MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gloeobacter sp. JS

Total Repeats: 1282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022600	CAGC	2	8	8149	8156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022600	GCGG	2	8	13702	13709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022600	GCCC	2	8	13853	13860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_022600	CTTT	2	8	24353	24360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022600	CGAT	2	8	25543	25550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022600	TGGG	2	8	28010	28017	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022600	TCGT	2	8	36830	36837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022600	GCCT	2	8	44389	44396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022600	AGCA	2	8	49515	49522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022600	ACGG	2	8	67752	67759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022600	TCCA	2	8	69891	69898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022600	GATA	2	8	70132	70139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022600	TACG	2	8	72914	72921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022600	CTTA	2	8	73079	73086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022600	TCAC	2	8	79420	79427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022600	GCCT	2	8	80513	80520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022600	TAGA	2	8	86953	86960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022600	GATC	2	8	87705	87712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022600	CAAA	2	8	89339	89346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022600	TTCA	2	8	89366	89373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022600	TTCC	2	8	89589	89596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022600	CTTC	2	8	90996	91003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022600	TAAT	2	8	94417	94424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022600	AACT	2	8	98267	98274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022600	AATT	2	8	101124	101131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022600	CATT	2	8	101338	101345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022600	AATT	2	8	104640	104647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022600	GTTC	2	8	104904	104911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022600	ATTT	2	8	105935	105942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022600	GCCA	2	8	110195	110202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022600	GCAG	2	8	110224	110231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022600	CGAA	2	8	111506	111513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022600	AGAA	2	8	119403	119410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022600	GCCC	2	8	120342	120349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_022600	GAGG	2	8	131032	131039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022600	TGAT	2	8	131684	131691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022600	CAAC	2	8	131810	131817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022600	GCAC	2	8	137361	137368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022600	TGTT	2	8	138315	138322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022600	GTTA	2	8	141600	141607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022600	AGGA	2	8	143123	143130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022600	ACTC	2	8	150006	150013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022600	TAGA	2	8	150060	150067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022600	TCTT	2	8	150068	150075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022600	CCAC	2	8	154971	154978	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_022600	ACGG	2	8	156785	156792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022600	CCTC	2	8	157612	157619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_022600	ATCG	2	8	157625	157632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022600	CTGC	2	8	159125	159132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022600	GAAC	2	8	159195	159202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022600	CCCA	2	8	162115	162122	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_022600	AGAA	2	8	162252	162259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022600	ATGG	2	8	163815	163822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022600	CCAA	2	8	163943	163950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022600	CGAT	2	8	172454	172461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022600	GAAG	2	8	177875	177882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022600	TCGC	2	8	177905	177912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022600	CGGT	2	8	183065	183072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022600	TATC	2	8	188379	188386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022600	TCAA	2	8	188457	188464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022600	CTGC	2	8	193261	193268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022600	AATC	2	8	196009	196016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022600	CTCG	2	8	200015	200022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022600	CTGC	2	8	204397	204404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022600	AAAG	2	8	213742	213749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022600	AAAT	2	8	213775	213782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022600	CTTG	2	8	215879	215886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022600	CAGT	2	8	217800	217807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022600	GCCC	2	8	224445	224452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_022600	GCAA	2	8	225366	225373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_022600	TTCG	2	8	228949	228956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022600	AGCA	2	8	229301	229308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_022600	AATG	2	8	233708	233715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022600	CCAG	2	8	235292	235299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022600	CTGC	2	8	235564	235571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022600	GCCA	2	8	235643	235650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022600	TGCG	3	12	237999	238010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022600	CCTG	2	8	248267	248274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022600	CAGC	2	8	249323	249330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022600	GGGC	2	8	257637	257644	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022600	AAAC	2	8	257653	257660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_022600	CACT	2	8	258126	258133	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022600	TCGG	2	8	265929	265936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022600	GATA	2	8	267264	267271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022600	GAAG	2	8	269195	269202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022600	GTGA	2	8	277852	277859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022600	CTGT	2	8	281375	281382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022600	GCTT	2	8	282043	282050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022600	AGAA	2	8	282746	282753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022600	CCTG	2	8	292125	292132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022600	AAAT	2	8	292217	292224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022600	GATC	2	8	292739	292746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022600	GCTT	2	8	306919	306926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022600	ACCC	2	8	313567	313574	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_022600	TTCA	2	8	318001	318008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022600	CTCA	2	8	318347	318354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022600	AGGA	2	8	318385	318392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022600	GCCC	2	8	325052	325059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_022600	AGGG	2	8	332383	332390	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022600	CAGG	2	8	335729	335736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022600	CCAC	2	8	337824	337831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_022600	GACA	2	8	343198	343205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022600	GGAA	2	8	354700	354707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022600	CAAG	2	8	358584	358591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022600	CCAG	2	8	368033	368040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022600	CCGA	2	8	368098	368105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022600	GCCA	2	8	384583	384590	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022600	TCTG	2	8	391487	391494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022600	TTTA	2	8	395295	395302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022600	GTGC	2	8	395364	395371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022600	AGCA	2	8	403099	403106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022600	GATC	2	8	405110	405117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022600	ACTT	2	8	405154	405161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022600	GCGT	2	8	405420	