MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium saccharobutylicum DSM 13864

Total Repeats: 2464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022571	CTATAT	2	12	201	212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550916529
2	NC_022571	AATCAA	2	12	396	407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916529
3	NC_022571	TAAAAA	2	12	2198	2209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550916530
4	NC_022571	GTTAAT	2	12	2475	2486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916530
5	NC_022571	GTAAGG	2	12	4981	4992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550916534
6	NC_022571	AAACTA	2	12	5545	5556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916534
7	NC_022571	AGCTAG	2	12	5675	5686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550916534
8	NC_022571	AGGAAC	2	12	6924	6935	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550916535
9	NC_022571	CTGGGA	2	12	21149	21160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	550916542
10	NC_022571	TTAGAT	2	12	23920	23931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916542
11	NC_022571	TAGATA	2	12	24817	24828	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916543
12	NC_022571	AGTGTT	2	12	25326	25337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	550916543
13	NC_022571	TTTCAG	2	12	27757	27768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550916543
14	NC_022571	AAAGTT	2	12	34666	34677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916548
15	NC_022571	ACAGAT	2	12	34711	34722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916548
16	NC_022571	ATTAAT	2	12	36807	36818	50 %	50 %	0 %	0 %	550916549
17	NC_022571	TCAAGG	2	12	41586	41597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550916553
18	NC_022571	TAGTTA	2	12	41851	41862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916553
19	NC_022571	TTTAGA	2	12	42158	42169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916553
20	NC_022571	AACTTT	2	12	42506	42517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550916553
21	NC_022571	TCTTAA	2	12	44090	44101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550916554
22	NC_022571	AAGTTA	2	12	47550	47561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916557
23	NC_022571	GATAAT	2	12	47829	47840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916557
24	NC_022571	GCAAAA	2	12	48352	48363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550916558
25	NC_022571	ATTTGG	2	12	49314	49325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	550916558
26	NC_022571	GTCCAG	2	12	50848	50859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	550916560
27	NC_022571	GAATTA	2	12	51803	51814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916561
28	NC_022571	CCAGAA	2	12	55224	55235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	550916562
29	NC_022571	TACAGA	2	12	57423	57434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916565
30	NC_022571	CAAATC	2	12	61787	61798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	550916570
31	NC_022571	TGGCTT	2	12	64861	64872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	550916571
32	NC_022571	TTATGA	2	12	69045	69056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916576
33	NC_022571	GAATTA	2	12	69361	69372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916576
34	NC_022571	GATTTA	2	12	70422	70433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916577
35	NC_022571	TAGAAA	2	12	72504	72515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916580
36	NC_022571	AATGTG	2	12	73605	73616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916580
37	NC_022571	GGTGAA	2	12	75032	75043	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550916580
38	NC_022571	GAAAAA	2	12	75910	75921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550916581
39	NC_022571	ATATTT	2	12	77814	77825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916583
40	NC_022571	AATAGA	2	12	80606	80617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916587
41	NC_022571	ATTTAG	2	12	80961	80972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916587
42	NC_022571	AGTTAA	2	12	82165	82176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916588
43	NC_022571	GCATCT	2	12	82749	82760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	550916589
44	NC_022571	AAAAAT	2	12	82892	82903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550916589
45	NC_022571	TAAAGA	2	12	83339	83350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916589
46	NC_022571	TTAGCA	2	12	85839	85850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916590
47	NC_022571	ATGGAT	2	12	90526	90537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916593
48	NC_022571	GAAAAA	2	12	92154	92165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550916595
49	NC_022571	GATTTA	2	12	96108	96119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550916599
50	NC_022571	CAGATG	2	12	105365	105376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550916606
51	NC_022571	TGAAGT	2	12	105948	105959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916606
52	NC_022571	TTCAAA	2	12	106074	106085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550916606
53	NC_022571	AATTTA	2	12	107522	107533	50 %	50 %	0 %	0 %	550916608
