MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022593	TTAAAT	2	12	10490	10501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022593	TAAAAT	2	12	12414	12425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022593	ATTTTT	2	12	69261	69272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022593	TTTCCC	2	12	71636	71647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022593	AAAATT	2	12	84253	84264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022593	TTTATA	2	12	135299	135310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022593	AAGTTC	2	12	135643	135654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022593	TGAAAT	2	12	173979	173990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022593	ATATAA	2	12	196465	196476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022593	TAAAAA	2	12	215735	215746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022593	TAAAAA	2	12	262066	262077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022593	AAATAG	2	12	266899	266910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022593	TAAAAA	2	12	279203	279214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022593	AAAAGA	2	12	289235	289246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022593	TAAATT	2	12	294107	294118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022593	GTTCGA	2	12	296658	296669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022593	ATAAAA	2	12	297354	297365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022593	ATTCTA	2	12	302144	302155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022593	TTTGAT	2	12	303570	303581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022593	AAATAC	2	12	321008	321019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022593	CAAAAG	2	12	393367	393378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022593	TAAAAT	2	12	427022	427033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022593	TTTTTA	2	12	454397	454408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022593	TAAAAA	2	12	471262	471273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022593	ATGAAA	2	12	474437	474448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022593	TTTTTA	2	12	479266	479277	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022593	ACACCG	2	12	484911	484922	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_022593	TCCATT	2	12	485886	485897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022593	AAATAA	2	12	490697	490708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022593	TGTTTT	2	12	506921	506932	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022593	TTTTAG	2	12	512875	512886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022593	TGGAAG	2	12	563808	563819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022593	TGGTTT	2	12	570917	570928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022593	GTAAAG	2	12	582570	582581	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022593	ATTTTT	2	12	594877	594888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022593	AGAAAA	2	12	609986	609997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022593	ATGTAA	2	12	617558	617569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022593	ATTTAT	2	12	619139	619150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022593	TCTTCA	2	12	619247	619258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022593	TCACCG	2	12	619452	619463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022593	ATCAGC	2	12	619490	619501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022593	CCAAGG	2	12	631145	631156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022593	GGTTAA	2	12	635629	635640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022593	GATTTA	2	12	653222	653233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022593	TATAAA	2	12	680684	680695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022593	AACATA	2	12	727728	727739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022593	AATTAA	2	12	740229	740240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022593	CAAAAA	2	12	747425	747436	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022593	ATTTAA	2	12	748610	748621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022593	AGCATT	2	12	748640	748651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022593	AATTTA	2	12	768812	768823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022593	TTATTT	2	12	792102	792113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022593	AATTTA	2	12	821814	821825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022593	AGATTT	2	12	825105	825116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022593	TATAAA	2	12	842122	842133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022593	TCAAAA	2	12	852976	852987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022593	TTATAA	2	12	908864	908875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022593	AAAAGT	2	12	918135	918146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022593	TCTTAA	2	12	923656	923667	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022593	TAAAAA	2	12	934081	934092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022593	TAAATA	2	12	937000	937011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022593	AAGAAA	2	12	945130	945141	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022593	ATTTTT	2	12	973680	973691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022593	AAAAGG	2	12	1049405	1049416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022593	ATTGAA	2	12	1050180	1050191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022593	TTATCA	2	12	1051110	1051121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022593	AAGTGG	2	12	1051318	1051329	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022593	TTTATT	2	12	1052103	1052114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022593	TGGATA	2	12	1057673	1057684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022593	TTTAAA	2	12	1059516	1059527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022593	TATTTT	2	12	1065700	1065711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022593	TAAAAA	2	12	1073495	1073506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022593	AAAGAA	2	12	1074307	1074318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022593	TTTTAA	2	12	1075661	1075672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022593	TTTTTA	2	12	1103352	1103363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022593	CATGCT	2	12	1110981	1110992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022593	TAAAAA	2	12	1133086	1133097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022593	AGTAAA	2	12	1165748	1165759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022593	AAAAAT	2	12	1274311	1274322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022593	GTTTTC	2	12	1289276	1289287	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022593	CAAGTA	2	12	1353739	1353750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022593	AGGATA	2	12	1366016	1366027	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022593	ATTATA	2	12	1387211	1387222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022593	TTAATT	2	12	1458581	1458592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022593	CTTTTT	2	12	1490936	1490947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022593	TCTATT	2	12	1503046	1503057	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022593	TAAAAA	2	12	1509492	1509503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022593	TTTAAT	2	12	1519888	1519899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022593	TAAGTT	2	12	1524293	1524304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022593	TAAAAA	2	12	1525006	1525017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022593	AATTTT	2	12	1525047	1525058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022593	TAAATC	2	12	1542229	1542240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022593	TAATAG	2	12	1558530	1558541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022593	ACGTTT	2	12	1580568	1580579	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022593	TATTTT	2	12	1607327	1607338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022593	ATATTA	2	12	1622652	1622663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022593	TAAAAA	2	12	1634249	1634260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022593	CTATTT	2	12	1680004	1680015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022593	TCAACT	2	12	1685620	1685631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022593	TTTTAC	2	12	1687622	1687633	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022593	TTAGAA	2	12	1688377	1688388	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022593	TTTACA	2	12	1698832	1698843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022593	TAAAAA	2	12	1710877	1710888	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022593	CTTCGG	2	12	1714618	1714629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022593	TAAAAA	2	12	1737601	1737612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022593	TAAAAA	2	12	1789541	1789552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022593	CAAAAA	2	12	1816337	1816348	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022593	ATTTTT	2	12	1826068	1826079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022593	CATCCT	2	12	1830360	1830371	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022593	CTTTCT	2	12	1837047	1837058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022593	CATTTT	2	12	1841151	1841162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022593	AAAATA	2	12	1865944	1865955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022593	TTAAAA	2	12	1867100	1867111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022593	AGCCAG	2	12	1892149	1892160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022593	TATTTT	2	12	1898921	1898932	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022593	CATTTT	2	12	2000856	2000867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022593	ATTTTA	2	12	2017011	2017022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022593	TAAAAT	2	12	2021669	2021680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022593	TATTTT	2	12	2046575	2046586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022593	TATTTG	3	18	2078307	2078324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022593	TTAAAT	2	12	2115130	2115141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022593	TTATCT	2	12	2135274	2135285	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022593	CTTCCA	2	12	2139832	2139843	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022593	TTTTTA	2	12	2170389	2170400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022593	TACAAA	2	12	2177644	2177655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022593	TTTTTA	2	12	2212709	2212720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022593	AGTGTT	2	12	2243741	2243752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022593	TAAAAA	2	12	2246573	2246584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022593	ACAATT	2	12	2247851	2247862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022593	CAAAAT	2	12	2248957	2248968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022593	TTTTCA	2	12	2256872	2256883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022593	TATAAA	2	12	2263362	2263373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022593	AATTAT	2	12	2263411	2263422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022593	TTCAGT	2	12	2268718	2268729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022593	CTTCTG	2	12	2269570	2269581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022593	CAAAAT	2	12	2298947	2298958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022593	TTTTTA	2	12	2310017	2310028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022593	CAAAAA	2	12	2339865	2339876	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.