MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of strain 284/09 Stolbur phytoplasma draft

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022588	AACTT	2	10	115	124	40 %	40 %	0 %	20 %	554085531
2	NC_022588	ATAAA	2	10	409	418	80 %	20 %	0 %	0 %	554085531
3	NC_022588	AAATT	2	10	955	964	60 %	40 %	0 %	0 %	554085531
4	NC_022588	TTAAA	2	10	2348	2357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022588	AACTT	2	10	3159	3168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022588	ATTTT	2	10	3405	3414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022588	TGGAT	2	10	4343	4352	20 %	40 %	40 %	0 %	554085533
8	NC_022588	AAATC	2	10	4499	4508	60 %	20 %	0 %	20 %	554085533
9	NC_022588	TCGCA	2	10	4575	4584	20 %	20 %	20 %	40 %	554085533
10	NC_022588	TGTTT	2	10	8680	8689	0 %	80 %	20 %	0 %	554085536
11	NC_022588	TTTTG	2	10	8921	8930	0 %	80 %	20 %	0 %	554085536
12	NC_022588	AGTAT	2	10	9225	9234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022588	AACAC	2	10	9689	9698	60 %	0 %	0 %	40 %	554085537
14	NC_022588	AACAC	2	10	9719	9728	60 %	0 %	0 %	40 %	554085537
15	NC_022588	AATAT	2	10	10451	10460	60 %	40 %	0 %	0 %	554085538
16	NC_022588	AACAA	2	10	12080	12089	80 %	0 %	0 %	20 %	554085540
17	NC_022588	TTTTG	2	10	12625	12634	0 %	80 %	20 %	0 %	554085541
18	NC_022588	AGAAT	2	10	12887	12896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022588	TTCTT	2	10	13318	13327	0 %	80 %	0 %	20 %	554085543
20	NC_022588	AAATT	2	10	13539	13548	60 %	40 %	0 %	0 %	554085543
21	NC_022588	TCATG	2	10	14150	14159	20 %	40 %	20 %	20 %	554085544
22	NC_022588	AAAAT	2	10	14613	14622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022588	ATTTT	2	10	15084	15093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022588	TTATT	2	10	16087	16096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022588	TAAAA	2	10	16363	16372	80 %	20 %	0 %	0 %	554085547
26	NC_022588	TATAA	2	10	16411	16420	60 %	40 %	0 %	0 %	554085547
27	NC_022588	ATTTT	2	10	18925	18934	20 %	80 %	0 %	0 %	554085550
28	NC_022588	AAATT	2	10	19053	19062	60 %	40 %	0 %	0 %	554085550
29	NC_022588	TTTAG	2	10	19599	19608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022588	TAATT	2	10	20360	20369	40 %	60 %	0 %	0 %	554085551
31	NC_022588	TATTT	2	10	21008	21017	20 %	80 %	0 %	0 %	554085553
32	NC_022588	TGTTT	2	10	21929	21938	0 %	80 %	20 %	0 %	554085555
33	NC_022588	ATGAA	2	10	22537	22546	60 %	20 %	20 %	0 %	554085556
34	NC_022588	AAGTA	2	10	25381	25390	60 %	20 %	20 %	0 %	554085557
35	NC_022588	AAAAT	2	10	28062	28071	80 %	20 %	0 %	0 %	554085560
36	NC_022588	AATTC	2	10	29376	29385	40 %	40 %	0 %	20 %	554085561
37	NC_022588	TAATT	2	10	29894	29903	40 %	60 %	0 %	0 %	554085561
38	NC_022588	GATAT	2	10	30487	30496	40 %	40 %	20 %	0 %	554085561
39	NC_022588	TTTAA	2	10	31900	31909	40 %	60 %	0 %	0 %	554085562
40	NC_022588	TTTAA	2	10	33381	33390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022588	TTTGT	2	10	34711	34720	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022588	TGTTT	2	10	35413	35422	0 %	80 %	20 %	0 %	554085564
43	NC_022588	ATTAA	2	10	35987	35996	60 %	40 %	0 %	0 %	554085564
44	NC_022588	GTTTG	2	10	36162	36171	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022588	TTTTA	2	10	36487	36496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022588	TTAAT	2	10	36725	36734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022588	AAACT	2	10	37335	37344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022588	CAAAT	2	10	38098	38107	60 %	20 %	0 %	20 %	554085565
