MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium autoethanogenum DSM 10061

Total Repeats: 1010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022592	AAAAT	2	10	1281	1290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022592	GTTTA	2	10	16344	16353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022592	TAATA	2	10	16373	16382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022592	TTAAT	2	10	19129	19138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022592	CCAAT	2	10	32559	32568	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022592	TAGAA	2	10	33600	33609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022592	CTAAT	2	10	41633	41642	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022592	TTATT	2	10	46267	46276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022592	GGTAT	2	10	46479	46488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022592	GTATT	2	10	46543	46552	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022592	GTGGA	2	10	46564	46573	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022592	TAAAA	2	10	50061	50070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022592	GCTTT	2	10	52734	52743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022592	CAGTT	2	10	54225	54234	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022592	ATAAA	2	10	67274	67283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022592	TAATT	3	15	70509	70523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022592	TTACT	2	10	72678	72687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022592	GATTT	2	10	78839	78848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022592	AATTA	2	10	81680	81689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022592	CTTTA	2	10	82097	82106	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022592	ATAGG	2	10	84227	84236	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022592	TGCAT	2	10	87063	87072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022592	CTATA	2	10	105489	105498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022592	TAATA	2	10	113662	113671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022592	ATAAA	2	10	126863	126872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022592	TGTAA	2	10	129261	129270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022592	TAATT	2	10	131760	131769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022592	ACAAA	2	10	136961	136970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022592	TTAAA	2	10	143916	143925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022592	TAAAT	2	10	150295	150304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022592	TGAAA	2	10	150337	150346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022592	ATTTA	2	10	151557	151566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022592	TTAAA	2	10	159309	159318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022592	TTTTA	2	10	162052	162061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022592	ATATT	2	10	162134	162143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022592	TTAAA	2	10	162148	162157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022592	TTTAA	2	10	163934	163943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022592	TAAAT	2	10	172129	172138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022592	TACAT	2	10	176892	176901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022592	TAAAA	2	10	187984	187993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022592	TACAA	2	10	192054	192063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022592	GTAAA	2	10	192259	192268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022592	TTAAA	2	10	192636	192645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022592	ATATA	2	10	192858	192867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022592	TATCC	2	10	200346	200355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022592	TTATA	2	10	203270	203279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022592	AATAT	2	10	204840	204849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022592	TATAA	2	10	206474	206483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022592	ATTAG	2	10	210213	210222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022592	TTTAT	2	10	229778	229787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022592	TTAAA	2	10	241320	241329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022592	ATTCA	2	10	242061	242070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022592	TTAGT	2	10	243601	243610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022592	AATTT	2	10	243786	243795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022592	AATAT	2	10	249322	249331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022592	TAAAT	2	10	253453	253462	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022592	AGATG	2	10	261723	261732	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022592	TATTT	2	10	269380	269389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022592	AATTT	2	10	274442	274451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022592	TATAT	2	10	285930	285939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022592	TTTAA	2	10	287900	287909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022592	ACTCT	2	10	289932	289941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022592	TATTT	2	10	293036	293045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022592	ATAAA	2	10	301870	301879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022592	ATTTT	2	10	306519	306528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022592	ATTTT	2	10	307011	307020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022592	TTTAA	2	10	317180	317189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022592	AATTA	2	10	324564	324573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022592	AATAA	2	10	330052	330061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022592	CATAA	2	10	332750	332759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022592	AATAT	2	10	336579	336588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022592	TATAT	2	10	338331	338340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022592	TAGAC	2	10	339525	339534	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022592	TAATA	2	10	357234	357243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022592	AATTA	3	15	360952	360966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022592	ATTTT	2	10	370480	370489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022592	ATTTT	2	10	372620	372629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022592	ACTAA	2	10	372909	372918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022592	TAAAT	2	10	375231	375240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022592	TTAGG	2	10	375899	375908	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022592	AATTT	2	10	388399	388408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022592	TAATA	2	10	425461	425470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022592	TTAAT	2	10	437468	437477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022592	TATAT	2	10	440186	440195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022592	ATCAT	2	10	443979	443988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022592	GAATT	2	10	444111	444120	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022592	TAATA	2	10	444708	444717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022592	TGAGG	2	10	444743	444752	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022592	GGTAT	2	10	445463	445472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022592	ATACC	2	10	445486	445495	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_022592	AATAA	2	10	446739	446748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022592	TTTAT	2	10	474988	474997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022592	ATCTA	2	10	475000	475009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022592	AGTTG	2	10	497190	497199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022592	TTAAG	2	10	498845	498854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022592	ATATT	2	10	498897	498906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022592	ATATA	2	10	498935	498944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022592	ATTCA	2	10	502807	502816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022592	ATCAA	2	10	526798	526807	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022592	CTCTA	2	10	526889	526898	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_022592	TAAAT	2	10	536997	537006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022592	ATTAT	2	10	539842	539851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022592	TAAAT	2	10	541232	541241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022592	TCTTA	2	10	541401	541410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022592	CAAAT	2	10	541458	541467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022592	ATTTA	2	10	542944	542953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022592	AAACA	2	10	552659	552668	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022592	TTAAT	2	10	552680	