MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 1019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022568	GAAATT	2	12	6232	6243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550896185
2	NC_022568	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	550896185
3	NC_022568	TGAAGA	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550896186
4	NC_022568	TTATTT	2	12	10919	10930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550896187
5	NC_022568	CACATT	2	12	11200	11211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550896187
6	NC_022568	GCAAAA	2	12	14090	14101	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550896190
7	NC_022568	ATTTTC	2	12	19879	19890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896194
8	NC_022568	CTTCAT	2	12	20896	20907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550896196
9	NC_022568	TTTTGG	2	12	21260	21271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550896196
10	NC_022568	AGTTGC	2	12	23649	23660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896198
11	NC_022568	TAAAGC	2	12	23702	23713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550896198
12	NC_022568	ATTGAA	2	12	24909	24920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550896199
13	NC_022568	TCGATT	2	12	32439	32450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	550896208
14	NC_022568	TCACCA	2	12	32721	32732	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	550896209
15	NC_022568	CGATTA	2	12	38151	38162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896213
16	NC_022568	TTATGT	2	12	42637	42648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550896216
17	NC_022568	AAAGAT	2	12	46290	46301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896219
18	NC_022568	TGAAAT	2	12	47127	47138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550896220
19	NC_022568	TGGCGG	2	12	50262	50273	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	550896224
20	NC_022568	TCAAAA	2	12	50382	50393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550896224
21	NC_022568	ACAGTG	2	12	51965	51976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550896227
22	NC_022568	AAAAAT	2	12	52829	52840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550896229
23	NC_022568	TTTATA	2	12	55307	55318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550896231
24	NC_022568	GCAGAA	2	12	56754	56765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550896231
25	NC_022568	AGGTAA	2	12	56845	56856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550896232
26	NC_022568	TGATCG	2	12	58233	58244	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896233
27	NC_022568	TGATTT	2	12	63578	63589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550896236
28	NC_022568	TTTTGC	2	12	64183	64194	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	550896237
29	NC_022568	TAAATT	2	12	76493	76504	50 %	50 %	0 %	0 %	550896250
30	NC_022568	ATTATA	2	12	81268	81279	50 %	50 %	0 %	0 %	550896256
31	NC_022568	ATCACT	2	12	86295	86306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550896261
32	NC_022568	AAACAC	2	12	86728	86739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550896261
33	NC_022568	AAGATA	2	12	89727	89738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896261
34	NC_022568	TATAAA	2	12	91945	91956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550896262
35	NC_022568	TATTAG	2	12	102176	102187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550896272
36	NC_022568	TAAAAT	2	12	112011	112022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550896283
37	NC_022568	CAAAAT	2	12	112152	112163	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550896283
38	NC_022568	GTCCGC	2	12	112284	112295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	550896283
39	NC_022568	GTTTTA	2	12	118919	118930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550896291
40	NC_022568	TGATTT	2	12	120933	120944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550896295
41	NC_022568	AAGTAA	2	12	124904	124915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896298
42	NC_022568	TAGAAA	2	12	131125	131136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896306
43	NC_022568	CAACTG	2	12	138175	138186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	550896314
44	NC_022568	GTTGCA	2	12	147079	147090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896327
45	NC_022568	GATTGC	2	12	147141	147152	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896327
46	NC_022568	TTAAAA	2	12	147815	147826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550896328
47	NC_022568	GGCGGT	2	12	152792	152803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	550896331
48	NC_022568	CGAATT	2	12	155443	155454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896332
49	NC_022568	GTAAAA	2	12	158595	158606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896335
50	NC_022568	TTTTAC	2	12	160642	160653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896339
51	NC_022568	TTTTTA	2	12	161680	161691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550896341
52	NC_022568	AAAGTG	2	12	162892	162903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550896342
53	NC_022568	TACTAG	2	12	167905	167916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896345
54	NC_022568	AAGCGA	2	12	170409	170420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550896347
55	NC_022568	CAATCC	2	12	173725	173736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	550896350
56	NC_022568	AAAGAT	2	12	175736	175747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896352
57	NC_022568	ATGGCT	2	12	176861	176872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896353
58	NC_022568	CAGAAA	2	12	177535	177546	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550896353
59	NC_022568	AAAAGA	2	12	177611	177622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550896353
60	NC_022568	AAAAAC	2	12	177941	177952	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	550896353
61	NC_022568	TGAAGT	2	12	179981	179992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550896353
62	NC_022568	CATTGA	2	12	188114	188125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896360
63	NC_022568	TGCAGC	2	12	188769	188780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	550896361
64	NC_022568	TAAAAA	2	12	191007	191018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550896363
65	NC_022568	TCCGGT	2	12	192107	192118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550896365
66	NC_022568	CGTTTG	2	12	199777	199788	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	550896372
67	NC_022568	AAAGCA	2	12	204215	204226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550896375
68	NC_022568	TTCTTT	2	12	209019	209030	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550896381
69	NC_022568	AGTATC	2	12	209271	209282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896381
70	NC_022568	GAAAAA	2	12	211114	211125	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550896383
71	NC_022568	AGGAAA	2	12	211433	211444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550896383
72	NC_022568	GAAAAA	2	12	212339	212350	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550896385