54	NC_022571	GAATTG	2	12	108868	108879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916609
55	NC_022571	CTAAAA	2	12	110440	110451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916610
56	NC_022571	TTTTGA	2	12	113264	113275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550916614
57	NC_022571	ATTTTT	2	12	113935	113946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550916614
58	NC_022571	CCGTAT	2	12	115058	115069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	550916614
59	NC_022571	CAAATA	2	12	116906	116917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550916616
60	NC_022571	GATGGT	2	12	117865	117876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	550916616
61	NC_022571	AATTCT	2	12	120370	120381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550916618
62	NC_022571	ATCTTT	2	12	125177	125188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550916621
63	NC_022571	TTAGAA	2	12	126945	126956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916623
64	NC_022571	GCATAT	2	12	135742	135753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916629
65	NC_022571	GTTAAA	2	12	137570	137581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916630
66	NC_022571	CAAAGA	2	12	140154	140165	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550916632
67	NC_022571	AAAAGG	2	12	144702	144713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550916636
68	NC_022571	AAAGTT	2	12	147583	147594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916642
69	NC_022571	AATAAG	2	12	151032	151043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916643
70	NC_022571	TAGATA	2	12	151676	151687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916643
71	NC_022571	ATATAG	2	12	152199	152210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916644
72	NC_022571	AGGTGG	2	12	154474	154485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	550916646
73	NC_022571	TCTAAG	2	12	155477	155488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916646
74	NC_022571	AGAAAA	2	12	155839	155850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550916646
75	NC_022571	CTGTTA	2	12	159370	159381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550916649
76	NC_022571	AAAAGT	2	12	160652	160663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916650
77	NC_022571	TGTAAA	2	12	161265	161276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916651
78	NC_022571	GATATG	2	12	161545	161556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916651
79	NC_022571	CAAAGA	2	12	162166	162177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550916651
80	NC_022571	AATTTT	2	12	165143	165154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916652
81	NC_022571	AATTAG	2	12	165704	165715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916653
82	NC_022571	AGAAAA	2	12	166701	166712	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550916653
83	NC_022571	GGAATT	2	12	175485	175496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916655
84	NC_022571	ATTAAT	2	12	176910	176921	50 %	50 %	0 %	0 %	550916656
85	NC_022571	TTCACT	2	12	176999	177010	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550916656
86	NC_022571	CTAATG	2	12	178205	178216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916657
87	NC_022571	TTGATC	2	12	179444	179455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550916659
88	NC_022571	GAAAAA	2	12	181276	181287	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550916662
89	NC_022571	GTAAAA	2	12	181771	181782	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916662
90	NC_022571	GCATTA	2	12	183629	183640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916666
91	NC_022571	AATGAT	2	12	184403	184414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916668
92	NC_022571	GTAAAT	2	12	185121	185132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916668
93	NC_022571	CTGAAT	2	12	187466	187477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916669
94	NC_022571	TGAAAC	2	12	188169	188180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916670
95	NC_022571	ATTTAA	2	12	188630	188641	50 %	50 %	0 %	0 %	550916670
96	NC_022571	GGAATA	2	12	191153	191164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550916673
97	NC_022571	AAAATG	2	12	195179	195190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550916677
98	NC_022571	AGATGC	2	12	197204	197215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550916678
99	NC_022571	ATATTT	2	12	198707	198718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550916679
100	NC_022571	ATTAGA	2	12	200795	200806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916682
101	NC_022571	ATGAAT	2	12	201630	201641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916683
102	NC_022571	ACTTCA	2	12	203633	203644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550916687
103	NC_022571	ATCAGT	2	12	204708	204719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916688
104	NC_022571	GGATTA	2	12	205764	205775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916690
105	NC_022571	TCAAGA	2	12	207598	207609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916691
106	NC_022571	AAGATT	2	12	213116	213127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916692
107	NC_022571	CAAGAA	2	12	214978	214989	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550916695
