MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of strain 284/09 Stolbur phytoplasma draft

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022588	ATGA	2	8	2131	2138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022588	ATTA	2	8	2188	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022588	TTAG	2	8	2285	2292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022588	AAAT	2	8	3026	3033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022588	TAAA	2	8	4800	4807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022588	ACAA	2	8	4827	4834	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022588	ATAA	2	8	6414	6421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022588	AATT	2	8	10285	10292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022588	TAAT	2	8	10869	10876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022588	ACTA	2	8	11512	11519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022588	AATT	2	8	14491	14498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022588	TTAG	2	8	14603	14610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022588	TAGG	2	8	15158	15165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022588	ATTT	2	8	15531	15538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022588	TAGT	2	8	15913	15920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022588	TAAA	2	8	16136	16143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022588	ATTT	2	8	16284	16291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022588	TAAC	2	8	16321	16328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022588	TTTA	2	8	17760	17767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022588	ACTA	2	8	17830	17837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022588	TAGA	2	8	18055	18062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022588	ACAA	2	8	18377	18384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022588	ATCT	2	8	18661	18668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022588	TGTT	2	8	19640	19647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022588	ATAA	2	8	26828	26835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022588	ATTT	2	8	27637	27644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022588	GGAA	2	8	28042	28049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022588	GTTT	2	8	31576	31583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022588	AATA	2	8	31595	31602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022588	CATT	2	8	33695	33702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022588	GTTA	2	8	33957	33964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022588	AGAT	2	8	34054	34061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022588	ATTA	2	8	34232	34239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022588	AGTA	2	8	34242	34249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022588	TTTG	2	8	34595	34602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022588	AATT	2	8	34696	34703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022588	AGTT	2	8	36100	36107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022588	GAGG	2	8	36292	36299	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022588	TTTC	2	8	36688	36695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022588	ACTG	2	8	36792	36799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022588	ACTA	2	8	36912	36919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022588	TTAT	2	8	37031	37038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022588	AGAA	2	8	42239	42246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022588	GGTA	2	8	44148	44155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022588	TTAT	2	8	44204	44211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022588	ATTA	2	8	44263	44270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022588	AGAA	2	8	45412	45419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022588	TGAT	2	8	46301	46308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022588	ACTA	2	8	46320	46327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022588	ACAA	2	8	49270	49277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022588	TCAA	2	8	49280	49287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022588	TAAA	2	8	52306	52313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022588	TAAA	2	8	52325	52332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022588	AAAC	2	8	52333	52340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022588	TAAC	2	8	57770	57777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022588	GACT	2	8	57785	57792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022588	ATGA	2	8	57838	57845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022588	TAAC	2	8	57864	57871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022588	TATC	2	8	57928	57935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022588	TAAT	2	8	58449	58456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022588	ACCT	2	8	60331	60338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022588	TTAA	2	8	60591	60598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022588	AAGG	2	8	63019	63026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022588	GAAA	2	8	63469	63476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022588	AAAT	2	8	63612	63619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022588	TAAA	2	8	65425	65432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022588	TATT	2	8	65567	65574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022588	AATA	2	8	65612	65619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022588	TAAA	2	8	65700	65707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022588	ATTT	2	8	67391	67398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022588	TAGA	2	8	67798	67805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022588	AAAT	2	8	70320	70327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022588	ATTG	2	8	74810	74817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022588	CTTT	2	8	75560	75567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022588	TGGG	2	8	75738	75745	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022588	TATT	2	8	75816	75823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022588	AAAT	2	8	75933	75940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022588	ATTT	2	8	75988	75995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022588	AATT	2	8	76140	76147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022588	TTTA	2	8	76250	76257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022588	TTTG	2	8	76320	76327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022588	TTTA	2	8	77764	77771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022588	ATTA	2	8	78114	78121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022588	ATTT	2	8	78284	78291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022588	ATTT	2	8	81117	81124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022588	TATC	2	8	81564	81571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022588	ATTT	2	8	81716	81723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022588	AAAT	2	8	81926	81933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022588	GAAA	2	8	81970	81977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022588	TTCA	2	8	84778	84785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022588	CAAA	2	8	84922	84929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022588	TTTA	2	8	84951	84958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022588	TAAA	2	8	84959	84966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022588	GGTC	2	8	89888	89895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022588	TACT	2	8	90813	90820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022588	ATAG	2	8	90923	90930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022588	TTCT	2	8	94960	94967	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022588	TATT	2	8	95092	95099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022588	AATT	2	8	95603	95610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022588	GACA	2	8	95680	95687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022588	TATC	2	8	95801	95808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_022588	CTAT	2	8	96977	96984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022588	TTGT	2	8	97103	97110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022588	TGTT	2	8	99267	99274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022588	AAAC	2	8	104151	104158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022588	AAGA	2	8	105554	105561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022588	AGCA	2	8	106881	106888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022588	ATTA	2	8	106985	106992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022588	ATTT	2	8	107089	107096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022588	TTAT	2	8	107481	107488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022588	TACA	2	8	107506	107513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022588	AATT	2	8	107557	107564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022588	ATTA	2	8	108397	108404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022588	TTAT	2	8	110997	111004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022588	TGTT	2	8	111141	111148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022588	TGAA	2	8	111214	111221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022588	CAAA	2	8	111413	111420	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022588	AGAA	2	8	111701	111708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022588	GCAA	2	8	111724	111731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022588	TTTA	2	8	112087	112094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022588	TGGT	2	8	113501	113508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022588	TAAA	2	8	114444	114451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022588	ATTA	2	8	114656	114663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022588	AATT	2	8	116143	116150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022588	ATTT	2	8	116155	116162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022588	ATTA	2	8	121605	121612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022588	TAAA	2	8	121734	121741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022588	ATAA	2	8	121802	121809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022588	AACA	2	8	123606	123613	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022588	TAAA	2	8	124213	124220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022588	CAAA	2	8	124276	124283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022588	TTAA	2	8	125109	125116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022588	CACG	2	8	125813	125820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022588	ACAA	3	12	125845	125856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022588	AAAG	2	8	125865	125872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022588	TTTC	2	8	127975	127982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022588	TAAT	2	8	127992	127999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022588	AAAT	2	8	131728	131735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022588	CTTT	2	8	131790	131797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022588	ATAA	2	8	132002	132009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022588	AAAC	3	12	132051	132062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022588	GAAA	2	8	132421	132428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022588	ATTA	2	8	136674	136681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022588	AACT	2	8	136734	136741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022588	ACTA	2	8	136775	136782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022588	TAAA	2	8	136812	136819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022588	TTAA	2	8	136836	136843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022588	AAAT	2	8	136995	137002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022588	GTTT	2	8	137115	137122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022588	CGTG	2	8	137184	137191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022588	TTAT	2	8	137633	137640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022588	AAAT	2	8	137713	137720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022588	TAAT	2	8	143622	143629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022588	AAAG	2	8	143659	143666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022588	ATTA	2	8	143725	143732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.