MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 plasmid DESAM_p

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022578	CAG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551588050
2	NC_022578	TAA	2	6	197	202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551588050
3	NC_022578	TTA	2	6	242	247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551588051
4	NC_022578	GAT	2	6	253	258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588051
5	NC_022578	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551588051
6	NC_022578	GCC	2	6	313	318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551588051
7	NC_022578	TAG	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588051
8	NC_022578	CAG	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551588051
9	NC_022578	TGG	2	6	954	959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588052
10	NC_022578	GAT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588052
11	NC_022578	TGA	2	6	1073	1078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588052
12	NC_022578	TTC	2	6	1097	1102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551588052
13	NC_022578	GTG	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588052
14	NC_022578	GCG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588052
15	NC_022578	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551588052
16	NC_022578	CGG	2	6	1700	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588052
17	NC_022578	TTG	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551588052
18	NC_022578	GCT	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551588052
19	NC_022578	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551588053
20	NC_022578	GCT	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551588053
21	NC_022578	AAG	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551588053
22	NC_022578	ATA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551588053
23	NC_022578	ACA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551588053
24	NC_022578	GCT	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551588053
25	NC_022578	AGG	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551588053
26	NC_022578	CGG	2	6	2305	2310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
27	NC_022578	TGA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588054
28	NC_022578	TGA	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551588054
29	NC_022578	CTA	2	6	2629	2634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551588054
30	NC_022578	TGG	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
31	NC_022578	CTA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551588054
32	NC_022578	TAC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551588054
33	NC_022578	CGC	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551588054
34	NC_022578	ACA	2	6	2893	2898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551588054
35	NC_022578	GAA	3	9	2973	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551588054
36	NC_022578	TGG	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
37	NC_022578	GTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551588054
38	NC_022578	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551588054
39	NC_022578	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551588054
40	NC_022578	CCG	2	6	3478	3483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551588054
41	NC_022578	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551588054
42	NC_022578	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551588054
43	NC_022578	TGG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
44	NC_022578	CTT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551588054
45	NC_022578	TGC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551588054
46	NC_022578	GGT	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
47	NC_022578	GGT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
48	NC_022578	TGG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
49	NC_022578	GGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
50	NC_022578	TTC	2	6	4301	4306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551588054
51	NC_022578	CTC	2	6	4381	4386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551588054
52	NC_022578	TGG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
53	NC_022578	GCG	2	6	4411	4416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
54	NC_022578	ATC	3	9	4431	4439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551588054
55	NC_022578	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
56	NC_022578	CGG	2	6	4526	4531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
57	NC_022578	CGG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
58	NC_022578	GGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
59	NC_022578	TGG	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
60	NC_022578	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551588054
61	NC_022578	GGT	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
62	NC_022578	GGT	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
63	NC_022578	CGG	2	6	4703	4708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
64	NC_022578	CGG	2	6	4721	4726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551588054
65	NC_022578	TGG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
66	NC_022578	GGT	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054
67	NC_022578	GGT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551588054

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.