MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022570	G	9	9	914	922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022570	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	550903931
3	NC_022570	A	6	6	3642	3647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022570	T	6	6	4134	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	550903937
5	NC_022570	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	550903937
6	NC_022570	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	550903937
7	NC_022570	A	7	7	4696	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	550903937
8	NC_022570	C	7	7	4774	4780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_022570	A	6	6	4903	4908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022570	T	7	7	5539	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	550903938
11	NC_022570	T	6	6	5977	5982	0 %	100 %	0 %	0 %	550903939
12	NC_022570	A	6	6	7265	7270	100 %	0 %	0 %	0 %	550903940
13	NC_022570	A	6	6	7464	7469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022570	T	6	6	8482	8487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022570	C	6	6	9382	9387	0 %	0 %	0 %	100 %	550903943
16	NC_022570	C	6	6	9913	9918	0 %	0 %	0 %	100 %	550903944
17	NC_022570	C	6	6	11009	11014	0 %	0 %	0 %	100 %	550903946
18	NC_022570	T	6	6	12279	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	550903946
19	NC_022570	C	7	7	13345	13351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_022570	T	6	6	14109	14114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022570	A	6	6	14889	14894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022570	A	6	6	14944	14949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022570	A	6	6	14951	14956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022570	A	6	6	14980	14985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022570	A	6	6	15004	15009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022570	A	6	6	15129	15134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022570	T	7	7	15361	15367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022570	A	6	6	15386	15391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022570	A	6	6	15530	15535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022570	A	6	6	15739	15744	100 %	0 %	0 %	0 %	550903949
31	NC_022570	A	6	6	15945	15950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022570	T	6	6	17626	17631	0 %	100 %	0 %	0 %	550903951
33	NC_022570	T	7	7	18087	18093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022570	A	6	6	19021	19026	100 %	0 %	0 %	0 %	550903953
35	NC_022570	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022570	A	6	6	19767	19772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022570	A	6	6	20079	20084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022570	A	6	6	21420	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	550903957
39	NC_022570	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	550903959
40	NC_022570	G	6	6	22870	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022570	A	6	6	22944	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022570	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022570	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	550903963
44	NC_022570	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022570	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
46	NC_022570	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
47	NC_022570	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
48	NC_022570	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022570	G	6	6	27069	27074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022570	T	8	8	27960	27967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022570	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022570	A	6	6	28013	28018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022570	A	7	7	31689	31695	100 %	0 %	0 %	0 %	550903969
54	NC_022570	T	6	6	31794	31799	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
55	NC_022570	T	6	6	31952	31957	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
56	NC_022570	T	6	6	31990	31995	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
57	NC_022570	T	6	6	32289	32294	0 %	100 %	0 %	0 %	550903969
58	NC_022570	T	10	10	32322	32331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022570	A	6	6	32345	32350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022570	A	6	6	32613	32618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022570	C	6	6	33995	34000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_022570	T	6	6	34753	34758	0 %	100 %	0 %	0 %	550903971