405427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022600	CCTG	2	8	408826	408833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022600	CAGC	2	8	411446	411453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022600	TTCA	2	8	413473	413480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022600	CCTG	2	8	415345	415352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022600	CTCG	2	8	417737	417744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022600	CTGC	2	8	417865	417872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022600	TATC	2	8	421056	421063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022600	CACT	2	8	430533	430540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022600	AGCG	2	8	430896	430903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022600	GTGC	2	8	431289	431296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022600	GTTT	2	8	431503	431510	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022600	TGGG	2	8	440587	440594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022600	CCCT	2	8	450543	450550	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_022600	CCTG	2	8	460239	460246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022600	ATCA	2	8	463892	463899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022600	ATTG	2	8	463908	463915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022600	GATC	2	8	481360	481367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022600	GCTG	2	8	481389	481396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022600	AGGA	2	8	488912	488919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022600	CGCA	2	8	516717	516724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022600	TGAC	2	8	516858	516865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022600	CGGT	2	8	524533	524540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022600	CCAG	2	8	528310	528317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022600	GACA	2	8	537385	537392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022600	AGCC	2	8	541831	541838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022600	GCCC	2	8	543303	543310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_022600	TTGC	2	8	543456	543463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022600	GGAC	2	8	543484	543491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022600	GAGC	2	8	551162	551169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022600	TCGA	2	8	551942	551949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022600	CTGT	2	8	552650	552657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022600	TTAA	2	8	558601	558608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022600	TTAA	2	8	577727	577734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022600	AGGC	2	8	577778	577785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022600	GTCT	2	8	588494	588501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_022600	GAAC	2	8	590895	590902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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156	NC_022600	GCAG	2	8	608505	608512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_022600	TACT	2	8	674491	674498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_022600	GGCA	2	8	1027453	1027460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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273	NC_022600	CAGC	2	8	1029918	1029925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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281	NC_022600	GCAG	2	8	1043258	1043265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
282	NC_022600	CAGT	2	8	1046632	1046639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_022600	CGGG	2	8	1047940	1047947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
284	NC_022600	AATA	2	8	1050320	1050327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_022600	TAGA	2	8	1052007	1052014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_022600	GCGG	2	8	1054144	1054151	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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293	NC_022600	TGCT	2	8	1066544	1066551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
294	NC_022600	CTAG	2	8	1066830	1066837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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296	NC_022600	GACT	2	8	1068884	1068891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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373	NC_022600	TCCT	2	8	1325049	1325056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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411	NC_022600	GCGG	2	8	1436803	1436810	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
412	NC_022600	ACCA	2	8	1439847	1439854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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434	NC_022600	AACC	2	8	1497806	1497813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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439	NC_022600	CAGG	2	8	1534992	1534999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
440	NC_022600	ATAG	2	8	1543146	1543153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
441	NC_022600	ATTT	2	8	1545938	1545945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022600	ACAG	2	8	1545982	1545989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
443	NC_022600	CCTG	2	8	1550353	1550360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
444	NC_022600	TGTA	2	8	1553707	1553714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
445	NC_022600	TGAG	2	8	1555777	1555784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_022600	TCGG	2	8	1570006	1570013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_022600	TTGG	2	8	1579662	1579669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022600	CAGC	2	8	1587547	1587554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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454	NC_022600	TCGC	2	8	1599018	1599025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_022600	CGTC	2	8	1599076	1599083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
456	NC_022600	TAAG	2	8	1606491	1606498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_022600	GGCG	2	8	1612888	1612895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
463	NC_022600	ACCG	2	8	1617355	1617362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
464	NC_022600	ATAG	2	8	1617381	1617388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
465	NC_022600	GAAG	2	8	1617392	1617399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_022600	GAGC	2	8	1621256	1621263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_022600	GCTT	2	8	1622379	1622386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_022600	TAAT	2	8	1625517	1625524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_022600	GATC	2	8	1625538	1625545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
471	NC_022600	CGAG	2	8	1634062	1634069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_022600	GGTT	2	8	1651829	1651836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022600	AAGG	2	8	1657533	1657540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
474	NC_022600	CAGG	2	8	1659585	1659592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_022600	GCAG	2	8	1663864	1663871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
476	NC_022600	CGCC	2	8	1666662	1666669	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
477	NC_022600	CCCG	2	8	1667350	1667357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
478	NC_022600	CAGG	2	8	1667507	1667514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
479	NC_022600	AAGG	2	8	1667601	1667608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
480	NC_022600	ATTT	2	8	1671205	1671212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_022600	AGGC	2	8	1672098	1672105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_022600	GTGA	2	8	1672134	1672141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_022600	CCGC	2	8	1674900	1674907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
484	NC_022600	CCGC	2	8	1674942	1674949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_022600	CCAT	2	8	1675989	1675996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_022600	AGCC	2	8	1677212	1677219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_022600	GCTT	2	8	1678509	1678516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_022600	AGTG	2	8	1678536	1678543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_022600	GACG	2	8	1683435	1683442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_022600	GAAA	2	8	1688604	1688611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_022600	TCGC	2	8	1690723	1690730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_022600	AGCC	2	8	1701701	1701708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_022600	CTGC	2	8	1708382	1708389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_022600	GCTC	2	8	1710980	1710987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_022600	TCCC	2	8	1712955	1712962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
498	NC_022600	TCGC	2	8	1713206	1713213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_022600	GCAG	2	8	1713449	1713456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_022600	TTCT	2	8	1725714	1725721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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