MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium saccharobutylicum DSM 13864

Total Repeats: 5702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022571	ATATC	2	10	1137	1146	40 %	40 %	0 %	20 %	550916529
2	NC_022571	ATTTA	2	10	2381	2390	40 %	60 %	0 %	0 %	550916530
3	NC_022571	CTAAT	2	10	2545	2554	40 %	40 %	0 %	20 %	550916530
4	NC_022571	TAATT	2	10	2576	2585	40 %	60 %	0 %	0 %	550916530
5	NC_022571	AATAA	2	10	2856	2865	80 %	20 %	0 %	0 %	550916531
6	NC_022571	TTATT	2	10	3086	3095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022571	TAGAT	2	10	3358	3367	40 %	40 %	20 %	0 %	550916532
8	NC_022571	ATTAT	2	10	3687	3696	40 %	60 %	0 %	0 %	550916532
9	NC_022571	AGATA	2	10	3718	3727	60 %	20 %	20 %	0 %	550916532
10	NC_022571	AAAGA	2	10	3770	3779	80 %	0 %	20 %	0 %	550916532
11	NC_022571	ATACA	2	10	4316	4325	60 %	20 %	0 %	20 %	550916533
12	NC_022571	CAATT	2	10	6271	6280	40 %	40 %	0 %	20 %	550916534
13	NC_022571	AAGAA	2	10	6392	6401	80 %	0 %	20 %	0 %	550916534
14	NC_022571	ATGAA	2	10	6513	6522	60 %	20 %	20 %	0 %	550916535
15	NC_022571	AATAT	2	10	9209	9218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022571	TCGTG	2	10	10548	10557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022571	TGTTC	2	10	11116	11125	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022571	GGGAG	2	10	11783	11792	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022571	TAAGT	2	10	12312	12321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022571	AGGAT	2	10	12735	12744	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022571	ATATA	2	10	15866	15875	60 %	40 %	0 %	0 %	550916538
22	NC_022571	ATTTA	2	10	16028	16037	40 %	60 %	0 %	0 %	550916538
23	NC_022571	AATAC	2	10	16389	16398	60 %	20 %	0 %	20 %	550916538
24	NC_022571	TATTT	2	10	16466	16475	20 %	80 %	0 %	0 %	550916538
25	NC_022571	AGTTA	2	10	17485	17494	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022571	TTTTA	2	10	17823	17832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022571	TTTAT	2	10	19980	19989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022571	AAAAT	2	10	20006	20015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022571	TTCAT	2	10	20025	20034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022571	TAATA	2	10	20271	20280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022571	AATAT	2	10	20674	20683	60 %	40 %	0 %	0 %	550916541
32	NC_022571	AATCA	2	10	20937	20946	60 %	20 %	0 %	20 %	550916541
33	NC_022571	AGAAT	2	10	22618	22627	60 %	20 %	20 %	0 %	550916542
34	NC_022571	AAATA	2	10	23001	23010	80 %	20 %	0 %	0 %	550916542
35	NC_022571	GATAG	2	10	23905	23914	40 %	20 %	40 %	0 %	550916542
36	NC_022571	TAGGA	2	10	25043	25052	40 %	20 %	40 %	0 %	550916543
37	NC_022571	TCAGA	2	10	25548	25557	40 %	20 %	20 %	20 %	550916543
38	NC_022571	AGAAA	2	10	26097	26106	80 %	0 %	20 %	0 %	550916543
39	NC_022571	AATTT	2	10	27151	27160	40 %	60 %	0 %	0 %	550916543
40	NC_022571	AAAAG	2	10	27338	27347	80 %	0 %	20 %	0 %	550916543
41	NC_022571	GATTG	2	10	27468	27477	20 %	40 %	40 %	0 %	550916543
42	NC_022571	AGAAA	2	10	28215	28224	80 %	0 %	20 %	0 %	550916543
43	NC_022571	GGAAA	2	10	28263	28272	60 %	0 %	40 %	0 %	550916543
44	NC_022571	AATAA	2	10	29028	29037	80 %	20 %	0 %	0 %	550916544
45	NC_022571	TTAGT	2	10	29714	29723	20 %	60 %	20 %	0 %	550916544
46	NC_022571	AGTAG	2	10	31213	31222	40 %	20 %	40 %	0 %	550916546
47	NC_022571	AATTT	2	10	31660	31669	40 %	60 %	0 %	0 %	550916546
48	NC_022571	AAATT	2	10	32296	32305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022571	TTAAT	2	10	33341	33350	40 %	60 %	0 %	0 %	550916547
50	NC_022571	TATGT	2	10	33848	33857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022571	AGAAT	2	10	34156	34165	60 %	20 %	20 %	0 %	550916548