49	NC_022588	AAGAC	2	10	38200	38209	60 %	0 %	20 %	20 %	554085565
50	NC_022588	TTCAA	2	10	41020	41029	40 %	40 %	0 %	20 %	554085566
51	NC_022588	TTAAT	2	10	41981	41990	40 %	60 %	0 %	0 %	554085567
52	NC_022588	CTTTA	2	10	42831	42840	20 %	60 %	0 %	20 %	554085568
53	NC_022588	CTTTT	2	10	43593	43602	0 %	80 %	0 %	20 %	554085568
54	NC_022588	ACTTT	2	10	43846	43855	20 %	60 %	0 %	20 %	554085568
55	NC_022588	TTGGT	2	10	44808	44817	0 %	60 %	40 %	0 %	554085569
56	NC_022588	GATTT	2	10	45355	45364	20 %	60 %	20 %	0 %	554085569
57	NC_022588	TTTAA	2	10	46240	46249	40 %	60 %	0 %	0 %	554085570
58	NC_022588	CAAAA	2	10	47168	47177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022588	ATTCC	2	10	50185	50194	20 %	40 %	0 %	40 %	554085575
60	NC_022588	TAAAC	2	10	51844	51853	60 %	20 %	0 %	20 %	554085577
61	NC_022588	ATAAA	2	10	52041	52050	80 %	20 %	0 %	0 %	554085577
62	NC_022588	GTTTG	2	10	52570	52579	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022588	TTAAT	2	10	52689	52698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022588	TGGCT	2	10	53429	53438	0 %	40 %	40 %	20 %	554085578
65	NC_022588	GTGAT	2	10	55281	55290	20 %	40 %	40 %	0 %	554085580
66	NC_022588	AATTA	2	10	55810	55819	60 %	40 %	0 %	0 %	554085580
67	NC_022588	TAAAA	2	10	59966	59975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022588	CTTCA	2	10	60701	60710	20 %	40 %	0 %	40 %	554085585
69	NC_022588	GCATT	2	10	62793	62802	20 %	40 %	20 %	20 %	554085587
70	NC_022588	TAAAA	2	10	62914	62923	80 %	20 %	0 %	0 %	554085587
71	NC_022588	ATTTT	2	10	64109	64118	20 %	80 %	0 %	0 %	554085589
72	NC_022588	AAAAT	2	10	65525	65534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022588	AATAA	2	10	66642	66651	80 %	20 %	0 %	0 %	554085592
74	NC_022588	TAAAA	2	10	67517	67526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022588	GAAAA	2	10	68132	68141	80 %	0 %	20 %	0 %	554085593
76	NC_022588	CTTTT	2	10	70226	70235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022588	TAAAA	2	10	71762	71771	80 %	20 %	0 %	0 %	554085599
78	NC_022588	ACCAA	2	10	72446	72455	60 %	0 %	0 %	40 %	554085600
79	NC_022588	TAAAT	2	10	72555	72564	60 %	40 %	0 %	0 %	554085600
80	NC_022588	ATAAA	2	10	74685	74694	80 %	20 %	0 %	0 %	554085600
81	NC_022588	TTATT	2	10	75709	75718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022588	ATAAA	2	10	78348	78357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022588	TATTT	2	10	79905	79914	20 %	80 %	0 %	0 %	554085604
84	NC_022588	TAATT	2	10	80673	80682	40 %	60 %	0 %	0 %	554085604
85	NC_022588	ATATT	2	10	80688	80697	40 %	60 %	0 %	0 %	554085604
86	NC_022588	TAATA	2	10	81230	81239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022588	TAAAA	2	10	81683	81692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022588	TTAAT	2	10	81873	81882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022588	ACAAA	2	10	83416	83425	80 %	0 %	0 %	20 %	554085605
90	NC_022588	AATTG	2	10	86088	86097	40 %	40 %	20 %	0 %	554085607
91	NC_022588	ATTTT	2	10	87219	87228	20 %	80 %	0 %	0 %	554085607
92	NC_022588	TGATA	2	10	87565	87574	40 %	40 %	20 %	0 %	554085607
93	NC_022588	TTAAA	2	10	88168	88177	60 %	40 %	0 %	0 %	554085607
94	NC_022588	AATTC	2	10	88425	88434	40 %	40 %	0 %	20 %	554085607
95	NC_022588	TAAAA	2	10	88696	88705	80 %	20 %	0 %	0 %	554085607
96	NC_022588	TAAAA	2	10	88958	88967	80 %	20 %	0 %	0 %	554085607
97	NC_022588	ATAAA	2	10	89522	89531	80 %	20 %	0 %	0 %	554085607
98	NC_022588	AGATA	2	10	92916	92925	60 %	20 %	20 %	0 %	554085610
