MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325

Total Repeats: 1626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022593	AACTG	2	10	258	267	40 %	20 %	20 %	20 %	554463092
2	NC_022593	ATAAA	2	10	7044	7053	80 %	20 %	0 %	0 %	554463095
3	NC_022593	AAGAT	2	10	9830	9839	60 %	20 %	20 %	0 %	554463096
4	NC_022593	AGTAA	2	10	9973	9982	60 %	20 %	20 %	0 %	554463097
5	NC_022593	TAATA	2	10	10157	10166	60 %	40 %	0 %	0 %	554463097
6	NC_022593	CTTTA	2	10	12279	12288	20 %	60 %	0 %	20 %	554463099
7	NC_022593	AATTT	2	10	13089	13098	40 %	60 %	0 %	0 %	554464822
8	NC_022593	ATAGG	2	10	13615	13624	40 %	20 %	40 %	0 %	554464822
9	NC_022593	ACTCT	2	10	13899	13908	20 %	40 %	0 %	40 %	554464822
10	NC_022593	TAAAT	2	10	14970	14979	60 %	40 %	0 %	0 %	554464823
11	NC_022593	ATTTT	2	10	17487	17496	20 %	80 %	0 %	0 %	554463101
12	NC_022593	AAATG	2	10	17725	17734	60 %	20 %	20 %	0 %	554463101
13	NC_022593	TACTT	2	10	19387	19396	20 %	60 %	0 %	20 %	554463101
14	NC_022593	TTTAG	2	10	21459	21468	20 %	60 %	20 %	0 %	554463103
15	NC_022593	GGGTT	2	10	22755	22764	0 %	40 %	60 %	0 %	554463105
16	NC_022593	ATTTT	2	10	24392	24401	20 %	80 %	0 %	0 %	554463106
17	NC_022593	TTTGG	2	10	25246	25255	0 %	60 %	40 %	0 %	554463107
18	NC_022593	TGGTA	2	10	27187	27196	20 %	40 %	40 %	0 %	554463108
19	NC_022593	TTTTA	2	10	29734	29743	20 %	80 %	0 %	0 %	554464827
20	NC_022593	AAATA	2	10	30500	30509	80 %	20 %	0 %	0 %	554464827
21	NC_022593	ACTTT	2	10	35314	35323	20 %	60 %	0 %	20 %	554463112
22	NC_022593	GATTG	2	10	35575	35584	20 %	40 %	40 %	0 %	554463113
23	NC_022593	AAAAG	2	10	36026	36035	80 %	0 %	20 %	0 %	554463114
24	NC_022593	ATTCA	2	10	36651	36660	40 %	40 %	0 %	20 %	554463114
25	NC_022593	AAATT	2	10	37004	37013	60 %	40 %	0 %	0 %	554463114
26	NC_022593	ATCAA	2	10	37980	37989	60 %	20 %	0 %	20 %	554463115
27	NC_022593	GGATT	2	10	39292	39301	20 %	40 %	40 %	0 %	554463116
28	NC_022593	ATTAT	2	10	39460	39469	40 %	60 %	0 %	0 %	554463116
29	NC_022593	CTTAT	2	10	39653	39662	20 %	60 %	0 %	20 %	554463116
30	NC_022593	TATTG	2	10	41969	41978	20 %	60 %	20 %	0 %	554463118
31	NC_022593	TTTAA	2	10	42102	42111	40 %	60 %	0 %	0 %	554463118
32	NC_022593	TTAAT	2	10	43088	43097	40 %	60 %	0 %	0 %	554463119
33	NC_022593	CAAAA	2	10	44281	44290	80 %	0 %	0 %	20 %	554463120
34	NC_022593	TAGTA	2	10	44559	44568	40 %	40 %	20 %	0 %	554463120
35	NC_022593	GCTTG	2	10	45175	45184	0 %	40 %	40 %	20 %	554463121
36	NC_022593	TCCAT	2	10	45526	45535	20 %	40 %	0 %	40 %	554463121
37	NC_022593	GGCTT	2	10	48303	48312	0 %	40 %	40 %	20 %	554463123
38	NC_022593	AATTA	2	10	48807	48816	60 %	40 %	0 %	0 %	554463124
