MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus sp. I-P16

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022582	TATAT	2	10	350	359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022582	TATTT	2	10	5632	5641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022582	CTTAT	2	10	5678	5687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022582	ATTTT	2	10	6952	6961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022582	AGAGA	2	10	11029	11038	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022582	CAATA	2	10	67077	67086	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022582	TGCCT	2	10	72434	72443	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022582	AATAA	2	10	72917	72926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022582	AAATC	2	10	80530	80539	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022582	AATAA	2	10	84398	84407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022582	AAAAG	2	10	84441	84450	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022582	TGAAC	2	10	92456	92465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022582	ATAGA	2	10	98595	98604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022582	CTTGC	2	10	100990	100999	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022582	TTTTG	2	10	109741	109750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022582	TAGAA	2	10	113681	113690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022582	AAACA	2	10	125876	125885	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022582	TTTTG	2	10	132773	132782	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022582	ACCAT	2	10	138773	138782	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022582	CAACT	2	10	139343	139352	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022582	GATAA	2	10	142121	142130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022582	TAAAA	2	10	146571	146580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022582	ATAAA	2	10	154794	154803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022582	ATGGA	2	10	159494	159503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022582	AGAAA	2	10	162737	162746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022582	ATAAA	2	10	169153	169162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022582	ATAAA	2	10	175239	175248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022582	CTATA	2	10	189870	189879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022582	TATCA	2	10	191120	191129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022582	CTTTT	2	10	196173	196182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022582	GAAAG	2	10	222388	222397	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022582	AGGGA	2	10	236452	236461	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022582	AGAAT	2	10	237677	237686	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022582	AGAAT	2	10	237787	237796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022582	AGAAT	2	10	237897	237906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022582	AGAAT	2	10	238007	238016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022582	AGAAT	2	10	238117	238126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022582	AGAAT	2	10	238227	238236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022582	AGAAT	2	10	238337	238346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022582	AGAAT	2	10	238447	238456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022582	AGAAT	2	10	238557	238566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022582	AGAAT	2	10	238667	238676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022582	AGAAT	2	10	238777	238786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022582	AGAAT	2	10	238887	238896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022582	AGAAT	2	10	238997	239006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022582	CAAAG	2	10	243546	243555	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022582	AAAGG	2	10	244571	244580	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022582	AAGAA	2	10	253048	253057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022582	TGTTA	2	10	258026	258035	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022582	TATAA	2	10	263942	263951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022582	AGAAA	2	10	268042	268051	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022582	TAGCC	2	10	276769	276778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022582	AACGA	2	10	294973	294982	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022582	TTGAA	2	10	300723	300732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022582	ATTAG	2	10	308642	308651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022582	AAAAT	2	10	327065	327074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022582	TCGTG	2	10	329047	329056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022582	GTTAA	2	10	329774	329783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022582	GGGAG	2	10	330292	330301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022582	ATGGT	2	10	330979	330988	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022582	AGGGA	2	10	332504	332513	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022582	AGAAT	2	10	333729	333738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022582	TAAAT	2	10	363143	363152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022582	ATAAA	2	10	363216	363225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022582	TATAA	2	10	367851	367860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022582	ATGAA	2	10	370393	370402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022582	ATTTC	2	10	404074	404083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022582	GTTTT	2	10	406699	406708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022582	AGGTT	2	10	409900	409909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022582	ATAGA	2	10	421531	421540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022582	AATTA	2	10	424533	424542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022582	GAAAT	2	10	430764	430773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022582	CAAGG	2	10	434784	434793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022582	TTTTA	2	10	461073	461082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022582	TCTTT	2	10	465186	465195	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022582	AGCTA	2	10	485536	485545	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022582	ATAAA	2	10	489060	489069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022582	CGTCT	2	10	502031	502040	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_022582	TAGAA	2	10	503805	503814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022582	CAAAA	2	10	517212	517221	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_022582	AATAG	2	10	528495	528504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022582	AAGGA	2	10	533419	533428	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022582	TAGAA	2	10	555287	555296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022582	CCGAG	2	10	559153	559162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_022582	AAGAA	2	10	572634	572643	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022582	ATATA	2	10	572879	572888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022582	GAAGA	2	10	578940	578949	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022582	CTTAC	2	10	586830	586839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022582	TAGAA	2	10	586858	586867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022582	TCAAA	2	10	625182	625191	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022582	CTGAA	2	10	653000	653009	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022582	TTCAT	2	10	669555	669564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022582	