MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 2523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	551593595
2	NC_022579	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022579	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022579	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	551593599
5	NC_022579	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	551593600
6	NC_022579	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	551593602
7	NC_022579	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	551593602
8	NC_022579	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	551593602
9	NC_022579	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	551593603
10	NC_022579	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	551593604
11	NC_022579	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	551593604
12	NC_022579	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022579	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022579	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	551593605
15	NC_022579	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	551593606
16	NC_022579	GCAAA	2	10	11836	11845	60 %	0 %	20 %	20 %	551593610
17	NC_022579	AAGTG	2	10	13664	13673	40 %	20 %	40 %	0 %	551593612
18	NC_022579	GAAAG	2	10	13985	13994	60 %	0 %	40 %	0 %	551593613
19	NC_022579	AGGAT	2	10	14058	14067	40 %	20 %	40 %	0 %	551593613
20	NC_022579	ATTTT	2	10	17744	17753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022579	ATAAA	2	10	24872	24881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022579	AAATT	2	10	27868	27877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022579	TGTTT	2	10	28513	28522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022579	TTCTC	2	10	29425	29434	0 %	60 %	0 %	40 %	551593633
25	NC_022579	CATAT	2	10	31013	31022	40 %	40 %	0 %	20 %	551593636
26	NC_022579	GCAGA	2	10	31352	31361	40 %	0 %	40 %	20 %	551593636
27	NC_022579	AGAGG	2	10	36143	36152	40 %	0 %	60 %	0 %	551593640
28	NC_022579	GCTGT	2	10	37825	37834	0 %	40 %	40 %	20 %	551593641
29	NC_022579	CATGT	2	10	38652	38661	20 %	40 %	20 %	20 %	551593642
30	NC_022579	CAGTG	2	10	39315	39324	20 %	20 %	40 %	20 %	551593642
31	NC_022579	TTCTG	2	10	40449	40458	0 %	60 %	20 %	20 %	551593643
32	NC_022579	ATGGA	2	10	41358	41367	40 %	20 %	40 %	0 %	551593644
33	NC_022579	CAATC	2	10	42064	42073	40 %	20 %	0 %	40 %	551593644
34	NC_022579	AAATT	2	10	42402	42411	60 %	40 %	0 %	0 %	551593644
35	NC_022579	TCCTC	2	10	45248	45257	0 %	40 %	0 %	60 %	551593647
36	NC_022579	GTTGC	2	10	46319	46328	0 %	40 %	40 %	20 %	551593648
37	NC_022579	ATTTG	2	10	46405	46414	20 %	60 %	20 %	0 %	551593648
38	NC_022579	TTATC	2	10	49191	49200	20 %	60 %	0 %	20 %	551593650
39	NC_022579	CTGAG	2	10	50628	50637	20 %	20 %	40 %	20 %	551593652
40	NC_022579	ACTGT	2	10	50985	50994	20 %	40 %	20 %	20 %	551593652
41	NC_022579	AAATG	2	10	51940	51949	60 %	20 %	20 %	0 %	551593653
42	NC_022579	CTGCA	2	10	55648	55657	20 %	20 %	20 %	40 %	551593660
43	NC_022579	TGCCT	2	10	56785	56794	0 %	40 %	20 %	40 %	551593661
44	NC_022579	TTTGC	2	10	59405	59414	0 %	60 %	20 %	20 %	551593663
45	NC_022579	CAGCG	2	10	62525	62534	20 %	0 %	40 %	40 %	551593664
46	NC_022579	ATAAG	2	10	67883	67892	60 %	20 %	20 %	0 %	551593668
47	NC_022579	TGTTT	2	10	69809	69818	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022579	TGAAG	2	10	81629	81638	40 %	20 %	40 %	0 %	551593678
49	NC_022579	CTGTA	2	10	82358	82367	20 %	40 %	20 %	20 %	551593679
50	NC_022579	ATACT	2	10	82849	82858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022579	GTAAA	2	10	82907	82916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022579	AATGC	2	10	85811	85820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022579	GGAAA	2	10	86498	86507	60 %	0 %	40 %	0 %	551593681