39	NC_022593	GACTT	2	10	49266	49275	20 %	40 %	20 %	20 %	554463125
40	NC_022593	GTTTT	2	10	49420	49429	0 %	80 %	20 %	0 %	554463125
41	NC_022593	TTTCA	2	10	49463	49472	20 %	60 %	0 %	20 %	554463125
42	NC_022593	AAATT	2	10	51060	51069	60 %	40 %	0 %	0 %	554463126
43	NC_022593	GGTTC	2	10	52482	52491	0 %	40 %	40 %	20 %	554463127
44	NC_022593	CTTTA	2	10	52517	52526	20 %	60 %	0 %	20 %	554463127
45	NC_022593	AATAA	2	10	57154	57163	80 %	20 %	0 %	0 %	554464831
46	NC_022593	AATCA	2	10	58153	58162	60 %	20 %	0 %	20 %	554463131
47	NC_022593	CCATT	2	10	60241	60250	20 %	40 %	0 %	40 %	554463132
48	NC_022593	GAAGT	2	10	60963	60972	40 %	20 %	40 %	0 %	554463133
49	NC_022593	ATGAT	2	10	61977	61986	40 %	40 %	20 %	0 %	554463135
50	NC_022593	ACTGG	2	10	62686	62695	20 %	20 %	40 %	20 %	554463136
51	NC_022593	TGGTT	2	10	62973	62982	0 %	60 %	40 %	0 %	554463136
52	NC_022593	TTTAA	2	10	65987	65996	40 %	60 %	0 %	0 %	554464833
53	NC_022593	GAAAA	2	10	66512	66521	80 %	0 %	20 %	0 %	554464833
54	NC_022593	CCAAT	2	10	66914	66923	40 %	20 %	0 %	40 %	554464834
55	NC_022593	TACAG	2	10	67896	67905	40 %	20 %	20 %	20 %	554464834
56	NC_022593	TCGTA	2	10	68352	68361	20 %	40 %	20 %	20 %	554464835
57	NC_022593	TAAAA	2	10	68633	68642	80 %	20 %	0 %	0 %	554464836
58	NC_022593	TATTT	2	10	68645	68654	20 %	80 %	0 %	0 %	554464836
59	NC_022593	ACTAT	2	10	69074	69083	40 %	40 %	0 %	20 %	554464836
60	NC_022593	TAATA	2	10	70592	70601	60 %	40 %	0 %	0 %	554464838
61	NC_022593	TTTTA	2	10	72174	72183	20 %	80 %	0 %	0 %	554464841
62	NC_022593	ATAAA	2	10	72987	72996	80 %	20 %	0 %	0 %	554464844
63	NC_022593	AATTA	2	10	75536	75545	60 %	40 %	0 %	0 %	554464848
64	NC_022593	TATTT	2	10	76434	76443	20 %	80 %	0 %	0 %	554464848
65	NC_022593	CAAAC	2	10	76541	76550	60 %	0 %	0 %	40 %	554464848
66	NC_022593	TTTTC	2	10	78243	78252	0 %	80 %	0 %	20 %	554464850
67	NC_022593	ATGCT	2	10	78384	78393	20 %	40 %	20 %	20 %	554464850
68	NC_022593	AAGAG	2	10	78873	78882	60 %	0 %	40 %	0 %	554464851
69	NC_022593	CTTTA	2	10	79449	79458	20 %	60 %	0 %	20 %	554464852
70	NC_022593	TCCGG	2	10	80563	80572	0 %	20 %	40 %	40 %	554464853
71	NC_022593	CAAAT	2	10	84360	84369	60 %	20 %	0 %	20 %	554463138
72	NC_022593	AAAAT	2	10	84852	84861	80 %	20 %	0 %	0 %	554464857
73	NC_022593	AGGTT	2	10	85520	85529	20 %	40 %	40 %	0 %	554464858
74	NC_022593	CTCAA	2	10	85609	85618	40 %	20 %	0 %	40 %	554464858
75	NC_022593	GAGTA	2	10	86934	86943	40 %	20 %	40 %	0 %	554464859
76	NC_022593	ATTAT	2	10	89042	89051	40 %	60 %	0 %	0 %	554464862
77	NC_022593	TATGA	2	10	91917	91926	40 %	40 %	20 %	0 %	554464864