GAAAA	2	10	671592	671601	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022582	TATTC	2	10	688742	688751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022582	TAATA	2	10	694906	694915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022582	CTCGT	2	10	698684	698693	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022582	TATTT	2	10	701747	701756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022582	CATTT	2	10	707123	707132	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022582	TAAAG	2	10	710205	710214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022582	ATAGT	2	10	711755	711764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022582	AGATA	2	10	717963	717972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022582	CTGAA	2	10	718211	718220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022582	TTTTA	2	10	733884	733893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022582	ATAGA	2	10	738845	738854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022582	TAGAG	2	10	739673	739682	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022582	CAAAA	2	10	740764	740773	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022582	TTTAA	2	10	749965	749974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022582	GAAAT	2	10	755028	755037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022582	TATTT	2	10	755604	755613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022582	TTTAT	2	10	767069	767078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022582	ATTTC	2	10	783702	783711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022582	ACATA	2	10	797432	797441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022582	AATAG	2	10	797524	797533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022582	TGTTT	2	10	803402	803411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022582	AAAAC	2	10	807642	807651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022582	GTTTA	2	10	813792	813801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022582	GTTTT	2	10	825921	825930	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022582	TATTT	2	10	826067	826076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022582	GAAAG	2	10	826513	826522	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022582	TATTT	2	10	827666	827675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022582	TTATG	2	10	831285	831294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022582	ATTAT	2	10	839618	839627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022582	GATTC	2	10	844776	844785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022582	AAATA	2	10	861120	861129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022582	TATCT	2	10	891700	891709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022582	ATGGT	2	10	894289	894298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022582	TCTCT	2	10	896701	896710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_022582	TTTTA	2	10	898896	898905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022582	AAAAG	2	10	911388	911397	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022582	TGATA	2	10	918306	918315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022582	AAAGA	2	10	919368	919377	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022582	TATCT	2	10	919902	919911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022582	CTTTG	2	10	919947	919956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022582	ATATT	2	10	921139	921148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022582	GTCTT	2	10	924628	924637	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022582	ATTTT	2	10	940048	940057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022582	TTCTA	2	10	951510	951519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022582	ACCTA	2	10	952016	952025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_022582	TTTTA	2	10	987223	987232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022582	TTATT	2	10	1002307	1002316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022582	AGCTT	2	10	1002627	1002636	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022582	AAAAT	2	10	1008469	1008478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022582	AAATT	2	10	1014980	1014989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022582	CAAAA	2	10	1016534	1016543	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022582	TCCTT	2	10	1018319	1018328	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_022582	CTTTT	2	10	1023628	1023637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022582	AGAGC	2	10	1027938	1027947	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_022582	TATTT	2	10	1051991	1052000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022582	TCACC	2	10	1056990	1056999	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
150	NC_022582	TAACT	2	10	1061796	1061805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_022582	TCTAA	2	10	1063338	1063347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_022582	ATTTC	2	10	1069841	1069850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_022582	AATAA	2	10	1075790	1075799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022582	TTATC	2	10	1103808	1103817	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_022582	ACTTT	2	10	1107247	1107256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022582	TATTT	2	10	1111913	1111922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022582	AAAAG	2	10	1117168	1117177	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022582	TTCTA	2	10	1126448	1126457	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_022582	CTGGT	2	10	1154352	1154361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_022582	TCATC	2	10	1170215	1170224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_022582	TAGTT	2	10	1176661	1176670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022582	ATCAG	2	10	1210037	1210046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_022582	CTTTT	2	10	1296984	1296993	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_022582	TCTTA	2	10	1310019	1310028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_022582	CTTTT	2	10	1318587	1318596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_022582	AATGA	2	10	1321535	1321544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_022582	AATCG	2	10	1352263	1352272	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_022582	CCCTG	2	10	1352630	1352639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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186	NC_022582	TTATT	2	10	1362374	1362383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022582	TAGAA	2	10	1366405	1366414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_022582	CTTTT	2	10	1376067	1376076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_022582	AAGAA	2	10	1390532	1390541	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022582	ACAAT	2	10	1399800	1399809	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_022582	TTCTA	2	10	1412670	1412679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_022582	ATTCA	2	10	1431437	1431446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_022582	CATTT	2	10	1432913	1432922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_022582	AATTC	2	10	1467966	1467975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_022582	TCTAT	2	10	1467979	1467988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_022582	TAAAA	2	10	1489245	1489254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_022582	GTTAA	2	10	2020362	2020371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_022582	GGGAG	2	10	2020880	2020889	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022582	ATGGT	2	10	2021567	2021576	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
270	NC_022582	AGGGA	2	10	2023092	2023101	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.