MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma parvum str. Indiana

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022575	GAATAT	2	12	1168	1179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550986406
2	NC_022575	ATTTAG	2	12	3627	3638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986408
3	NC_022575	AAAGAA	2	12	3749	3760	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986408
4	NC_022575	TGATTT	2	12	4812	4823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550986409
5	NC_022575	TGATTT	2	12	7081	7092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550986413
6	NC_022575	ATTTAG	2	12	8472	8483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986415
7	NC_022575	AGAGAA	2	12	10121	10132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550986417
8	NC_022575	ATTTCT	2	12	10815	10826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550986417
9	NC_022575	TATAAA	2	12	11276	11287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550986418
10	NC_022575	TAAAAA	2	12	15100	15111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986421
11	NC_022575	AGGAGA	2	12	15707	15718	50 %	0 %	50 %	0 %	550986421
12	NC_022575	ACATCA	2	12	17565	17576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	550986424
13	NC_022575	TTTCTT	2	12	21167	21178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986427
14	NC_022575	TTTCCT	2	12	22307	22318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550986427
15	NC_022575	CAGATG	2	12	24047	24058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550986428
16	NC_022575	TTTGGT	2	12	28592	28603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550986431
17	NC_022575	ACTTCA	2	12	29400	29411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550986432
18	NC_022575	AAAAGA	2	12	31052	31063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986434
19	NC_022575	AAAAAG	2	12	31610	31621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986435
20	NC_022575	TTTTTC	2	12	34130	34141	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986442
21	NC_022575	AATGAA	2	12	40696	40707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986449
22	NC_022575	AGAGAA	2	12	41179	41190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550986449
23	NC_022575	TGAATT	2	12	41196	41207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986449
24	NC_022575	TGAATT	2	12	41463	41474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986449
25	NC_022575	TAAAAA	2	12	50724	50735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986458
26	NC_022575	TTTTCT	2	12	51040	51051	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986458
27	NC_022575	TGTTTT	2	12	52820	52831	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	550986459
28	NC_022575	TTATTT	2	12	53736	53747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986460
29	NC_022575	TTATCT	2	12	54678	54689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550986460
30	NC_022575	TATTTT	2	12	58471	58482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986464
31	NC_022575	TGATTG	2	12	59866	59877	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	550986465
32	NC_022575	TTTCAT	2	12	62689	62700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550986469
33	NC_022575	TAATCC	2	12	66953	66964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550986470
34	NC_022575	GCAATT	2	12	68643	68654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550986470
35	NC_022575	ATTTCT	2	12	69033	69044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550986470
36	NC_022575	AAACAT	2	12	70128	70139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550986471
37	NC_022575	TTTATT	2	12	74779	74790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986477
38	NC_022575	ATAACT	2	12	76915	76926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550986479
39	NC_022575	CCATTA	2	12	78500	78511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550986481
40	NC_022575	CTATTA	2	12	80462	80473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550986484
41	NC_022575	AAAAGA	2	12	82652	82663	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986487
42	NC_022575	TTTTGG	2	12	84567	84578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550986489
43	NC_022575	AAAAGA	2	12	84637	84648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986489
44	NC_022575	TTCCAG	2	12	86579	86590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	550986492
45	NC_022575	CAATAT	2	12	89512	89523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550986493
46	NC_022575	GCATAA	2	12	91583	91594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550986496
47	NC_022575	CCTAAA	2	12	92841	92852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	550986497
48	NC_022575	TTTTAT	2	12	95070	95081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986501
49	NC_022575	CTTTAA	2	12	96871	96882	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550986502
50	NC_022575	CCTGTT	2	12	105274	105285	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	550986506
51	NC_022575	AAAAAT	2	12	106968	106979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986509
52	NC_022575	AAAAAT	2	12	111128	111139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986514
53	NC_022575	AGAAAA	2	12	117107	117118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986519
54	NC_022575	GATGAA	2	12	117225	117236	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550986519
55	NC_022575	AGATGG	2	12	118952	118963	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550986519
56	NC_022575	AAAGAA	2	12	123321	123332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986525
57	NC_022575	TGCAAA	2	12	123861	123872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550986526
58	NC_022575	GAAAAC	2	12	124969	124980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550986526
59	NC_022575	AATTCA	2	12	125399	125410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550986527
60	NC_022575	AATAAA	2	12	125910	125921	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986528
61	NC_022575	AATGGT	2	12	126138	126149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550986528
