MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Comamonadaceae bacterium CR

Total Repeats: 41914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022576	AGC	2	6	104	109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
2	NC_022576	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
3	NC_022576	GGC	2	6	298	303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989633
4	NC_022576	GGT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989633
5	NC_022576	GGT	2	6	331	336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989633
6	NC_022576	CCA	2	6	410	415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989633
7	NC_022576	CGC	2	6	438	443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989633
8	NC_022576	GCA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
9	NC_022576	GCA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
10	NC_022576	GCC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989633
11	NC_022576	TTG	2	6	709	714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989633
12	NC_022576	CGA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
13	NC_022576	CGA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
14	NC_022576	TTC	2	6	859	864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989633
15	NC_022576	CAA	2	6	867	872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989633
16	NC_022576	CTG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
17	NC_022576	AAG	2	6	922	927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
18	NC_022576	TGA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989633
19	NC_022576	GAA	2	6	1099	1104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
20	NC_022576	TCG	2	6	1115	1120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989633
21	NC_022576	AGA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
22	NC_022576	ACT	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989633
23	NC_022576	AGA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989633
24	NC_022576	CAG	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989633
25	NC_022576	GGC	2	6	1575	1580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022576	GCA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022576	TCT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989634
28	NC_022576	CAC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989634
29	NC_022576	TCG	2	6	1708	1713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
30	NC_022576	CGC	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989634
31	NC_022576	CGG	2	6	1826	1831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989634
32	NC_022576	CGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
33	NC_022576	CGT	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
34	NC_022576	GAC	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
35	NC_022576	GCA	2	6	2093	2098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
36	NC_022576	CTA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989634
37	NC_022576	TCG	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
38	NC_022576	CGA	2	6	2276	2281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
39	NC_022576	GTC	2	6	2526	2531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
40	NC_022576	GAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989634
41	NC_022576	CGA	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989634
42	NC_022576	TGC	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
43	NC_022576	TGA	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989634
44	NC_022576	CGT	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989634
45	NC_022576	CCA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
46	NC_022576	GAA	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989635
47	NC_022576	GGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
48	NC_022576	CAC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
49	NC_022576	GTC	2	6	2978	2983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
50	NC_022576	TCG	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
51	NC_022576	CGT	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
52	NC_022576	TGC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
53	NC_022576	CGG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989635
54	NC_022576	TGC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
55	NC_022576	ACG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
56	NC_022576	CAG	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
57	NC_022576	ACG	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
58	NC_022576	AGG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
59	NC_022576	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
60	NC_022576	AAC	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
61	NC_022576	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
62	NC_022576	TCA	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
63	NC_022576	CGA	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
64	NC_022576	CGA	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
65	NC_022576	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
66	NC_022576	GGA	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989635
67	NC_022576	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
68	NC_022576	TCG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
69	NC_022576	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
70	NC_022576	CGC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
71	NC_022576	TCG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
72	NC_022576	CCG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
73	NC_022576	GCT	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
74	NC_022576	ACC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989635
75	NC_022576	CAT	4	12	4411	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
76	NC_022576	TGC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
77	NC_022576	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989635
78	NC_022576	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989635
79	NC_022576	CTG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
80	NC_022576	CGA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
81	NC_022576	TGC	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
82	NC_022576	ATC	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
83	NC_022576	TCG	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
84	NC_022576	ATC	2	6	4898	4903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989635
85	NC_022576	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989635
86	NC_022576	GCT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
87	NC_022576	CGA	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989635
88	NC_022576	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989635
89	NC_022576	GCT	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989635
90	NC_022576	CAG	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022576	GAT	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989636
92	NC_022576	TTC	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989636
93	NC_022576	GCC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989636
94	NC_022576	TTG	2	6	5919	5924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989636
95	NC_022576	GAC	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989636
96	NC_022576	GGT	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989637
97	NC_022576	GCC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989637
98	NC_022576	AAC	2	6	6105	6110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989637
99	NC_022576	AGG	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989637
100	NC_022576	GGA	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989637
101	NC_022576	CCG	2	6	6138	6143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989637
102	NC_022576	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550989637
103	NC_022576	TTG	2	6	6203	6208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989637
104	NC_022576	TTG	2	6	6215	6220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989637
105	NC_022576	GAT	2	6	6465	6470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989637
106	NC_022576	ATC	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022576	TGT	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022576	GCC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989638
109	NC_022576	AGA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989638
110	NC_022576	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989638
111	NC_022576	CAG	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989638