552689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022592	ATTTA	2	10	553078	553087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022592	ATATT	2	10	558727	558736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022592	ATTTA	2	10	559050	559059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022592	TACCA	2	10	562898	562907	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_022592	ATTAA	2	10	573803	573812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022592	TTATT	2	10	574007	574016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022592	TTAAC	2	10	574050	574059	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022592	ACTTT	2	10	576516	576525	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022592	TTCTT	2	10	580188	580197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022592	TATAA	2	10	587099	587108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022592	TAAAA	2	10	588948	588957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022592	TAATT	2	10	597066	597075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022592	ATTAA	2	10	599094	599103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022592	TTATA	2	10	602046	602055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022592	ATCAT	2	10	605786	605795	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022592	ATTTA	2	10	609686	609695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022592	ATATT	2	10	617685	617694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022592	ATTCA	2	10	623384	623393	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022592	TTTTA	2	10	625781	625790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022592	TATAA	2	10	638118	638127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022592	AAAAT	2	10	641083	641092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022592	GAACT	2	10	646497	646506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022592	CTTTA	2	10	653592	653601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022592	TAAAT	2	10	666876	666885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022592	TAATA	2	10	666939	666948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022592	TAAAA	2	10	671988	671997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022592	TTATA	2	10	672240	672249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022592	AAAGA	2	10	673141	673150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022592	TTTAT	2	10	674393	674402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022592	TAATA	2	10	686366	686375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022592	ACATA	2	10	686749	686758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022592	AATTA	2	10	686852	686861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022592	TCCTA	2	10	688516	688525	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_022592	ATTCT	2	10	690520	690529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022592	TTTAA	2	10	692906	692915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022592	ATTAT	3	15	703398	703412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022592	TTTTA	2	10	710788	710797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022592	CTTAA	2	10	717508	717517	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022592	AATTA	2	10	724313	724322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022592	AATTT	2	10	725197	725206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022592	TTATA	2	10	730098	730107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022592	ATTAT	2	10	738853	738862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022592	ACAAT	2	10	738881	738890	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_022592	ATTAT	2	10	738897	738906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022592	ACAAT	2	10	738925	738934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_022592	TATAT	2	10	738944	738953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_022592	TAAAA	2	10	794023	794032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022592	ATATA	2	10	799000	799009	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_022592	TATAC	2	10	812833	812842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_022592	TTTAC	2	10	876408	876417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_022592	TATAA	2	10	883735	883744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_022592	ATATT	2	10	1853601	1853610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_022592	TCTTT	2	10	1854219	1854228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_022592	ATTAT	2	10	1887281	1887290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022592	TAAAA	2	10	1887374	1887383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_022592	CCTTT	2	10	1910104	1910113	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
448	NC_022592	CACTT	2	10	1913125	1913134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
449	NC_022592	ATTTA	2	10	1913179	1913188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_022592	CTTTT	2	10	1913194	1913203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_022592	TATTT	2	10	1926167	1926176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022592	TATAA	2	10	1926203	1926212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_022592	ATATA	2	10	1930754	1930763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022592	AATTC	2	10	1931136	1931145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_022592	TAAAA	2	10	1936142	1936151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_022592	AATAA	2	10	1940635	1940644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_022592	ATTTT	2	10	1942975	1942984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_022592	AATAT	2	10	1943022	1943031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_022592	TTTTG	2	10	1952005	1952014	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
460	NC_022592	GCTTT	2	10	1953722	1953731	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
461	NC_022592	ATATA	3	15	1953896	1953910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_022592	ATTTA	2	10	1956111	1956120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_022592	TCTCC	2	10	1956907	1956916	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
464	NC_022592	TTTTA	2	10	1964807	1964816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_022592	ATCAA	2	10	1964935	1964944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
466	NC_022592	CCTTT	2	10	1970656	1970665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
467	NC_022592	ATTTT	2	10	1976680	1976689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_022592	TTTTA	2	10	1980220	1980229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_022592	ACATT	2	10	1987075	1987084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_022592	TAAAA	2	10	1992440	1992449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_022592	TATAA	2	10	1993130	1993139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_022592	TTTAA	2	10	1993159	1993168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_022592	TTTTA	2	10	1994726	1994735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_022592	TACTT	2	10	2001313	2001322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
475	NC_022592	TATTG	2	10	2004409	2004418	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
476	NC_022592	CCGAA	2	10	2004495	2004504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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480	NC_022592	AACTT	2	10	2019401	2019410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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483	NC_022592	GTTTA	2	10	2024438	2024447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_022592	TATTT	2	10	2035518	2035527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_022592	AATTA	2	10	2039732	2039741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_022592	TTATT	2	10	2053968	2053977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_022592	AATTT	2	10	2058232	2058241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_022592	TTTTA	2	10	2058428	2058437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_022592	TTAAA	2	10	2067271	2067280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_022592	TTTTA	2	10	2078812	2078821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_022592	TTAAA	2	10	2091449	2091458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_022592	ATCTT	2	10	2114269	2114278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
494	NC_022592	ACTTA	2	10	2115988	2115997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
495	NC_022592	CTCCC	2	10	2116513	2116522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
496	NC_022592	TTATA	2	10	2117128	2117137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_022592	CTTTA	2	10	2117145	2117154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
498	NC_022592	CACGA	2	10	2117788	2117797	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
499	NC_022592	TCTCC	2	10	2118197	2118206	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
500	NC_022592	TTCTC	2	10	2119253	2119262	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

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