MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022570	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022570	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022570	AGG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022570	GAA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022570	GCG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022570	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022570	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_022570	CGT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022570	TAA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022570	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022570	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022570	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022570	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022570	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022570	CAG	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022570	CTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022570	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022570	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022570	GCA	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022570	GTC	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022570	GTA	2	6	1306	1311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022570	AAG	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022570	TGA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022570	CCA	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022570	GGA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022570	GCC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022570	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022570	CTG	2	6	2902	2907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022570	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022570	TCA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022570	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022570	CGG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022570	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022570	ACG	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022570	AGT	3	9	4820	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022570	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022570	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_022570	AAT	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022570	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022570	CGC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_022570	CAG	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022570	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022570	CAG	3	9	7384	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022570	TCA	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022570	GGC	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022570	TAA	2	6	7522	7527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022570	CAT	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022570	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022570	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022570	GCA	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022570	GAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022570	TCA	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022570	GGA	2	6	13373	13378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022570	TAA	2	6	13414	13419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022570	GCG	2	6	13506	13511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022570	CGG	2	6	13514	13519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022570	TAA	2	6	14246	14251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022570	AAC	2	6	14349	14354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022570	CAC	2	6	14813	14818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_022570	ATA	2	6	15011	15016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022570	ATT	2	6	15042	15047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022570	AAG	2	6	15120	15125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022570	ATT	2	6	15451	15456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022570	GGA	2	6	15482	15487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022570	GAT	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022570	ACA	2	6	15871	15876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022570	GTT	2	6	15916	15921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022570	ACG	2	6	15958	15963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_022570	GAT	2	6	16039	16044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022570	CAC	2	6	16045	16050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_022570	GGC	2	6	16301	16306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022570	ATG	2	6	16339	16344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022570	TCC	2	6	16354	16359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_022570	ACG	2	6	16444	16449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022570	GCT	2	6	16525	16530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022570	TCA	2	6	16532	16537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022570	TAA	2	6	16594	16599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022570	AGC	2	6	17689	17694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022570	AAC	2	6	17728	17733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022570	GAA	2	6	17758	17763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022570	ATA	2	6	17825	17830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022570	ATC	2	6	17884	17889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022570	AGA	2	6	17918	17923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022570	TCT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022570	TTA	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022570	CTG	2	6	18003	18008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022570	AAT	2	6	18037	18042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022570	CAT	2	6	18425	18430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022570	CAG	2	6	18438	18443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022570	TCC	2	6	18456	18461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022570	AAC	2	6	18499	18504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022570	CAG	2	6	18775	18780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022570	AGA	2	6	18815	18820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022570	GAC	2	6	19428	19433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022570	TCT	2	6	19587	19592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022570	CTG	2	6	19648	19653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022570	TGT	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022570	GGC	2	6	19970	19975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022570	GGC	2	6	22849	22854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022570	GCG	2	6	22899	22904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022570	GCT	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022570	GCG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022570	ATG	2	6	24024	24029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022570	CGC	2	6	24043	24048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022570	CAG	2	6	24056	24061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022570	GAC	2	6	24065	24070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022570	TCC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_022570	CCA	2	6	24221	24226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_022570	GCC	2	6	24319	24324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022570	ACC	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022570	CGA	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022570	CGG	2	6	24482	24487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022570	CGG	2	6	24498	24503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022570	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022570	GCA	2	6	24576	24581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022570	GCC	3	9	24640	24648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022570	CAC	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_022570	TTC	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022570	ATA	2	6	26960	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022570	TAA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022570	ATT	2	6	27938	27943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022570	AAG	2	6	28051	28056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022570	ACT	2	6	28080	28085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022570	TGC	2	6	30042	30047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022570	CTG	2	6	30109	30114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022570	ACT	2	6	30118	30123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022570	ATG	2	6	30913	30918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022570	ATT	2	6	30973	30978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022570	CTG	2	6	31033	31038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022570	CAA	2	6	31074	31079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022570	AAC	2	6	31095	31100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022570	AAC	2	6	31132	31137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022570	TTC	2	6	31205	31210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022570	CCA	2	6	31258	31263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_022570	GGA	2	6	31341	31346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022570	AAT	2	6	32335	32340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022570	ATG	2	6	32501	32506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022570	AAC	2	6	32518	32523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022570	AAT	2	6	32563	32568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022570	TTA	2	6	32707	32712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022570	TAG	2	6	32836	32841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.