78	NC_022593	TTGGT	2	10	91993	92002	0 %	60 %	40 %	0 %	554464865
79	NC_022593	ATAAA	2	10	92370	92379	80 %	20 %	0 %	0 %	554464865
80	NC_022593	ACAAA	2	10	97657	97666	80 %	0 %	0 %	20 %	554464872
81	NC_022593	TTCAA	2	10	97932	97941	40 %	40 %	0 %	20 %	554464872
82	NC_022593	TCACT	2	10	99300	99309	20 %	40 %	0 %	40 %	554464873
83	NC_022593	TTTTA	2	10	100630	100639	20 %	80 %	0 %	0 %	554464875
84	NC_022593	ATTTA	2	10	104957	104966	40 %	60 %	0 %	0 %	554463143
85	NC_022593	TTTTA	2	10	107783	107792	20 %	80 %	0 %	0 %	554463146
86	NC_022593	TCAAG	2	10	112580	112589	40 %	20 %	20 %	20 %	554463152
87	NC_022593	GTTTG	2	10	113218	113227	0 %	60 %	40 %	0 %	554463152
88	NC_022593	TAGCT	2	10	117280	117289	20 %	40 %	20 %	20 %	554463155
89	NC_022593	AGTTG	2	10	117334	117343	20 %	40 %	40 %	0 %	554463155
90	NC_022593	TAAAA	2	10	117455	117464	80 %	20 %	0 %	0 %	554463156
91	NC_022593	CAGGT	2	10	119290	119299	20 %	20 %	40 %	20 %	554463158
92	NC_022593	TCTGG	2	10	119830	119839	0 %	40 %	40 %	20 %	554463158
93	NC_022593	GTTTG	2	10	120883	120892	0 %	60 %	40 %	0 %	554463159
94	NC_022593	TTTAC	2	10	123993	124002	20 %	60 %	0 %	20 %	554463162
95	NC_022593	ACAAT	2	10	124784	124793	60 %	20 %	0 %	20 %	554463162
96	NC_022593	GATTT	2	10	124855	124864	20 %	60 %	20 %	0 %	554463162
97	NC_022593	TTACA	2	10	125832	125841	40 %	40 %	0 %	20 %	554463163
98	NC_022593	CTAAT	2	10	129046	129055	40 %	40 %	0 %	20 %	554464877
99	NC_022593	AATAG	2	10	130094	130103	60 %	20 %	20 %	0 %	554463167
100	NC_022593	TGACC	2	10	130704	130713	20 %	20 %	20 %	40 %	554463167
101	NC_022593	TATTC	2	10	131308	131317	20 %	60 %	0 %	20 %	554463168
102	NC_022593	TTTTA	2	10	132041	132050	20 %	80 %	0 %	0 %	554463169
103	NC_022593	AATGA	2	10	133673	133682	60 %	20 %	20 %	0 %	554463170
104	NC_022593	ATATA	2	10	133990	133999	60 %	40 %	0 %	0 %	554463170
105	NC_022593	AATTG	2	10	135992	136001	40 %	40 %	20 %	0 %	554463171
106	NC_022593	AATCA	2	10	138216	138225	60 %	20 %	0 %	20 %	554464880
107	NC_022593	TCCTT	2	10	139484	139493	0 %	60 %	0 %	40 %	554464881
108	NC_022593	ATTTT	2	10	145052	145061	20 %	80 %	0 %	0 %	554463173
109	NC_022593	CAGCA	2	10	148856	148865	40 %	0 %	20 %	40 %	554464892
110	NC_022593	TTTTA	2	10	149209	149218	20 %	80 %	0 %	0 %	554464893
111	NC_022593	AAAAG	2	10	153760	153769	80 %	0 %	20 %	0 %	554464899
112	NC_022593	TGGTT	2	10	155276	155285	0 %	60 %	40 %	0 %	554464901
113	NC_022593	TTATA	2	10	156355	156364	40 %	60 %	0 %	0 %	554464903
114	NC_022593	GATTC	2	10	156682	156691	20 %	40 %	20 %	20 %	554464903
115	NC_022593	ATCTT	2	10	158598	158607	20 %	60 %	0 %	20 %	554464904