54	NC_022579	AGGTC	2	10	89324	89333	20 %	20 %	40 %	20 %	551593685
55	NC_022579	ATATT	2	10	89884	89893	40 %	60 %	0 %	0 %	551593686
56	NC_022579	AGAAT	2	10	91297	91306	60 %	20 %	20 %	0 %	551593686
57	NC_022579	GGCTC	2	10	91310	91319	0 %	20 %	40 %	40 %	551593686
58	NC_022579	GCAGG	2	10	92301	92310	20 %	0 %	60 %	20 %	551593688
59	NC_022579	GACCG	2	10	93488	93497	20 %	0 %	40 %	40 %	551593688
60	NC_022579	GTTTT	2	10	94352	94361	0 %	80 %	20 %	0 %	551593689
61	NC_022579	TTTCA	2	10	94549	94558	20 %	60 %	0 %	20 %	551593689
62	NC_022579	ACTGA	2	10	96359	96368	40 %	20 %	20 %	20 %	551593690
63	NC_022579	ACTGG	2	10	97191	97200	20 %	20 %	40 %	20 %	551593691
64	NC_022579	TGAAC	2	10	98355	98364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022579	TCGAA	2	10	98727	98736	40 %	20 %	20 %	20 %	551593693
66	NC_022579	CTTTA	2	10	105227	105236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022579	AAATT	2	10	106613	106622	60 %	40 %	0 %	0 %	551593702
68	NC_022579	GAATT	2	10	110563	110572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022579	TAATG	2	10	110857	110866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022579	TCTTT	2	10	110872	110881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022579	TGCAT	2	10	113124	113133	20 %	40 %	20 %	20 %	551593708
72	NC_022579	TCTGC	2	10	115282	115291	0 %	40 %	20 %	40 %	551593710
73	NC_022579	TAAAT	2	10	118117	118126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022579	GTTTT	2	10	118956	118965	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022579	AAATT	2	10	119733	119742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022579	TAAAA	2	10	120678	120687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022579	CGCTG	2	10	120919	120928	0 %	20 %	40 %	40 %	551593721
78	NC_022579	GTTCA	2	10	121218	121227	20 %	40 %	20 %	20 %	551593723
79	NC_022579	CAGTG	2	10	121320	121329	20 %	20 %	40 %	20 %	551593723
80	NC_022579	TTCCT	2	10	121340	121349	0 %	60 %	0 %	40 %	551593723
81	NC_022579	ACATC	2	10	121766	121775	40 %	20 %	0 %	40 %	551593723
82	NC_022579	CTGAT	2	10	125434	125443	20 %	40 %	20 %	20 %	551593727
83	NC_022579	TTTTG	2	10	128759	128768	0 %	80 %	20 %	0 %	551593730
84	NC_022579	AGGTC	2	10	130524	130533	20 %	20 %	40 %	20 %	551593732
85	NC_022579	GGAAA	2	10	131506	131515	60 %	0 %	40 %	0 %	551593732
86	NC_022579	TTCAT	2	10	133017	133026	20 %	60 %	0 %	20 %	551593733
87	NC_022579	GCATC	2	10	133544	133553	20 %	20 %	20 %	40 %	551593734
88	NC_022579	GGGCT	2	10	134645	134654	0 %	20 %	60 %	20 %	551593735
89	NC_022579	CTTTT	2	10	134841	134850	0 %	80 %	0 %	20 %	551593735
90	NC_022579	TTGAG	2	10	134917	134926	20 %	40 %	40 %	0 %	551593735
91	NC_022579	AATCA	2	10	135640	135649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022579	AGAAT	2	10	136656	136665	60 %	20 %	20 %	0 %	551593737
93	NC_022579	GTGAA	2	10	136671	136680	40 %	20 %	40 %	0 %	551593737
94	NC_022579	TTACT	2	10	138165	138174	20 %	60 %	0 %	20 %	551593737
95	NC_022579	CTGGT	2	10	138789	138798	0 %	40 %	40 %	20 %	551593739
96	NC_022579	CCGGC	2	10	139468	139477	0 %	0 %	40 %	60 %	551593740
97	NC_022579	ATTTT	2	10	140184	140193	20 %	80 %	0 %	0 %	551593740
98	NC_022579	CCTGC	2	10	140220	140229	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_022579	TTCGG	2	10	141109	141118	0 %	40 %	40 %	20 %	551593743
100	NC_022579	GCATG	2	10	141242	141251	20 %	20 %	40 %	20 %	551593743
101	NC_022579	TTTCA	2	10	142857	142866	20 %	60 %	0 %	20 %	551593743
102	NC_022579	TGGTT	2	10	143500	143509	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022579	ATCCC	2	10	144186	144195	20 %	20 %	0 %	60 %	551593744