62	NC_022575	TTTAGC	2	12	126824	126835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550986530
63	NC_022575	AAATAA	2	12	127150	127161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986530
64	NC_022575	AGTGGA	2	12	128853	128864	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550986533
65	NC_022575	AATTTA	2	12	129892	129903	50 %	50 %	0 %	0 %	550986534
66	NC_022575	GAGAAA	2	12	133448	133459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550986535
67	NC_022575	TTGTTT	2	12	133644	133655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	550986535
68	NC_022575	AATGAA	2	12	136453	136464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986537
69	NC_022575	GAAAAA	2	12	138128	138139	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986539
70	NC_022575	TAAAGT	2	12	140118	140129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550986542
71	NC_022575	GAAAAA	2	12	141675	141686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986543
72	NC_022575	AAAAGC	2	12	143976	143987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550986545
73	NC_022575	AGAAAA	2	12	147862	147873	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986548
74	NC_022575	AAATAA	2	12	149439	149450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986549
75	NC_022575	AAAGTG	2	12	150138	150149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550986550
76	NC_022575	AAAGAA	2	12	156245	156256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986558
77	NC_022575	ATTTTT	2	12	156351	156362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986559
78	NC_022575	ATTTGA	2	12	160598	160609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986565
79	NC_022575	GAAGGG	2	12	162970	162981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550986568
80	NC_022575	GTTGGT	2	12	164441	164452	0 %	50 %	50 %	0 %	550986569
81	NC_022575	TTTAAG	2	12	165641	165652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986570
82	NC_022575	ATTTGA	2	12	165922	165933	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986570
83	NC_022575	AAAAAT	2	12	166744	166755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986570
84	NC_022575	AAATGG	2	12	167988	167999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550986572
85	NC_022575	AAATAT	2	12	168444	168455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550986573
86	NC_022575	GAAAAA	2	12	168731	168742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986574
87	NC_022575	ATTCAA	2	12	168806	168817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550986574
88	NC_022575	AGATTC	2	12	170235	170246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550986575
89	NC_022575	TATAGT	2	12	171050	171061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986576
90	NC_022575	GATAAA	2	12	173663	173674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986579
91	NC_022575	TCTGAA	2	12	176404	176415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550986580
92	NC_022575	AAAAGA	2	12	176994	177005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986580
93	NC_022575	CTTTTT	2	12	179534	179545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986582
94	NC_022575	GGGAGA	2	12	180792	180803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550986584
95	NC_022575	ATTCAA	2	12	183357	183368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550986586
96	NC_022575	TGAAAA	2	12	183982	183993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986586
97	NC_022575	ATTTTT	2	12	185110	185121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986587
98	NC_022575	GAAAAA	2	12	186754	186765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986588
99	NC_022575	AGCACT	2	12	188290	188301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	550986591
100	NC_022575	GAAAAA	2	12	188989	189000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986592
101	NC_022575	AGAAGC	2	12	189279	189290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550986592
102	NC_022575	AAATCA	2	12	192880	192891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550986597
103	NC_022575	AAAAAT	2	12	195371	195382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550986599
104	NC_022575	ATATTT	2	12	197843	197854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550986600
105	NC_022575	CTTTTT	2	12	198546	198557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986601
106	NC_022575	ATTTTT	2	12	202258	202269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986604
107	NC_022575	GTTTTT	2	12	202329	202340	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	550986604
108	NC_022575	TTGTAA	2	12	202794	202805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986605
109	NC_022575	AATTTC	2	12	203296	203307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550986605
110	NC_022575	CAACAC	2	12	203812	203823	50 %	0 %	0 %	50 %	550986606
111	NC_022575	GAAAAT	2	12	208532	208543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986613
112	NC_022575	ATATTG	2	12	209418	209429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550986614
113	NC_022575	GATAAA	2	12	215552	215563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550986621
114	NC_022575	CTAGAG	2	12	216078	216089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550986621
115	NC_022575	CTTTTT	2	12	216679	216690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986621
116	NC_022575	TTTATT	2	12	218510	218521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550986624
117	NC_022575	AAAAGA	2	12	219707	219718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550986627
118	NC_022575	CTCTTT	2	12	221029	221040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550986628
119	NC_022575	CTTTAG	2	12	221440	221451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550986628
120	NC_022575	ATTTCA	2	12	223178	223189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550986630
121	NC_022575	TAAATT	2	12	225401	225412	50 %	50 %	0 %	0 %	550986632
122	NC_022575	TTTTTC	2	12	228471	228482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550986636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.