108	NC_022571	AGTTGA	2	12	215082	215093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550916695
109	NC_022571	AAACTG	2	12	215159	215170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916695
110	NC_022571	ATTCAA	2	12	215885	215896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550916695
111	NC_022571	ATGAAT	2	12	217547	217558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916696
112	NC_022571	AAAGGT	2	12	221168	221179	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550916701
113	NC_022571	AATGCT	2	12	225453	225464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916713
114	NC_022571	TGTAAC	3	18	225919	225936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550916714
115	NC_022571	GTTGGT	2	12	226148	226159	0 %	50 %	50 %	0 %	550916714
116	NC_022571	GTAATA	2	12	228702	228713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916719
117	NC_022571	ACAGGA	2	12	229157	229168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550916719
118	NC_022571	ATTGCT	2	12	230002	230013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550916721
119	NC_022571	AGACTA	2	12	231961	231972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916725
120	NC_022571	CTAGAA	2	12	231976	231987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550916725
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133	NC_022571	TATAAT	2	12	258200	258211	50 %	50 %	0 %	0 %	550916750
134	NC_022571	ATAATT	2	12	258621	258632	50 %	50 %	0 %	0 %	550916750
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234	NC_022571	AGTTAA	2	12	432284	432295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550916894
235	NC_022571	AAGGTG	2	12	435014	435025	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	550916898
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466	NC_022571	GATTAA	2	12	887988	887999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550917276
467	NC_022571	TGGTTG	2	12	890887	890898	0 %	50 %	50 %	0 %	550917276
468	NC_022571	AAGAGA	2	12	890977	890988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550917276
469	NC_022571	ATTTCA	2	12	895784	895795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550917284
470	NC_022571	ATTTGA	2	12	898962	898973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550917288
471	NC_022571	ATATAA	2	12	903065	903076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550917292
472	NC_022571	TAAATA	2	12	904530	904541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550917292
473	NC_022571	TATGAA	2	12	905260	905271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550917292
474	NC_022571	GTTATA	2	12	905768	905779	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550917292
475	NC_022571	TATGAT	2	12	905995	906006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550917292
476	NC_022571	AAATCA	2	12	907320	907331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550917292
477	NC_022571	AAATAA	2	12	907611	907622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550917292
478	NC_022571	TATGGA	2	12	910388	910399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550917294
479	NC_022571	TAAGCT	2	12	910734	910745	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550917295
480	NC_022571	ACTGAT	2	12	913450	913461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550917299
481	NC_022571	AATGAT	2	12	916045	916056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550917301
482	NC_022571	TTTTAA	2	12	918387	918398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550917301
483	NC_022571	TAAAAT	2	12	918696	918707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550917301
484	NC_022571	AAATAT	2	12	919437	919448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550917301
485	NC_022571	GATATT	2	12	922117	922128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550917301
486	NC_022571	ATTTGA	2	12	923177	923188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550917302
487	NC_022571	AATTTA	2	12	924241	924252	50 %	50 %	0 %	0 %	550917303
488	NC_022571	AAAGAG	2	12	930843	930854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550917308
489	NC_022571	TTGGAG	2	12	932467	932478	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	550917309
490	NC_022571	ATATTA	2	12	934966	934977	50 %	50 %	0 %	0 %	550917311
491	NC_022571	TCCATT	2	12	934978	934989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550917311
492	NC_022571	GGAAGA	2	12	939870	939881	50 %	0 %	50 %	0 %	550917316
493	NC_022571	ATCTGG	2	12	941622	941633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550917317
494	NC_022571	ATTGTT	2	12	942398	942409	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550917318
495	NC_022571	TTACAG	2	12	945505	945516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550917320
496	NC_022571	AGTATC	2	12	946092	946103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550917321
497	NC_022571	ATTGCT	2	12	946111	946122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550917321
498	NC_022571	GTATTT	2	12	950570	950581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550917324
499	NC_022571	TGATTT	2	12	951342	951353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550917325
500	NC_022571	GAAAAT	2	12	955537	955548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550917329

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