CTTTTG	2	12	3619428	3619439	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022600	CGCCCT	2	12	3636335	3636346	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022600	TCGATT	2	12	3783579	3783590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022600	GGAACG	2	12	3798906	3798917	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022600	TGGCTG	2	12	3983966	3983977	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022600	CTTGCA	2	12	4000706	4000717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022600	CAAAGA	2	12	4035558	4035569	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022600	CCTGCT	2	12	4089560	4089571	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022600	CAGGGC	2	12	4158286	4158297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022600	AATTTT	2	12	4262087	4262098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022600	CATCGT	2	12	4272347	4272358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022600	ACGGAA	2	12	4272797	4272808	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022600	CTGGCT	2	12	4277948	4277959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022600	AGAGCT	2	12	4279798	4279809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022600	CGCCTC	2	12	4298366	4298377	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022600	TGCGGC	2	12	4359806	4359817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022600	ACAAAA	2	12	4368745	4368756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022600	CCCTGA	2	12	4475821	4475832	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022600	GACCCT	2	12	4503088	4503099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022600	CGCCTG	2	12	4533029	4533040	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022600	AGGAAA	2	12	4535191	4535202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022600	GGGTGT	2	12	4570230	4570241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022600	TGACAG	2	12	4599564	4599575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022600	GGAGCA	2	12	4642238	4642249	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022600	CTCTTT	2	12	4663145	4663156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022600	GATGCA	2	12	4679049	4679060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.