MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus sp. I-P16

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022582	TTCGGG	2	12	675	686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022582	TCTTTT	2	12	1079	1090	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022582	GATTTT	2	12	6036	6047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022582	TCTTTT	2	12	7422	7433	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022582	AAACAG	2	12	18299	18310	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022582	TCGAAA	2	12	24823	24834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022582	GAGAAA	2	12	61193	61204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022582	AAATAG	2	12	76442	76453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022582	TTTTTA	2	12	85075	85086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022582	GACAAG	2	12	85290	85301	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022582	TATATG	2	12	88173	88184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022582	AAAGGC	2	12	118162	118173	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022582	TACAAA	2	12	118205	118216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022582	CAGATG	2	12	127494	127505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022582	CTTCAA	2	12	127565	127576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022582	AAATTA	2	12	146630	146641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022582	CCATCT	2	12	149387	149398	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022582	CTAAAA	2	12	162006	162017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022582	AAGTAC	2	12	165013	165024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022582	AATAAA	2	12	165265	165276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022582	ACCTAA	2	12	177027	177038	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022582	TTCATA	2	12	179166	179177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022582	TGTTAG	2	12	193455	193466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022582	CCTTTG	2	12	193988	193999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022582	AAATAG	2	12	198472	198483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022582	ACTAAT	2	12	236593	236604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022582	ATGATT	2	12	304271	304282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022582	TAAGGA	2	12	329521	329532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022582	ACTAAT	2	12	332645	332656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022582	TGAGAG	2	12	337809	337820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022582	ATGAAA	2	12	340322	340333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022582	GGGGCT	2	12	446032	446043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022582	TAAATT	2	12	459812	459823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022582	TCTTTT	2	12	464197	464208	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022582	TCTTTT	2	12	493506	493517	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022582	TCTTTT	2	12	533330	533341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022582	CTTGAA	2	12	555302	555313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022582	TTTGAT	2	12	581801	581812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022582	GATAAG	2	12	612564	612575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022582	ATAGAA	2	12	675797	675808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022582	TTGTCT	2	12	679391	679402	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022582	TAGATT	2	12	680644	680655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022582	AAGTGG	2	12	705803	705814	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022582	TTTTTA	2	12	707144	707155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022582	TTCGGG	2	12	755447	755458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022582	AGTAGG	2	12	757136	757147	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022582	GTAAAA	2	12	770678	770689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022582	ATTTTT	2	12	789422	789433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022582	AAAGAG	2	12	793282	793293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022582	ACGCAC	2	12	824338	824349	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022582	GATTTA	2	12	824727	824738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022582	TAAAAA	2	12	825712	825723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022582	ACCTCT	2	12	831124	831135	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022582	AATTTA	2	12	865611	865622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022582	TTAAAT	2	12	878518	878529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022582	GACTTA	2	12	944203	944214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022582	TCTCCT	2	12	1019340	1019351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022582	TGATTA	2	12	1026054	1026065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022582	ATACCA	2	12	1027893	1027904	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022582	TGGCAT	2	12	1056787	1056798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022582	AAAAGA	2	12	1061844	1061855	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022582	ACATTT	2	12	1075565	1075576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022582	TATCTC	2	12	1138296	1138307	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022582	GTGCGT	2	12	1154093	1154104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022582	AGAAAG	2	12	1159227	1159238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022582	TTTTCT	2	12	1260685	1260696	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022582	TTCATT	2	12	1329620	1329631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022582	AGGGAT	2	12	1381399	1381410	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022582	CAAAAA	2	12	1455003	1455014	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022582	CAAAAA	2	12	1487496	1487507	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022582	TTCACT	2	12	1520736	1520747	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022582	AAATAA	2	12	1522511	1522522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022582	CCCTCT	2	12	1555176	1555187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022582	TAAAAA	2	12	1558939	1558950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022582	CCGAAG	2	12	1559002	1559013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022582	TCTTTT	2	12	1560515	1560526	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022582	GAAAAC	2	12	1563071	1563082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022582	CCGAAG	2	12	1566507	1566518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022582	TCTTTT	2	12	1572972	1572983	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022582	ACTCCC	2	12	1642978	1642989	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_022582	CGACCT	2	12	1694403	1694414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022582	CAACCT	2	12	1695311	1695322	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022582	CTTTTT	2	12	1701749	1701760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022582	ATGTTC	2	12	1724743	1724754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022582	GTTTTG	2	12	1755545	1755556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022582	TTAAAA	2	12	1776521	1776532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022582	TCTTTT	2	12	1807786	1807797	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022582	GAAAAA	2	12	1849420	1849431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022582	AATTTA	2	12	1870064	1870075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022582	TACTAA	2	12	1884942	1884953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022582	CGTTGA	2	12	1902753	1902764	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022582	GAAGGA	2	12	1942955	1942966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022582	AAGGAG	2	12	1949633	1949644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022582	CATATT	2	12	1977534	1977545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022582	AAAATT	2	12	1977726	1977737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022582	AATCAA	2	12	1983026	1983037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022582	GAAAAT	2	12	1996280	1996291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022582	TAAGGA	2	12	2020109	2020120	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022582	ACTAAT	2	12	2023233	2023244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.