MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022568	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022568	AGAAAA	2	12	76628	76639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022568	AATAAA	2	12	194013	194024	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022568	GAAAAC	2	12	221036	221047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022568	ATTCAA	2	12	231923	231934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022568	AAGGAA	2	12	233494	233505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022568	TAGGCG	2	12	235147	235158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022568	ATTCAA	2	12	237945	237956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022568	AAGGAA	2	12	239516	239527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022568	TAGGCG	2	12	241169	241180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022568	AGTCAA	2	12	242984	242995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022568	TTATAT	2	12	257767	257778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022568	AACTTT	2	12	282830	282841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022568	AATACA	2	12	291421	291432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022568	TTGGTT	2	12	332633	332644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022568	AAATGA	2	12	389099	389110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022568	ATGATA	2	12	390918	390929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022568	AGTGCT	2	12	402549	402560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022568	TTGTTT	2	12	411228	411239	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022568	ACAAAA	2	12	466251	466262	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022568	TTAAAT	2	12	489768	489779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022568	CTATAA	2	12	491537	491548	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022568	AGATTT	2	12	551050	551061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022568	ATCATT	2	12	621185	621196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022568	ATCATT	2	12	663859	663870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022568	GTTTTA	2	12	691132	691143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022568	TATAGG	2	12	708350	708361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022568	ATCTCA	2	12	738402	738413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022568	TTACTT	2	12	834969	834980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022568	TGAAAT	2	12	844837	844848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022568	ATAAAA	2	12	863959	863970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022568	AAATAG	2	12	871439	871450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022568	GTAATC	2	12	878241	878252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022568	TTACAA	2	12	878259	878270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022568	ATGAAA	2	12	886865	886876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022568	TTGACT	2	12	1010894	1010905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022568	AGGAAG	2	12	1021087	1021098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022568	CTTTTT	2	12	1080827	1080838	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022568	TTATGG	2	12	1119019	1119030	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022568	TTTAGT	2	12	1123027	1123038	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022568	TTTTAA	2	12	1157571	1157582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022568	CTTTTT	2	12	1195565	1195576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022568	GAAAAA	2	12	1225548	1225559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022568	GATATT	2	12	1230922	1230933	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022568	AAGACG	2	12	1245009	1245020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022568	TATTAA	2	12	1295606	1295617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022568	TATTAA	2	12	1446357	1446368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022568	ATAAAA	2	12	1480536	1480547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022568	CTCTTC	2	12	1591604	1591615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022568	GGTATA	2	12	1624859	1624870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022568	TAATTA	2	12	1627928	1627939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022568	GGTTGT	2	12	1642255	1642266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022568	GGTTGT	2	12	1643726	1643737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022568	AAGAAT	2	12	1645278	1645289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022568	GTAAAC	2	12	1646431	1646442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022568	AAAATA	2	12	1659374	1659385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022568	TAAAAA	2	12	1660284	1660295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022568	TAAAAA	2	12	1687027	1687038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022568	AAATAA	2	12	1704292	1704303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022568	ATGAAA	2	12	1705982	1705993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022568	CGCCTA	2	12	1746767	1746778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022568	TTTCCT	2	12	1748419	1748430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022568	AAAAAC	2	12	1820306	1820317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022568	CGCCTA	2	12	1850740	1850751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022568	TTTCCT	2	12	1852392	1852403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022568	TTGAAT	2	12	1853964	1853975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022568	GTTTTA	2	12	1861883	1861894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022568	AAAAAG	2	12	1944018	1944029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022568	CTCTAT	2	12	1961737	1961748	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022568	TCATTT	2	12	1962935	1962946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022568	CATTTT	2	12	1971267	1971278	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022568	GTTTTC	2	12	1990103	1990114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022568	CAAAAA	2	12	2007829	2007840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022568	GAAAAA	2	12	2011690	2011701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022568	AGAAAA	2	12	2018525	2018536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022568	TTTTAT	2	12	2107386	2107397	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022568	ATTCAA	2	12	2165024	2165035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022568	TTATAT	2	12	2227973	2227984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022568	TAGTAA	2	12	2280330	2280341	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022568	AATTTT	2	12	2282052	2282063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022568	AAATTG	2	12	2288227	2288238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022568	CTCTGT	2	12	2295073	2295084	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022568	TAATAC	2	12	2378822	2378833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022568	CGCCTA	2	12	2399567	2399578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022568	TTTCCT	2	12	2401470	2401481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022568	TTGAAT	2	12	2403042	2403053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022568	TAAAAT	2	12	2477835	2477846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022568	TTCAAA	2	12	2486477	2486488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022568	CTTTTT	2	12	2551705	2551716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_022568	ATCCCA	2	12	2571620	2571631	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022568	AAAAGA	2	12	2577451	2577462	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022568	TTTTTA	2	12	2583447	2583458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022568	CGCCTA	2	12	2633461	2633472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022568	TTTCCT	2	12	2635364	2635375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022568	TTGAAT	2	12	2636936	2636947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022568	TTATCA	2	12	2643181	2643192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022568	TCTAGG	2	12	2643909	2643920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022568	CCTCTT	2	12	2688551	2688562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022568	TAAATC	2	12	2710022	2710033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022568	TTAACT	2	12	2824513	2824524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022568	AAATGA	2	12	2850748	2850759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022568	AAGTAT	2	12	2851685	2851696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022568	CAGAGA	2	12	2854617	2854628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022568	TCTGAC	2	12	2854679	2854690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.