112	NC_022576	GTT	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989639
113	NC_022576	CAA	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989639
114	NC_022576	GAA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989639
115	NC_022576	TAG	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
116	NC_022576	GAT	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
117	NC_022576	TGG	2	6	7483	7488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
118	NC_022576	TGT	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989639
119	NC_022576	ATT	2	6	7593	7598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
120	NC_022576	GCA	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
121	NC_022576	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989639
122	NC_022576	TGG	2	6	7684	7689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
123	NC_022576	ATG	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
124	NC_022576	TGG	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
125	NC_022576	TGA	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
126	NC_022576	CTG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989639
127	NC_022576	TAG	2	6	7933	7938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989639
128	NC_022576	TAT	2	6	7955	7960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
129	NC_022576	GCA	2	6	8003	8008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
130	NC_022576	TCT	2	6	8018	8023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550989639
131	NC_022576	CAT	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989639
132	NC_022576	ATT	2	6	8257	8262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
133	NC_022576	TGG	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989639
134	NC_022576	GCA	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989639
135	NC_022576	TGT	2	6	8323	8328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989639
136	NC_022576	TTA	2	6	8413	8418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989639
137	NC_022576	GAT	2	6	8616	8621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989640
138	NC_022576	TCG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989640
139	NC_022576	GGA	2	6	8705	8710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550989640
140	NC_022576	GCA	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989640
141	NC_022576	GTT	2	6	8832	8837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989640
142	NC_022576	GCA	2	6	8849	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989640
143	NC_022576	ATC	2	6	8899	8904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989640
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145	NC_022576	CAA	2	6	9170	9175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989640
146	NC_022576	ATC	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989641
147	NC_022576	TAG	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989641
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149	NC_022576	CGA	2	6	9562	9567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989641
150	NC_022576	TGC	2	6	9729	9734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989641
151	NC_022576	AAT	2	6	9823	9828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989641
152	NC_022576	ATG	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989641
153	NC_022576	TGA	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989641
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161	NC_022576	CAG	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989641
162	NC_022576	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989641
163	NC_022576	TGC	2	6	11475	11480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989641
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169	NC_022576	TGT	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550989642
170	NC_022576	TGG	2	6	12310	12315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989642
171	NC_022576	GAT	2	6	12371	12376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989642
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173	NC_022576	TAG	2	6	12438	12443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022576	GAA	2	6	12534	12539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022576	TAT	2	6	12564	12569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_022576	ATA	2	6	12836	12841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989643
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184	NC_022576	TGA	2	6	13237	13242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989643
185	NC_022576	TAA	2	6	13342	13347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_022576	GAT	2	6	13351	13356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022576	TAA	2	6	13369	13374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989644
188	NC_022576	TTA	2	6	13443	13448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989644
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215	NC_022576	CAG	2	6	15406	15411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989646
216	NC_022576	TGA	2	6	15476	15481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989646
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218	NC_022576	TCA	2	6	15607	15612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989646
219	NC_022576	TAG	2	6	15737	15742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989646
220	NC_022576	CAT	2	6	15862	15867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989646
221	NC_022576	TGG	2	6	15950	15955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989646
222	NC_022576	AAT	2	6	15969	15974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989646
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224	NC_022576	ATC	2	6	16030	16035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989646
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227	NC_022576	AAG	2	6	16179	16184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989646
228	NC_022576	CCG	2	6	16191	16196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989646
229	NC_022576	GAA	2	6	16197	16202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989646
230	NC_022576	TGC	2	6	16205	16210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989646
231	NC_022576	ATC	2	6	16219	16224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989646
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235	NC_022576	GAT	2	6	16589	16594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989647
236	NC_022576	CTG	2	6	16711	16716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550989647
237	NC_022576	GAA	2	6	16829	16834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550989647
238	NC_022576	TAA	2	6	16860	16865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989647
239	NC_022576	TGG	2	6	16948	16953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989647
240	NC_022576	TGG	2	6	16970	16975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989647
241	NC_022576	AAC	2	6	16977	16982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550989647
242	NC_022576	ATT	2	6	17059	17064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550989647
243	NC_022576	GCA	2	6	17141	17146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989647
244	NC_022576	AAT	2	6	17173	17178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989647
245	NC_022576	ACT	2	6	17217	17222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989647
246	NC_022576	ATA	2	6	17328	17333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550989647
247	NC_022576	TGG	2	6	17443	17448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
248	NC_022576	AAT	2	6	17453	17458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_022576	TCG	2	6	17547	17552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_022576	CTG	2	6	17556	17561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_022576	CGA	2	6	17714	17719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989648
252	NC_022576	CAT	2	6	17736	17741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550989648
253	NC_022576	GGT	2	6	17757	17762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550989648
254	NC_022576	GCA	2	6	17771	17776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550989648
255	NC_022576	CAC	2	6	17805	17810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550989648
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259	NC_022576	GCC	2	6	18076	18081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550989648
260	NC_022576	GAT	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550989648
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