MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma parvum str. Indiana

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022575	AGAAA	2	10	2335	2344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022575	TTTTA	2	10	6107	6116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022575	ACTAA	2	10	6195	6204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022575	ATATT	2	10	19116	19125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022575	TTAAT	2	10	19692	19701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022575	AAATA	2	10	27022	27031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022575	AAATT	2	10	31155	31164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022575	TTTAA	2	10	31857	31866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022575	AATAA	2	10	32197	32206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022575	GTAAA	2	10	33631	33640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022575	AATTT	2	10	34410	34419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022575	CAATT	2	10	35583	35592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022575	TTTTA	2	10	39526	39535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022575	CAAAA	2	10	39549	39558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022575	TAATT	2	10	58736	58745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022575	GGCTG	2	10	70874	70883	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022575	ATTTT	2	10	71088	71097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022575	ATTTA	2	10	72858	72867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022575	ATTTT	2	10	73531	73540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022575	ATTTA	2	10	78643	78652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022575	AATTA	2	10	100700	100709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022575	CTAGT	2	10	101850	101859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022575	TTAAG	2	10	103605	103614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022575	AGAGA	2	10	110214	110223	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022575	TTAAT	2	10	114645	114654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022575	TAGAT	2	10	120627	120636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022575	CTTAA	2	10	121601	121610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022575	ATTTA	2	10	127985	127994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022575	ATTAA	2	10	128336	128345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022575	TTATT	2	10	134994	135003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022575	ATTAA	2	10	151682	151691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022575	AATAC	2	10	151857	151866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022575	TTGTT	2	10	153171	153180	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022575	AAAAT	2	10	163856	163865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022575	AGAAT	2	10	165211	165220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022575	CTTAA	2	10	168320	168329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022575	TAGAT	2	10	170893	170902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022575	CAAGT	2	10	175687	175696	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022575	ATGAA	2	10	179016	179025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022575	TTAGT	2	10	187724	187733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022575	AAATT	2	10	188613	188622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022575	TATTT	2	10	191734	191743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022575	AAATA	2	10	198320	198329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022575	AATTA	2	10	202095	202104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022575	AGTTA	2	10	202537	202546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022575	AAATA	2	10	205534	205543	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022575	AATTT	2	10	205667	205676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022575	TACAT	2	10	210527	210536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022575	TTAAT	2	10	227208	227217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022575	TTTAA	2	10	242701	242710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022575	AATTT	2	10	251219	251228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022575	TATTT	2	10	262192	262201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022575	TAAAT	2	10	262718	262727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022575	AAAAT	2	10	275019	275028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022575	ATTCT	2	10	278617	278626	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022575	TTAAA	2	10	291714	291723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022575	TTAGT	2	10	291809	291818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022575	TTAAA	2	10	312890	312899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022575	ATAGT	2	10	320108	320117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022575	ATTTA	2	10	330381	330390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022575	ATTTA	2	10	331683	331692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022575	AAATT	2	10	334844	334853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022575	AAAAT	2	10	338582	338591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022575	ATTTT	2	10	339947	339956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022575	TTAAT	2	10	344804	344813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022575	ATTTT	2	10	356366	356375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022575	TAAAT	2	10	357010	357019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022575	AAATT	2	10	385228	385237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022575	ACTTG	2	10	391663	391672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022575	CTTAA	2	10	393769	393778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022575	TTTTG	2	10	404434	404443	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022575	CTTCT	2	10	410507	410516	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_022575	TAAAT	2	10	410647	410656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022575	CTTCT	2	10	412553	412562	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022575	AACTA	2	10	413785	413794	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022575	ATAAG	2	10	435506	435515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022575	TTAAT	2	10	441389	441398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022575	TAAAT	2	10	449503	449512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022575	CTAAA	2	10	450959	450968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022575	TTTTA	2	10	453543	453552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022575	TACTT	2	10	459730	459739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022575	TTAGT	2	10	462111	462120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022575	CCCTT	2	10	466546	466555	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_022575	TAATT	2	10	466796	466805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022575	TTTAA	2	10	483677	483686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022575	TTCTT	2	10	483713	483722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_022575	GTATT	2	10	488369	488378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022575	AATTT	2	10	488962	488971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022575	TCTAA	2	10	493573	493582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022575	TTTAT	2	10	515650	515659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022575	TAATT	2	10	520300	520309	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022575	TAATT	2	10	527520	527529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022575	TTTAC	2	10	529313	529322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022575	ATTTA	2	10	537584	537593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022575	AAATT	2	10	538647	538656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022575	CTTTA	2	10	542707	542716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022575	TTAAA	2	10	560904	560913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.