MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Comamonadaceae bacterium CR

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022576	CATTCC	2	12	37031	37042	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022576	ACAAAC	2	12	59415	59426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022576	GCTGGT	2	12	121371	121382	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022576	TGTACG	2	12	130325	130336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022576	ATAGAG	2	12	157816	157827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022576	AGAGGG	2	12	205046	205057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022576	CTCCCT	2	12	205102	205113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_022576	CTATCA	3	18	271142	271159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022576	CCCAGG	2	12	301932	301943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022576	TGCCCA	2	12	310356	310367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022576	CTGCCC	2	12	310390	310401	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022576	TGTCGT	2	12	422667	422678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022576	TGCCTG	2	12	423003	423014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022576	GTGCCC	2	12	426631	426642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022576	CTTTTT	2	12	446524	446535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022576	TTCCCA	2	12	464670	464681	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022576	CCACGT	2	12	472465	472476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022576	TGGGGG	2	12	527073	527084	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022576	CACCAG	2	12	547868	547879	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022576	AAACCC	2	12	648156	648167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022576	GCTGCG	2	12	654093	654104	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022576	TCGGCA	2	12	706379	706390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022576	ACTGCC	2	12	829982	829993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022576	TGATGG	2	12	830045	830056	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022576	TCTGGC	2	12	940807	940818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022576	GAAAAA	2	12	978144	978155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022576	ACGACA	2	12	979149	979160	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022576	GTCAAA	2	12	1109927	1109938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022576	CCAGGC	2	12	1116830	1116841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022576	ACAAAC	2	12	1146363	1146374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022576	GCAGTA	2	12	1163492	1163503	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022576	CGTCTA	2	12	1237124	1237135	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022576	GCATGA	2	12	1244533	1244544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022576	AGGGCA	2	12	1248357	1248368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022576	CTTTCG	2	12	1256507	1256518	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022576	GCGGGG	2	12	1288792	1288803	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022576	ATATAA	2	12	1305612	1305623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022576	TCGCAC	2	12	1322377	1322388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022576	TTCGCC	2	12	1333402	1333413	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022576	TTTCTG	2	12	1357364	1357375	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022576	CCCATT	2	12	1367358	1367369	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022576	CCATTC	2	12	1367373	1367384	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022576	TATTGG	2	12	1414646	1414657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022576	CTCGCA	2	12	1531805	1531816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022576	GTGCGC	2	12	1662684	1662695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022576	GTTTTT	2	12	1666115	1666126	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022576	CCGGAA	2	12	1669312	1669323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022576	GCAAGG	2	12	1670860	1670871	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022576	TTATTT	2	12	1704189	1704200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022576	ACTATG	2	12	1751237	1751248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022576	AATTTG	2	12	1815466	1815477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022576	GGCCTG	2	12	1849434	1849445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022576	GACAAC	2	12	1873075	1873086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022576	TTTCCT	2	12	1896353	1896364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022576	TAGGGA	2	12	1977406	1977417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022576	AGCGCA	2	12	1986266	1986277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022576	AATGCA	2	12	2034542	2034553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022576	TGCCTG	2	12	2128712	2128723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022576	GTCCGA	2	12	2179909	2179920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022576	CGCTGG	2	12	2207768	2207779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022576	GGAAGG	2	12	2220965	2220976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022576	ACGCAC	2	12	2249333	2249344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022576	GATGGC	2	12	2259566	2259577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022576	CAGATA	2	12	2279025	2279036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022576	ATCGAC	2	12	2309458	2309469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022576	CTACTC	2	12	2321064	2321075	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022576	CCTGCG	2	12	2321111	2321122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022576	TAGGGA	2	12	2345234	2345245	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022576	CCGACG	2	12	2410147	2410158	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022576	ACATCA	2	12	2446734	2446745	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022576	TATTTT	2	12	2505445	2505456	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022576	CCGGAA	2	12	2525437	2525448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022576	GGTTTT	2	12	2554863	2554874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022576	GGGCGC	2	12	2709785	2709796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022576	CGAATA	4	24	2831273	2831296	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022576	GTACGT	2	12	2842203	2842214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022576	ATTGGT	2	12	2851021	2851032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022576	GACGAG	2	12	2863095	2863106	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_022576	CTGGTT	2	12	2909958	2909969	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022576	CGCTTG	2	12	2951130	2951141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022576	GGGGCC	2	12	2991394	2991405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.