116	NC_022593	GAAAA	2	10	162386	162395	80 %	0 %	20 %	0 %	554464907
117	NC_022593	TATAG	2	10	164757	164766	40 %	40 %	20 %	0 %	554464909
118	NC_022593	TGGAT	2	10	166840	166849	20 %	40 %	40 %	0 %	554463174
119	NC_022593	ATCTT	2	10	168298	168307	20 %	60 %	0 %	20 %	554463175
120	NC_022593	GAAAA	2	10	169749	169758	80 %	0 %	20 %	0 %	554463176
121	NC_022593	CCAAA	2	10	170577	170586	60 %	0 %	0 %	40 %	554463176
122	NC_022593	TGGCT	2	10	171538	171547	0 %	40 %	40 %	20 %	554463178
123	NC_022593	GCCAT	2	10	171738	171747	20 %	20 %	20 %	40 %	554463178
124	NC_022593	CAAAT	2	10	172117	172126	60 %	20 %	0 %	20 %	554463179
125	NC_022593	ATTTT	2	10	176042	176051	20 %	80 %	0 %	0 %	554464913
126	NC_022593	GCTTG	2	10	177088	177097	0 %	40 %	40 %	20 %	554464914
127	NC_022593	TAAAA	2	10	178762	178771	80 %	20 %	0 %	0 %	554463186
128	NC_022593	CGTCG	2	10	182751	182760	0 %	20 %	40 %	40 %	554463192
129	NC_022593	TTCAA	2	10	183780	183789	40 %	40 %	0 %	20 %	554463192
130	NC_022593	ACCAA	2	10	184181	184190	60 %	0 %	0 %	40 %	554463193
131	NC_022593	AGTGA	2	10	186046	186055	40 %	20 %	40 %	0 %	554464915
132	NC_022593	ACAAA	2	10	187136	187145	80 %	0 %	0 %	20 %	554464915
133	NC_022593	AAATT	2	10	187985	187994	60 %	40 %	0 %	0 %	554464915
134	NC_022593	GCAAA	2	10	188207	188216	60 %	0 %	20 %	20 %	554464915
135	NC_022593	AATAC	2	10	188974	188983	60 %	20 %	0 %	20 %	554464915
136	NC_022593	GTAAA	2	10	189467	189476	60 %	20 %	20 %	0 %	554464915
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249	NC_022593	AAAAT	2	10	375401	375410	80 %	20 %	0 %	0 %	554463332
250	NC_022593	GAAAA	2	10	377340	377349	80 %	0 %	20 %	0 %	554463334
251	NC_022593	ACTTT	2	10	377353	377362	20 %	60 %	0 %	20 %	554463334
252	NC_022593	TCCTA	2	10	377641	377650	20 %	40 %	0 %	40 %	554463334
253	NC_022593	TGATT	2	10	378687	378696	20 %	60 %	20 %	0 %	554463335
254	NC_022593	CACTT	2	10	385277	385286	20 %	40 %	0 %	40 %	554463343
255	NC_022593	TGGTT	2	10	386028	386037	0 %	60 %	40 %	0 %	554463343
256	NC_022593	TTTGT	2	10	386758	386767	0 %	80 %	20 %	0 %	554463344
257	NC_022593	TGTAT	2	10	388251	388260	20 %	60 %	20 %	0 %	554463344
258	NC_022593	CTTAT	2	10	390608	390617	20 %	60 %	0 %	20 %	554463346
259	NC_022593	CAAAC	2	10	394887	394896	60 %	0 %	0 %	40 %	554463348
260	NC_022593	AAACT	2	10	395364	395373	60 %	20 %	0 %	20 %	554463348
261	NC_022593	GAAAT	2	10	398164	398173	60 %	20 %	20 %	0 %	554463351
262	NC_022593	TTCAA	2	10	399502	399511	40 %	40 %	0 %	20 %	554463352
263	NC_022593	TGGAA	2	10	405739	405748	40 %	20 %	40 %	0 %	554463356
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