73	NC_022568	AAGGAG	2	12	216276	216287	50 %	0 %	50 %	0 %	550896386
74	NC_022568	GCAAGT	2	12	218166	218177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550896388
75	NC_022568	TTAAAG	2	12	220109	220120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550896390
76	NC_022568	TGTCGG	2	12	222085	222096	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	550896391
77	NC_022568	GCAGAA	2	12	225114	225125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550896393
78	NC_022568	TCTCCA	2	12	225952	225963	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	550896394
79	NC_022568	GGTTTT	2	12	227663	227674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550896395
80	NC_022568	ATTGAT	2	12	228610	228621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550896397
81	NC_022568	CAGAAC	2	12	229635	229646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	550896399
82	NC_022568	TTTACC	2	12	243413	243424	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550896401
83	NC_022568	AGTAAA	2	12	250669	250680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896408
84	NC_022568	AAAGGA	2	12	253929	253940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550896411
85	NC_022568	ACAGTA	2	12	258096	258107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550896417
86	NC_022568	AAAACA	2	12	258471	258482	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	550896418
87	NC_022568	GCATGG	2	12	258652	258663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	550896418
88	NC_022568	CTGTAG	2	12	261596	261607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896423
89	NC_022568	GACAAT	2	12	263414	263425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550896426
90	NC_022568	AAGAAA	2	12	265997	266008	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	550896427
91	NC_022568	TACACT	2	12	270241	270252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550896428
92	NC_022568	TTCGTG	2	12	271753	271764	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	550896428
93	NC_022568	CCAAAT	2	12	277741	277752	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	550896432
94	NC_022568	GAATTA	2	12	280349	280360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550896434
95	NC_022568	CGAAAT	2	12	284649	284660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550896438
96	NC_022568	TCTTTT	2	12	287612	287623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	550896440
97	NC_022568	AGTTCA	2	12	289876	289887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896442
98	NC_022568	ATCAAT	2	12	290019	290030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550896442
99	NC_022568	ATGAAA	2	12	290377	290388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896443
100	NC_022568	CTTTTA	2	12	292250	292261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896445
101	NC_022568	TAGAAA	2	12	293196	293207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896446
102	NC_022568	ACGTTG	2	12	295127	295138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550896448
103	NC_022568	GAAAAC	2	12	297034	297045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	550896449
104	NC_022568	TCAATT	2	12	298869	298880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	550896451
105	NC_022568	GCTGCG	2	12	305121	305132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	550896459
106	NC_022568	TTTTGA	2	12	305521	305532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550896459
107	NC_022568	AAATAA	2	12	308828	308839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	550896462
108	NC_022568	GAAGGG	2	12	310625	310636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550896463
109	NC_022568	GATTCA	2	12	314269	314280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896466
110	NC_022568	GCAATT	2	12	314299	314310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896466
111	NC_022568	TCTTTA	2	12	318050	318061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896472
112	NC_022568	AGTAAC	2	12	319196	319207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550896473
113	NC_022568	TCATAA	2	12	320430	320441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	550896473
114	NC_022568	TTTTCA	2	12	325085	325096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896476
115	NC_022568	GAACCA	2	12	329615	329626	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	550896480
116	NC_022568	TCCATT	2	12	332223	332234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550896483
117	NC_022568	GTAGAT	2	12	337410	337421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550896489
118	NC_022568	TTTTAC	2	12	340569	340580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	550896492
119	NC_022568	ATTATA	2	12	340714	340725	50 %	50 %	0 %	0 %	550896492
120	NC_022568	TAGTAT	2	12	340960	340971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550896492
121	NC_022568	CTGGTT	2	12	343324	343335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	550896495
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123	NC_022568	GACTTA	2	12	352362	352373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550896505
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221	NC_022568	TGCTGG	2	12	635169	635180	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	550896783
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227	NC_022568	AAGATG	2	12	647771	647782	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550896797
228	NC_022568	CAGTGA	2	12	649274	649285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550896797
229	NC_022568	GTAAAA	2	12	650458	650469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	550896797
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231	NC_022568	TATTTT	2	12	660329	660340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	550896808
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343	NC_022568	ATTATG	2	12	1026330	1026341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	550897190
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346	NC_022568	TGATTT	2	12	1029115	1029126	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550897193
347	NC_022568	TGTGTT	2	12	1034750	1034761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550897200
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452	NC_022568	TGGCGG	2	12	1384189	1384200	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	550897583
453	NC_022568	GAAGCA	2	12	1384265	1384276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550897583
454	NC_022568	TTACCA	2	12	1386284	1386295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550897586
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456	NC_022568	TACTTC	2	12	1389998	1390009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	550897591
457	NC_022568	ATGATA	2	12	1390414	1390425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	550897591
458	NC_022568	TGGAAA	2	12	1393028	1393039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	550897593
459	NC_022568	GGACAA	2	12	1398689	1398700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550897598
460	NC_022568	CGATTG	2	12	1401421	1401432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550897600
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