104	NC_022579	GCGTA	2	10	148291	148300	20 %	20 %	40 %	20 %	551593746
105	NC_022579	TTTCC	2	10	150088	150097	0 %	60 %	0 %	40 %	551593749
106	NC_022579	CAATA	2	10	151840	151849	60 %	20 %	0 %	20 %	551593750
107	NC_022579	GCTTC	2	10	153544	153553	0 %	40 %	20 %	40 %	551593750
108	NC_022579	TTCTT	2	10	154051	154060	0 %	80 %	0 %	20 %	551593752
109	NC_022579	TTCCA	2	10	155499	155508	20 %	40 %	0 %	40 %	551593752
110	NC_022579	TTTTG	2	10	155659	155668	0 %	80 %	20 %	0 %	551593752
111	NC_022579	GCTCG	2	10	156447	156456	0 %	20 %	40 %	40 %	551593753
112	NC_022579	TGATC	2	10	157572	157581	20 %	40 %	20 %	20 %	551593753
113	NC_022579	AAAAG	2	10	157583	157592	80 %	0 %	20 %	0 %	551593753
114	NC_022579	CCAGA	2	10	160011	160020	40 %	0 %	20 %	40 %	551593755
115	NC_022579	GTACT	2	10	160808	160817	20 %	40 %	20 %	20 %	551593755
116	NC_022579	GTTGC	2	10	161073	161082	0 %	40 %	40 %	20 %	551593756
117	NC_022579	CTTGC	2	10	161379	161388	0 %	40 %	20 %	40 %	551593756
118	NC_022579	GCAAG	2	10	162825	162834	40 %	0 %	40 %	20 %	551593757
119	NC_022579	ATTTC	2	10	163499	163508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022579	GAAAA	2	10	163638	163647	80 %	0 %	20 %	0 %	551593758
121	NC_022579	GCGGG	2	10	165464	165473	0 %	0 %	80 %	20 %	551593761
122	NC_022579	TCCTG	2	10	168469	168478	0 %	40 %	20 %	40 %	551593763
123	NC_022579	GGGGA	2	10	168678	168687	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022579	GGCAA	2	10	169137	169146	40 %	0 %	40 %	20 %	551593764
125	NC_022579	TCAGA	2	10	169472	169481	40 %	20 %	20 %	20 %	551593764
126	NC_022579	AAATT	2	10	169801	169810	60 %	40 %	0 %	0 %	551593764
127	NC_022579	AGATA	2	10	173280	173289	60 %	20 %	20 %	0 %	551593768
128	NC_022579	GGCTT	2	10	173483	173492	0 %	40 %	40 %	20 %	551593769
129	NC_022579	AGTGC	2	10	173982	173991	20 %	20 %	40 %	20 %	551593770
130	NC_022579	CAGGC	2	10	175049	175058	20 %	0 %	40 %	40 %	551593770
131	NC_022579	GGATT	2	10	175198	175207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022579	AATTC	2	10	176858	176867	40 %	40 %	0 %	20 %	551593771
133	NC_022579	TTTTC	2	10	178161	178170	0 %	80 %	0 %	20 %	551593772
134	NC_022579	TCAGA	2	10	178571	178580	40 %	20 %	20 %	20 %	551593773
135	NC_022579	CAGGT	2	10	180915	180924	20 %	20 %	40 %	20 %	551593777
136	NC_022579	TTATT	2	10	182488	182497	20 %	80 %	0 %	0 %	551593780
137	NC_022579	TTGTT	2	10	183146	183155	0 %	80 %	20 %	0 %	551593780
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139	NC_022579	CAGCC	2	10	187260	187269	20 %	0 %	20 %	60 %	551593784
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250	NC_022579	ATTAT	2	10	335940	335949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_022579	CTGGG	2	10	349093	349102	0 %	20 %	60 %	20 %	551593971
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386	NC_022579	CTGAT	2	10	530566	530575	20 %	40 %	20 %	20 %	551594118
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388	NC_022579	AGGTC	2	10	531886	531895	20 %	20 %	40 %	20 %	551594119
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391	NC_022579	CGGAC	2	10	536040	536049	20 %	0 %	40 %	40 %	551594124
392	NC_022579	CTGCG	2	10	538053	538062	0 %	20 %	40 %	40 %	551594125
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397	NC_022579	GGATG	2	10	545015	545024	20 %	20 %	60 %	0 %	551594133
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399	NC_022579	TTTAA	2	10	548867	548876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_022579	CGGAA	2	10	555128	555137	40 %	0 %	40 %	20 %	551594144
402	NC_022579	TTAGT	2	10	555713	555722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
403	NC_022579	TGACC	2	10	559262	559271	20 %	20 %	20 %	40 %	551594148
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