MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 4757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022579	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022579	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022579	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022579	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022579	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022579	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022579	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022579	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022579	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022579	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022579	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022579	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022579	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022579	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022579	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022579	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022579	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022579	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022579	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022579	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022579	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022579	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022579	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022579	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_022579	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022579	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022579	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022579	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022579	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022579	GTT	2	6	10363	10368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022579	AGT	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022579	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022579	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022579	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022579	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022579	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022579	TGA	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022579	TCC	2	6	17654	17659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_022579	AGG	2	6	17665	17670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022579	CCA	2	6	17756	17761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022579	TTA	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022579	CAA	2	6	19976	19981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022579	GTA	2	6	21081	21086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022579	TGT	2	6	21087	21092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022579	GGA	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022579	TGG	2	6	21927	21932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022579	AGT	2	6	21935	21940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022579	TTC	2	6	22409	22414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022579	GCG	2	6	23258	23263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022579	ATT	2	6	23590	23595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022579	GTT	2	6	23974	23979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022579	ATA	3	9	24336	24344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022579	AGT	2	6	24348	24353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022579	TGT	2	6	24368	24373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022579	TAA	2	6	24387	24392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022579	TGC	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022579	CCT	2	6	24561	24566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_022579	AGT	2	6	24819	24824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022579	AGA	2	6	27935	27940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022579	TGC	2	6	28308	28313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022579	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022579	CCA	2	6	28523	28528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_022579	ATA	2	6	35069	35074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022579	AAG	2	6	35144	35149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022579	ATA	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022579	ACT	2	6	36304	36309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022579	AGT	2	6	36416	36421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022579	ACC	2	6	36559	36564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_022579	TAA	2	6	36612	36617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022579	CAA	2	6	36645	36650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022579	AAT	2	6	36658	36663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022579	GTT	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022579	TGG	2	6	36810	36815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022579	ATT	3	9	36869	36877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022579	GAA	2	6	36956	36961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022579	CAG	2	6	37067	37072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022579	ATT	2	6	37212	37217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022579	ACG	2	6	37227	37232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022579	AAT	2	6	37248	37253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022579	TTG	2	6	40107	40112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022579	TAA	2	6	40941	40946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022579	AGA	3	9	42932	42940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022579	GCT	2	6	42988	42993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022579	AGC	2	6	43004	43009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022579	AAT	2	6	43237	43242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022579	ATT	2	6	43250	43255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022579	GCT	2	6	43379	43384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022579	TTC	2	6	43385	43390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022579	GAC	2	6	43617	43622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022579	TAA	2	6	43691	43696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022579	ATA	2	6	49906	49911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022579	TAT	2	6	56281	56286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022579	CTG	2	6	56326	56331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022579	CCG	2	6	56434	56439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_022579	TGT	2	6	56913	56918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022579	GTT	2	6	57888	57893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022579	TCC	2	6	57991	57996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_022579	ATT	2	6	62779	62784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022579	ACC	2	6	64814	64819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022579	TGA	2	6	65131	65136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022579	TTA	2	6	65227	65232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022579	AGG	2	6	65250	65255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022579	TCC	2	6	66714	66719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022579	GCT	2	6	69872	69877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022579	TAA	2	6	70939	70944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022579	ATT	2	6	70972	70977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022579	TAC	2	6	75341	75346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022579	ATA	2	6	75376	75381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022579	TGT	2	6	75439	75444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022579	AAT	2	6	77485	77490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022579	ACA	2	6	77522	77527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022579	GAG	2	6	77595	77600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022579	TCA	2	6	77660	77665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022579	CTG	2	6	77759	77764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022579	TGT	2	6	78004	78009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022579	AAT	2	6	78015	78020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022579	GAT	2	6	78841	78846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022579	GGA	2	6	78862	78867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022579	GGA	2	6	79723	79728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022579	TCC	2	6	79744	79749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022579	AAC	2	6	79754	79759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022579	ATT	2	6	81182	81187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022579	CTG	2	6	81199	81204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022579	CTG	2	6	81345	81350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022579	ATT	2	6	82886	82891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022579	GTT	2	6	85747	85752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022579	AAT	2	6	85944	85949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022579	GTT	2	6	86001	86006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022579	ATT	2	6	86007	86012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022579	ATT	2	6	89174	89179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022579	CAG	2	6	91563	91568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022579	GCT	2	6	91585	91590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022579	CAA	2	6	95020	95025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022579	TAG	2	6	95083	95088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022579	TAT	2	6	98431	98436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022579	GTT	2	6	98441	98446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022579	GTG	2	6	98452	98457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022579	GCC	2	6	98467	98472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_022579	TTA	2	6	98566	98571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022579	CTA	2	6	100180	100185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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