52	NC_022571	TTCAA	2	10	35859	35868	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022571	ATACA	2	10	36003	36012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022571	TTTTC	2	10	38148	38157	0 %	80 %	0 %	20 %	550916550
55	NC_022571	AGAGA	2	10	41075	41084	60 %	0 %	40 %	0 %	550916552
56	NC_022571	GCTTT	2	10	41295	41304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022571	TAATT	2	10	44958	44967	40 %	60 %	0 %	0 %	550916554
58	NC_022571	ATGTT	2	10	47203	47212	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022571	AATAG	2	10	47388	47397	60 %	20 %	20 %	0 %	550916557
60	NC_022571	TTATG	2	10	49128	49137	20 %	60 %	20 %	0 %	550916558
61	NC_022571	AATAA	2	10	50042	50051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022571	AGAAA	2	10	50271	50280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022571	TAATT	2	10	50387	50396	40 %	60 %	0 %	0 %	550916560
64	NC_022571	AAATA	2	10	50435	50444	80 %	20 %	0 %	0 %	550916560
65	NC_022571	ACAAT	2	10	50472	50481	60 %	20 %	0 %	20 %	550916560
66	NC_022571	TAATA	2	10	52066	52075	60 %	40 %	0 %	0 %	550916561
67	NC_022571	ATAGT	2	10	53326	53335	40 %	40 %	20 %	0 %	550916562
68	NC_022571	ATGTA	2	10	53429	53438	40 %	40 %	20 %	0 %	550916562
69	NC_022571	GAATT	2	10	54298	54307	40 %	40 %	20 %	0 %	550916562
70	NC_022571	GATAA	2	10	54978	54987	60 %	20 %	20 %	0 %	550916562
71	NC_022571	ATTCA	2	10	55053	55062	40 %	40 %	0 %	20 %	550916562
72	NC_022571	GTAAG	2	10	55132	55141	40 %	20 %	40 %	0 %	550916562
73	NC_022571	AATTT	2	10	56004	56013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022571	AAATT	2	10	56252	56261	60 %	40 %	0 %	0 %	550916564
75	NC_022571	ATAAA	2	10	59584	59593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022571	CAAAG	2	10	59957	59966	60 %	0 %	20 %	20 %	550916568
77	NC_022571	AGAAT	2	10	61321	61330	60 %	20 %	20 %	0 %	550916570
78	NC_022571	ATATA	2	10	62655	62664	60 %	40 %	0 %	0 %	550916570
79	NC_022571	ATTTG	2	10	64653	64662	20 %	60 %	20 %	0 %	550916571
80	NC_022571	AGCAA	2	10	65615	65624	60 %	0 %	20 %	20 %	550916572
81	NC_022571	TTTCC	2	10	66224	66233	0 %	60 %	0 %	40 %	550916572
82	NC_022571	AAAAC	2	10	67888	67897	80 %	0 %	0 %	20 %	550916574
83	NC_022571	ATTTT	2	10	68625	68634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022571	TTATA	2	10	68723	68732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022571	ATTCT	2	10	69257	69266	20 %	60 %	0 %	20 %	550916576
86	NC_022571	TAATT	2	10	69896	69905	40 %	60 %	0 %	0 %	550916577
87	NC_022571	ATAAA	2	10	70546	70555	80 %	20 %	0 %	0 %	550916577
88	NC_022571	ACTAA	2	10	70572	70581	60 %	20 %	0 %	20 %	550916577
89	NC_022571	ATTAA	2	10	70833	70842	60 %	40 %	0 %	0 %	550916577
90	NC_022571	TAGTT	2	10	73204	73213	20 %	60 %	20 %	0 %	550916580
91	NC_022571	TAATG	2	10	74242	74251	40 %	40 %	20 %	0 %	550916580
92	NC_022571	TAAAT	2	10	74269	74278	60 %	40 %	0 %	0 %	550916580
93	NC_022571	GATAA	2	10	75158	75167	60 %	20 %	20 %	0 %	550916580
94	NC_022571	TATAA	2	10	75544	75553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022571	TATAA	2	10	75874	75883	60 %	40 %	0 %	0 %	550916581
96	NC_022571	AAAGA	2	10	75940	75949	80 %	0 %	20 %	0 %	550916581
97	NC_022571	ATATG	2	10	76485	76494	40 %	40 %	20 %	0 %	550916581
98	NC_022571	TGAAA	2	10	77285	77294	60 %	20 %	20 %	0 %	550916583
99	NC_022571	TAATA	2	10	78665	78674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022571	TTATT	2	10	79004	79013	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022571	TGGTG	2	10	79322	79331	0 %	40 %	60 %	0 %	550916585
102	NC_022571	GGTAT	2	10	81671	81680	20 %	40 %	40 %	0 %	550916587
