MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesoplasma florum W37

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022583	TTTTA	2	10	1510	1519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022583	TAATT	2	10	12461	12470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022583	AAAAG	2	10	16669	16678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022583	TCTAT	2	10	25533	25542	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022583	ACAAA	2	10	37357	37366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022583	TTTAT	2	10	37722	37731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022583	ATAAC	2	10	37863	37872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022583	ATTTT	2	10	52487	52496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022583	TTAAT	2	10	68150	68159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022583	ATCTA	2	10	117703	117712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022583	ATATT	2	10	117733	117742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022583	ATTAT	2	10	129938	129947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022583	GAAAG	2	10	132863	132872	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022583	ATTTT	2	10	135191	135200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022583	AATAG	2	10	147891	147900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022583	AATAT	2	10	150408	150417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022583	ATATA	2	10	161352	161361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022583	AAAAC	2	10	195168	195177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022583	ATCTA	2	10	195543	195552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022583	AAAAC	2	10	196970	196979	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022583	GAAAA	2	10	197382	197391	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022583	AAATA	2	10	209533	209542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022583	AAGTG	2	10	221259	221268	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022583	ATTAA	2	10	224824	224833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022583	ATAAA	2	10	232768	232777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022583	AAAAT	2	10	243600	243609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022583	TAAAA	2	10	244731	244740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022583	ACCAC	2	10	246326	246335	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_022583	CTTTT	2	10	254518	254527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022583	TTTTA	2	10	255526	255535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022583	ATTTT	2	10	271692	271701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022583	ATTAT	2	10	286108	286117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022583	GTAAA	2	10	289000	289009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022583	AAATT	2	10	293508	293517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022583	AAAGG	2	10	295083	295092	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022583	AGGAA	2	10	297596	297605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022583	AATCA	2	10	320264	320273	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022583	TTTTA	2	10	321850	321859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022583	TATAA	2	10	332440	332449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022583	TTATA	2	10	332849	332858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022583	AAATT	2	10	343270	343279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022583	TATAA	2	10	345983	345992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022583	GGGAA	2	10	350455	350464	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022583	TAAAT	3	15	355570	355584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022583	TAAAA	2	10	364495	364504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022583	TAAAG	2	10	382850	382859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022583	TTAAT	2	10	385377	385386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022583	TTAAA	2	10	395007	395016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022583	TAAAG	2	10	395031	395040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022583	AATAA	2	10	395159	395168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022583	AATAA	2	10	396319	396328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022583	AAATT	2	10	396329	396338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022583	TATTT	2	10	406776	406785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022583	TTTTA	2	10	415110	415119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022583	TAAAT	2	10	415409	415418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022583	TTATT	2	10	415813	415822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022583	TAAAA	2	10	416010	416019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022583	TTTAA	2	10	416288	416297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022583	TTTTA	2	10	417208	417217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022583	CTATT	2	10	417845	417854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022583	TATAA	2	10	433628	433637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022583	ATTTT	2	10	435419	435428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022583	TAAAA	2	10	439702	439711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022583	TATAT	2	10	448385	448394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022583	TTGTT	2	10	452700	452709	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022583	AAAAT	2	10	452735	452744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022583	CCGAA	2	10	454501	454510	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_022583	TTTTA	2	10	456709	456718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022583	TTTTC	2	10	463112	463121	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022583	TCGGT	2	10	480148	480157	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022583	TTTTC	2	10	480701	480710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022583	TGTTT	2	10	481112	481121	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022583	TAGAT	2	10	482540	482549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022583	TAATT	2	10	495129	495138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022583	TTTTA	2	10	496925	496934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022583	AAATG	2	10	506274	506283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022583	TTTTA	2	10	515474	515483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022583	AAAAT	2	10	520958	520967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022583	ATTTA	2	10	521087	521096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022583	ATTTT	2	10	521153	521162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022583	AATAC	2	10	521274	521283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022583	ACAAA	2	10	532356	532365	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022583	TTATT	2	10	532782	532791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022583	TTTAA	2	10	533129	533138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022583	TTTAA	2	10	533141	533150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022583	TATTT	2	10	535708	535717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022583	TTTTA	2	10	543699	543708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022583	TGAGT	2	10	553449	553458	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022583	TATAT	2	10	557538	557547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022583	ATTGT	2	10	565318	565327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022583	ATTTT	2	10	580452	580461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022583	AAAGT	2	10	595129	595138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022583	TTTTA	2	10	596854	596863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022583	ATTAT	2	10	622954	622963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022583	ATTTT	2	10	637537	637546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022583	AAATT	2	10	662416	662425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022583	TTCTT	2	10	662536	662545	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022583	ATAAA	2	10	665579	665588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022583	AAAAG	2	10	665589	665598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022583	TTTAT	2	10	693239	693248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022583	ATTTT	2	10	722606	722615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022583	TTTAT	2	10	722988	722997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022583	TCATA	2	10	723066	723075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022583	ACTTT	2	10	723268	723277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022583	AAAAC	2	10	736219	736228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022583	ATTAA	2	10	741450	741459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022583	CTTTT	2	10	741965	741974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022583	GGAAA	2	10	747392	747401	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022583	CTTTT	2	10	756207	756216	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022583	TAAAA	2	10	763639	763648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022583	AAAAT	2	10	775858	775867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022583	TTATT	2	10	782198	782207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022583	TAAAA	2	10	822284	822293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022583	TATAA	2	10	825566	825575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.