MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus sp. I-G2

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022584	GATCG	2	10	7962	7971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022584	TAAAT	2	10	27017	27026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022584	ATAAA	2	10	27090	27099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022584	TATAA	2	10	31725	31734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022584	ATGAA	2	10	34267	34276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022584	ATAAA	2	10	55302	55311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022584	TTATT	2	10	58727	58736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022584	GTTTC	2	10	73985	73994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022584	TTGAT	2	10	77001	77010	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022584	GTTTT	2	10	78089	78098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022584	AGATT	2	10	81269	81278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022584	AGGTT	2	10	81290	81299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022584	AATGA	2	10	92774	92783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022584	GGAAA	2	10	92826	92835	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022584	AATTA	2	10	93882	93891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022584	GTCAT	2	10	94046	94055	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022584	GAAAT	2	10	97826	97835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022584	CAAGG	2	10	101846	101855	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022584	TTTTA	2	10	128196	128205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022584	ATAAA	2	10	153421	153430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022584	AGCTA	2	10	153447	153456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022584	ATAAA	2	10	156970	156979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022584	TTAAA	2	10	167910	167919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022584	GATTT	2	10	168263	168272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022584	CGTCT	2	10	169848	169857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022584	CAAAA	2	10	184500	184509	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022584	AATAG	2	10	201340	201349	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022584	AAGGA	2	10	206264	206273	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022584	TAGAA	2	10	228143	228152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022584	CCGAG	2	10	232009	232018	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022584	CCGAG	2	10	232107	232116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_022584	AAGAA	2	10	245579	245588	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022584	ATATA	2	10	245824	245833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022584	CTTAC	2	10	259771	259780	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022584	TAGAA	2	10	259799	259808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022584	ACTTG	2	10	270743	270752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022584	TTATT	2	10	274819	274828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022584	TCAAA	2	10	298239	298248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022584	TTAGG	2	10	300617	300626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022584	GAAAA	2	10	341958	341967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022584	TAATA	2	10	355494	355503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022584	TATTT	2	10	362326	362335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022584	TGGAA	2	10	367919	367928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022584	GAAAA	2	10	369043	369052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022584	GCATT	2	10	386599	386608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022584	AGATA	2	10	387299	387308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022584	ACTGA	2	10	387546	387555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022584	TTTTA	2	10	403220	403229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022584	ATAGA	2	10	408181	408190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022584	TTTAA	2	10	417684	417693	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022584	GAAAT	2	10	422747	422756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022584	TATTT	2	10	423323	423332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022584	TTTAT	2	10	434794	434803	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022584	GCTCT	2	10	447150	447159	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_022584	CGATT	2	10	447766	447775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022584	TCTTT	2	10	448417	448426	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022584	ATAAA	2	10	467493	467502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022584	AATAG	2	10	467581	467590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022584	TTATG	2	10	480288	480297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022584	ATTAT	2	10	488950	488959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022584	GATTC	2	10	494407	494416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022584	CCAAT	2	10	494508	494517	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022584	GAAAG	2	10	496199	496208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022584	AAATA	2	10	510593	510602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022584	ATGGT	2	10	542866	542875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022584	ATCTA	2	10	544336	544345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022584	AATCA	2	10	552317	552326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022584	TGTAA	2	10	552417	552426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022584	AAAAG	2	10	558296	558305	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022584	GATTT	2	10	559263	559272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022584	TGATA	2	10	565217	565226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022584	AAAGA	2	10	566279	566288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022584	TATCT	2	10	566813	566822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022584	CTTTG	2	10	566858	566867	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022584	ATATT	2	10	568050	568059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022584	GTCTT	2	10	572063	572072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022584	ATTTT	2	10	587572	587581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022584	TTCTA	2	10	599435	599444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022584	CAAAA	2	10	606902	606911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022584	GTCTC	2	10	615132	615141	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022584	TAAAT	2	10	622564	622573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022584	AGAGC	2	10	624396	624405	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022584	TAAAA	2	10	627753	627762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022584	TGCTA	2	10	628457	628466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022584	AATCA	2	10	628540	628549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022584	AATTT	2	10	628606	628615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022584	TATAA	2	10	631141	631150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022584	AGATA	2	10	631277	631286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022584	ATTTA	2	10	634634	634643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022584	CTTTT	2	10	660191	660200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022584	CTTTC	2	10	673352	673361	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022584	CATTT	2	10	677493	677502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022584	TATTT	2	10	705039	705048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022584	TAACT	2	10	714834	714843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022584	TTAAC	2	10	714916	714925	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022584	AAAGT	2	10	716573	716582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022584	ATTTC	2	10	719894	719903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022584	TCAAA	2	10	742667	742676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022584	TTATC	2	10	747753	747762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022584	TATTT	2	10	755871	755880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022584	AAAAG	2	10	761126	761135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022584	GAAAC	2	10	771167	771176	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022584	AACTT	2	10	771261	771270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022584	TTCTA	2	10	773731	773740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022584	AATTA	2	10	792220	792229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022584	TAATT	2	10	792239	792248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022584	TAAAG	2	10	809012	809021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022584	CAAAG	2	10	809045	809054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022584	TAGAA	2	10	815457	815466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022584	TGTCT	2	10	818563	818572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022584	TCATC	2	10	818625	818634	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022584	ATCAG	2	10	858950	858959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022584	TAAGA	2	10	867718	867727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022584	TTCCT	2	10	868709	868718	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022584	CTTTC	2	10	893347	893356	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_022584	CTTTT	2	10	945017	945026	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022584	TCTTA	2	10	958052	958061	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022584	CTTTT	2	10	966620	966629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022584	AATGA	2	10	969568	969577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022584	TCGTT	2	10	986737	986746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022584	TTATT	2	10	988049	988058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022584	AAAGG	2	10	992624	992633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022584	ATCAT	2	10	994975	994984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022584	AAGCC	2	10	996883	996892	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_022584	AATCG	2	10	1000368	1000377	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022584	CCCTG	2	10	1000736	1000745	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_022584	TTAAC	2	10	1001455	1001464	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022584	TTATT	2	10	1010479	1010488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022584	TAGAA	2	10	1014510	1014519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022584	ATTTT	2	10	1020949	1020958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022584	CTTTT	2	10	1024172	1024181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022584	AAAGA	2	10	1038182	1038191	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022584	AAGAA	2	10	1039926	1039935	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022584	ACAAT	2	10	1049194	1049203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022584	ACAAA	2	10	1049345	1049354	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022584	TTCTA	2	10	1062074	1062083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022584	GTTTG	2	10	1069037	1069046	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022584	TTATA	2	10	1074631	1074640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022584	ATTCA	2	10	1080689	1080698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022584	CATTT	2	10	1082318	1082327	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022584	AATTC	2	10	1116949	1116958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022584	TCTAT	2	10	1116962	1116971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022584	AAACC	2	10	1117048	1117057	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_022584	AAAAC	2	10	1129885	1129894	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022584	TAAAA	2	10	1138246	1138255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022584	AAAGT	2	10	1138458	1138467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022584	CTGTT	2	10	1150141	1150150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_022584	TCTTT	2	10	1400802	1400811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_022584	AGGGA	2	10	1992224	1992233	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.