103	NC_022571	AGTTG	2	10	83780	83789	20 %	40 %	40 %	0 %	550916589
104	NC_022571	TATAA	2	10	84290	84299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022571	ATTTA	2	10	88001	88010	40 %	60 %	0 %	0 %	550916591
106	NC_022571	GATTA	2	10	88870	88879	40 %	40 %	20 %	0 %	550916592
107	NC_022571	ATTAA	2	10	89901	89910	60 %	40 %	0 %	0 %	550916593
108	NC_022571	GAATT	2	10	90025	90034	40 %	40 %	20 %	0 %	550916593
109	NC_022571	TTTTA	2	10	91242	91251	20 %	80 %	0 %	0 %	550916594
110	NC_022571	ATATA	2	10	92548	92557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022571	AGATA	2	10	93320	93329	60 %	20 %	20 %	0 %	550916596
112	NC_022571	AAAAG	2	10	93386	93395	80 %	0 %	20 %	0 %	550916596
113	NC_022571	ATTAG	2	10	93771	93780	40 %	40 %	20 %	0 %	550916596
114	NC_022571	TAAAT	2	10	94727	94736	60 %	40 %	0 %	0 %	550916597
115	NC_022571	TTAAA	2	10	96021	96030	60 %	40 %	0 %	0 %	550916599
116	NC_022571	GAAGT	2	10	96171	96180	40 %	20 %	40 %	0 %	550916599
117	NC_022571	TTGGA	2	10	96223	96232	20 %	40 %	40 %	0 %	550916599
118	NC_022571	CAAAT	2	10	96735	96744	60 %	20 %	0 %	20 %	550916599
119	NC_022571	TAAAA	2	10	96758	96767	80 %	20 %	0 %	0 %	550916599
120	NC_022571	TTTGA	2	10	97909	97918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022571	TATTC	2	10	98311	98320	20 %	60 %	0 %	20 %	550916602
122	NC_022571	AAAAC	2	10	99354	99363	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022571	TATTT	2	10	99930	99939	20 %	80 %	0 %	0 %	550916603
124	NC_022571	AATTA	2	10	100463	100472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022571	AGTAC	2	10	100806	100815	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022571	AGAAA	2	10	101111	101120	80 %	0 %	20 %	0 %	550916604
127	NC_022571	AATAT	2	10	104392	104401	60 %	40 %	0 %	0 %	550916605
128	NC_022571	ATATA	2	10	105066	105075	60 %	40 %	0 %	0 %	550916606
129	NC_022571	TAAAT	2	10	105111	105120	60 %	40 %	0 %	0 %	550916606
130	NC_022571	GAAGA	2	10	105335	105344	60 %	0 %	40 %	0 %	550916606
131	NC_022571	TTAGT	2	10	105584	105593	20 %	60 %	20 %	0 %	550916606
132	NC_022571	TTAAA	2	10	106542	106551	60 %	40 %	0 %	0 %	550916606
133	NC_022571	AGTTA	2	10	106646	106655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022571	GAAAA	2	10	109244	109253	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022571	CTTTT	2	10	114553	114562	0 %	80 %	0 %	20 %	550916614
136	NC_022571	ATACC	2	10	114969	114978	40 %	20 %	0 %	40 %	550916614
137	NC_022571	ATAGC	2	10	115101	115110	40 %	20 %	20 %	20 %	550916614
138	NC_022571	TATTT	2	10	115306	115315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022571	TAAAA	2	10	115623	115632	80 %	20 %	0 %	0 %	550916615
140	NC_022571	AGAAA	2	10	116970	116979	80 %	0 %	20 %	0 %	550916616
141	NC_022571	GCTTC	2	10	117517	117526	0 %	40 %	20 %	40 %	550916616
142	NC_022571	GTTTT	2	10	119529	119538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_022571	ATTTT	2	10	239482	239491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_022571	ATGTA	2	10	239531	239540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_022571	AAGAT	2	10	240295	240304	60 %	20 %	20 %	0 %	550916736
272	NC_022571	ATGAT	2	10	240414	240423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022571	GAATA	2	10	240553	240562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_022571	ATTTT	2	10	403446	403455	20 %	80 %	0 %	0 %	550916872
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445	NC_022571	ATTAT	2	10	405949	405958	40 %	60 %	0 %	0 %	550916873
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465	NC_022571	TAAAA	2	10	425312	425321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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