MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 45943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022579	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022579	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022579	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022579	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022579	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022579	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022579	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593594
9	NC_022579	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
10	NC_022579	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
11	NC_022579	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593595
12	NC_022579	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
13	NC_022579	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022579	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
15	NC_022579	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
16	NC_022579	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
17	NC_022579	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022579	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022579	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593597
20	NC_022579	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
21	NC_022579	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
22	NC_022579	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593597
23	NC_022579	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593597
24	NC_022579	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593597
25	NC_022579	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022579	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022579	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022579	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022579	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022579	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022579	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022579	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022579	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022579	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022579	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593599
36	NC_022579	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
37	NC_022579	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
38	NC_022579	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593600
39	NC_022579	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593600
40	NC_022579	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
41	NC_022579	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
42	NC_022579	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
43	NC_022579	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
44	NC_022579	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
45	NC_022579	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
46	NC_022579	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
47	NC_022579	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
48	NC_022579	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
49	NC_022579	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593600
50	NC_022579	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
51	NC_022579	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593600
52	NC_022579	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
53	NC_022579	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
54	NC_022579	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
55	NC_022579	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
56	NC_022579	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
57	NC_022579	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
58	NC_022579	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
59	NC_022579	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
60	NC_022579	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
61	NC_022579	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
62	NC_022579	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
63	NC_022579	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
64	NC_022579	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
65	NC_022579	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593601
66	NC_022579	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593601
67	NC_022579	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
68	NC_022579	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593601
69	NC_022579	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
70	NC_022579	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593601
71	NC_022579	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593601
72	NC_022579	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022579	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
74	NC_022579	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593602
75	NC_022579	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
76	NC_022579	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
77	NC_022579	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593602
78	NC_022579	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
79	NC_022579	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
80	NC_022579	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
81	NC_022579	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593603
82	NC_022579	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593603
83	NC_022579	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593603
84	NC_022579	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593603
85	NC_022579	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593603
86	NC_022579	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593603
87	NC_022579	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593603
88	NC_022579	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
89	NC_022579	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593604
90	NC_022579	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593604
91	NC_022579	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593604
92	NC_022579	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
93	NC_022579	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593604
94	NC_022579	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593604
95	NC_022579	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022579	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022579	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022579	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022579	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022579	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022579	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022579	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022579	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593605
104	NC_022579	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593605
105	NC_022579	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022579	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593606
107	NC_022579	AGT	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
108	NC_022579	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593606
109	NC_022579	ATG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
110	NC_022579	AGC	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593606
111	NC_022579	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593606
112	NC_022579	AGC	3	9	9560	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593606
113	NC_022579	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593606
114	NC_022579	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
115	NC_022579	ATG	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
116	NC_022579	TCA	3	9	9792	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593606
117	NC_022579	ATG	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
118	NC_022579	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
119	NC_022579	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
120	NC_022579	TTG	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
121	NC_022579	AGA	2	6	10049	10054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593606
122	NC_022579	ATT	2	6	10268	10273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593606
123	NC_022579	GTT	2	6	10363	10368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022579	TTG	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593607
125	NC_022579	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593608
126	NC_022579	AGT	2	6	10738	10743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593608
127	NC_022579	TTG	2	6	10812	10817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593608
128	NC_022579	GCT	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593608
129	NC_022579	TGA	3	9	10870	10878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593608
130	NC_022579	GCA	2	6	10954	10959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593609
131	NC_022579	ACT	2	6	11096	11101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593609
132	NC_022579	AGT	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022579	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_022579	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022579	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022579	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022579	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_022579	TTG	2	6	22704	22709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593624
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498	NC_022579	GCT	2	6	42988	42993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_022579	AGC	2	6	43004	43009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_022579	AAT	2	6	43237	43242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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