99	NC_022588	AAGTA	2	10	95592	95601	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022588	ATTAT	2	10	97026	97035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022588	TCAAC	2	10	97965	97974	40 %	20 %	0 %	40 %	554085615
102	NC_022588	TCCCT	2	10	98164	98173	0 %	40 %	0 %	60 %	554085615
103	NC_022588	TTTAG	2	10	98391	98400	20 %	60 %	20 %	0 %	554085615
104	NC_022588	TAAAT	2	10	98531	98540	60 %	40 %	0 %	0 %	554085615
105	NC_022588	TAAAA	2	10	98992	99001	80 %	20 %	0 %	0 %	554085615
106	NC_022588	AAGCA	2	10	99245	99254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022588	GTTTT	2	10	103584	103593	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022588	GGTTC	2	10	103989	103998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022588	CAAAA	2	10	105853	105862	80 %	0 %	0 %	20 %	554085619
110	NC_022588	ATTTC	2	10	107289	107298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022588	TAAAT	2	10	108015	108024	60 %	40 %	0 %	0 %	554085620
112	NC_022588	TTATT	2	10	108452	108461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022588	CTTAA	2	10	108504	108513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022588	TTTGA	2	10	108749	108758	20 %	60 %	20 %	0 %	554085621
115	NC_022588	TTAAT	2	10	109552	109561	40 %	60 %	0 %	0 %	554085621
116	NC_022588	GTTTT	2	10	110295	110304	0 %	80 %	20 %	0 %	554085621
117	NC_022588	TCTTG	2	10	110417	110426	0 %	60 %	20 %	20 %	554085621
118	NC_022588	AATTA	2	10	110958	110967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022588	TCCAC	2	10	113757	113766	20 %	20 %	0 %	60 %	554085624
120	NC_022588	ATAAA	2	10	113778	113787	80 %	20 %	0 %	0 %	554085624
121	NC_022588	AATAA	2	10	114350	114359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022588	ATTTA	2	10	115153	115162	40 %	60 %	0 %	0 %	554085625
123	NC_022588	ATTTT	2	10	116846	116855	20 %	80 %	0 %	0 %	554085627
124	NC_022588	AAAAG	2	10	117427	117436	80 %	0 %	20 %	0 %	554085627
125	NC_022588	ATTTG	2	10	118790	118799	20 %	60 %	20 %	0 %	554085628
126	NC_022588	AATTT	2	10	119104	119113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022588	AAAAC	2	10	119588	119597	80 %	0 %	0 %	20 %	554085629
128	NC_022588	AATAA	2	10	120417	120426	80 %	20 %	0 %	0 %	554085629
129	NC_022588	TAATA	2	10	122102	122111	60 %	40 %	0 %	0 %	554085630
130	NC_022588	AACTA	2	10	123113	123122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022588	ATTAT	2	10	123380	123389	40 %	60 %	0 %	0 %	554085631
132	NC_022588	ACAAA	2	10	124067	124076	80 %	0 %	0 %	20 %	554085632
133	NC_022588	AGAAA	2	10	125573	125582	80 %	0 %	20 %	0 %	554085634
134	NC_022588	TTTAA	2	10	125774	125783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022588	ACCCA	2	10	126271	126280	40 %	0 %	0 %	60 %	554085635
136	NC_022588	ATCAA	2	10	126822	126831	60 %	20 %	0 %	20 %	554085635
137	NC_022588	TTTTA	2	10	127098	127107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022588	ATAAA	2	10	129506	129515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022588	TAAAA	2	10	129551	129560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022588	TTTTC	2	10	129832	129841	0 %	80 %	0 %	20 %	554085640
141	NC_022588	AAATA	2	10	131211	131220	80 %	20 %	0 %	0 %	554085641
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262	NC_022588	AAATA	2	10	241396	241405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_022588	AATTA	2	10	241428	241437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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