63	NC_022570	A	6	6	37434	37439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022570	T	6	6	37653	37658	0 %	100 %	0 %	0 %	550903974
65	NC_022570	G	6	6	38563	38568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022570	T	6	6	43053	43058	0 %	100 %	0 %	0 %	550903980
67	NC_022570	A	6	6	43438	43443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022570	T	6	6	43499	43504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022570	A	6	6	43787	43792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022570	G	6	6	46613	46618	0 %	0 %	100 %	0 %	550903983
71	NC_022570	T	7	7	47207	47213	0 %	100 %	0 %	0 %	550903983
72	NC_022570	T	6	6	49162	49167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022570	A	6	6	49664	49669	100 %	0 %	0 %	0 %	550903987
74	NC_022570	T	6	6	51758	51763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022570	A	6	6	52306	52311	100 %	0 %	0 %	0 %	550903990
76	NC_022570	A	6	6	52739	52744	100 %	0 %	0 %	0 %	550903991
77	NC_022570	A	6	6	53220	53225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022570	G	6	6	53245	53250	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022570	A	6	6	53584	53589	100 %	0 %	0 %	0 %	550903992
80	NC_022570	T	7	7	53651	53657	0 %	100 %	0 %	0 %	550903992
81	NC_022570	A	6	6	57128	57133	100 %	0 %	0 %	0 %	550903995
82	NC_022570	T	6	6	57574	57579	0 %	100 %	0 %	0 %	550903996
83	NC_022570	T	6	6	57957	57962	0 %	100 %	0 %	0 %	550903997
84	NC_022570	A	6	6	58810	58815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022570	T	6	6	59046	59051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022570	T	6	6	59167	59172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022570	A	6	6	59792	59797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022570	A	6	6	60139	60144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022570	C	6	6	60351	60356	0 %	0 %	0 %	100 %	550903998
90	NC_022570	A	6	6	60931	60936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022570	A	6	6	61073	61078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022570	A	7	7	61582	61588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022570	T	7	7	62050	62056	0 %	100 %	0 %	0 %	550904000
94	NC_022570	T	6	6	62138	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	550904000
95	NC_022570	T	10	10	62381	62390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022570	A	6	6	63282	63287	100 %	0 %	0 %	0 %	550904002
97	NC_022570	T	6	6	63803	63808	0 %	100 %	0 %	0 %	550904003
98	NC_022570	A	6	6	63981	63986	100 %	0 %	0 %	0 %	550904003
99	NC_022570	G	6	6	65521	65526	0 %	0 %	100 %	0 %	550904005
100	NC_022570	A	6	6	66691	66696	100 %	0 %	0 %	0 %	550904006
101	NC_022570	T	6	6	67411	67416	0 %	100 %	0 %	0 %	550904008
102	NC_022570	A	6	6	67826	67831	100 %	0 %	0 %	0 %	550904010
103	NC_022570	A	8	8	69176	69183	100 %	0 %	0 %	0 %	550904011
104	NC_022570	A	6	6	70427	70432	100 %	0 %	0 %	0 %	550904011
105	NC_022570	T	6	6	71467	71472	0 %	100 %	0 %	0 %	550904012
106	NC_022570	A	6	6	71488	71493	100 %	0 %	0 %	0 %	550904012
107	NC_022570	G	6	6	73368	73373	0 %	0 %	100 %	0 %	550904015
108	NC_022570	G	6	6	76754	76759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022570	A	6	6	77067	77072	100 %	0 %	0 %	0 %	550904019
110	NC_022570	T	6	6	77647	77652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022570	T	7	7	77843	77849	0 %	100 %	0 %	0 %	550904020
112	NC_022570	A	6	6	78754	78759	100 %	0 %	0 %	0 %	550904022
113	NC_022570	T	6	6	78902	78907	0 %	100 %	0 %	0 %	550904022
114	NC_022570	G	6	6	79028	79033	0 %	0 %	100 %	0 %	550904022
115	NC_022570	T	6	6	80492	80497	0 %	100 %	0 %	0 %	550904023
116	NC_022570	G	6	6	80516	80521	0 %	0 %	100 %	0 %	550904023
117	NC_022570	A	6	6	82494	82499	100 %	0 %	0 %	0 %	550904023
118	NC_022570	A	8	8	82918	82925	100 %	0 %	0 %	0 %	550904024
119	NC_022570	A	6	6	84320	84325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022570	T	6	6	84778	84783	0 %	100 %	0 %	0 %	550904026
121	NC_022570	A	6	6	84889	84894	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
122	NC_022570	A	6	6	85391	85396	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
123	NC_022570	A	6	6	86395	86400	100 %	0 %	0 %	0 %	550904026
124	NC_022570	C	6	6	86491	86496	0 %	0 %	0 %	100 %	550904026
125	NC_022570	T	6	6	86921	86926	0 %	100 %	0 %	0 %	550904027
126	NC_022570	T	6	6	87019	87024	0 %	100 %	0 %	0 %	550904027
127	NC_022570	C	6	6	91323	91328	0 %	0 %	0 %	100 %	550904028
128	NC_022570	T	6	6	93338	93343	0 %	100 %	0 %	0 %	550904029
129	NC_022570	A	8	8	93613	93620	100 %	0 %	0 %	0 %	550904030

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.