MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 2167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022568	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022568	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	550896181
3	NC_022568	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	550896181
4	NC_022568	TTTAT	2	10	4207	4216	20 %	80 %	0 %	0 %	550896182
5	NC_022568	TTTGT	2	10	4328	4337	0 %	80 %	20 %	0 %	550896182
6	NC_022568	CAAAA	2	10	7074	7083	80 %	0 %	0 %	20 %	550896185
7	NC_022568	TTGAT	2	10	11756	11765	20 %	60 %	20 %	0 %	550896187
8	NC_022568	TTTTA	2	10	12429	12438	20 %	80 %	0 %	0 %	550896188
9	NC_022568	GTATG	2	10	13372	13381	20 %	40 %	40 %	0 %	550896189
10	NC_022568	AAAGA	2	10	14387	14396	80 %	0 %	20 %	0 %	550896190
11	NC_022568	ATGAA	2	10	17250	17259	60 %	20 %	20 %	0 %	550896192
12	NC_022568	GAATG	2	10	18992	19001	40 %	20 %	40 %	0 %	550896193
13	NC_022568	TAATT	2	10	20370	20379	40 %	60 %	0 %	0 %	550896196
14	NC_022568	ATTAA	2	10	21887	21896	60 %	40 %	0 %	0 %	550896197
15	NC_022568	AAATC	2	10	22348	22357	60 %	20 %	0 %	20 %	550896197
16	NC_022568	AACAT	2	10	22509	22518	60 %	20 %	0 %	20 %	550896197
17	NC_022568	TTTTA	2	10	23126	23135	20 %	80 %	0 %	0 %	550896198
18	NC_022568	GACCA	2	10	23210	23219	40 %	0 %	20 %	40 %	550896198
19	NC_022568	TGGAT	2	10	23469	23478	20 %	40 %	40 %	0 %	550896198
20	NC_022568	CAAAA	2	10	24470	24479	80 %	0 %	0 %	20 %	550896199
21	NC_022568	ATTAT	2	10	24955	24964	40 %	60 %	0 %	0 %	550896200
22	NC_022568	TCAGG	2	10	26124	26133	20 %	20 %	40 %	20 %	550896202
23	NC_022568	TTTAC	2	10	27124	27133	20 %	60 %	0 %	20 %	550896203
24	NC_022568	GAAAA	2	10	33066	33075	80 %	0 %	20 %	0 %	550896209
25	NC_022568	TGAAA	2	10	34221	34230	60 %	20 %	20 %	0 %	550896210
26	NC_022568	GAATG	2	10	36092	36101	40 %	20 %	40 %	0 %	550896212
27	NC_022568	AAATT	2	10	36219	36228	60 %	40 %	0 %	0 %	550896212
28	NC_022568	ATGGA	2	10	38340	38349	40 %	20 %	40 %	0 %	550896213
29	NC_022568	AAAAC	2	10	40446	40455	80 %	0 %	0 %	20 %	550896214
30	NC_022568	TTATT	2	10	41935	41944	20 %	80 %	0 %	0 %	550896216
31	NC_022568	AAAAG	2	10	43149	43158	80 %	0 %	20 %	0 %	550896216
32	NC_022568	ATAAA	2	10	43973	43982	80 %	20 %	0 %	0 %	550896217
33	NC_022568	ATTTT	2	10	45778	45787	20 %	80 %	0 %	0 %	550896219
34	NC_022568	GAAAC	2	10	47036	47045	60 %	0 %	20 %	20 %	550896220
35	NC_022568	GACTT	2	10	47275	47284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022568	ATTTT	2	10	47362	47371	20 %	80 %	0 %	0 %	550896221
37	NC_022568	AAATG	2	10	48492	48501	60 %	20 %	20 %	0 %	550896222
38	NC_022568	ATGGT	2	10	49529	49538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022568	GTAGA	2	10	49578	49587	40 %	20 %	40 %	0 %	550896223
40	NC_022568	TTACT	2	10	50560	50569	20 %	60 %	0 %	20 %	550896225
41	NC_022568	GAAAT	2	10	51218	51227	60 %	20 %	20 %	0 %	550896226
42	NC_022568	CTTAG	2	10	51317	51326	20 %	40 %	20 %	20 %	550896226
43	NC_022568	TAAAA	2	10	52567	52576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022568	TGCTA	2	10	52741	52750	20 %	40 %	20 %	20 %	550896229
45	NC_022568	TTTTA	2	10	52909	52918	20 %	80 %	0 %	0 %	550896229
46	NC_022568	AGTTA	2	10	54225	54234	40 %	40 %	20 %	0 %	550896230
47	NC_022568	TTATG	2	10	54774	54783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022568	AGTCT	2	10	55690	55699	20 %	40 %	20 %	20 %	550896231
49	NC_022568	CGCAA	2	10	57738	57747	40 %	0 %	20 %	40 %	550896233
50	NC_022568	TTTTA	2	10	58686	58695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022568	AAACG	2	10	63069	63078	60 %	0 %	20 %	20 %	550896236
52	NC_022568	ATTAT	2	10	64037	64046	40 %	60 %	0 %	0 %	550896236
53	NC_022568	CGAAA	2	10	64555	64564	60 %	0 %	20 %	20 %	550896237
54	NC_022568	AAAAC	2	10	64565	64574	80 %	0 %	0 %	20 %	550896237
55	NC_022568	AACAA	2	10	65988	65997	80 %	0 %	0 %	20 %	550896239
56	NC_022568	ATGGA	2	10	72685	72694	40 %	20 %	40 %	0 %	550896245
57	NC_022568	AAAAT	2	10	72713	72722	80 %	20 %	0 %	0 %	550896246
58	NC_022568	ATGGA	2	10	73230	73239	40 %	20 %	40 %	0 %	550896246
59	NC_022568	GTATA	2	10	74100	74109	40 %	40 %	20 %	0 %	550896247
60	NC_022568	TATTT	2	10	74240	74249	20 %	80 %	0 %	0 %	550896248
61	NC_022568	ATATA	2	10	74495	74504	60 %	40 %	0 %	0 %	550896248
62	NC_022568	TTTTA	2	10	76119	76128	20 %	80 %	0 %	0 %	550896250
63	NC_022568	TCCAA	2	10	77759	77768	40 %	20 %	0 %	40 %	550896252
64	NC_022568	GCTTG	2	10	78095	78104	0 %	40 %	40 %	20 %	550896252
65	NC_022568	AAACT	2	10	78105	78114	60 %	20 %	0 %	20 %	550896252
66	NC_022568	TCAAG	2	10	78770	78779	40 %	20 %	20 %	20 %	550896253
67	NC_022568	GCGCT	2	10	80151	80160	0 %	20 %	40 %	40 %	550896254
68	NC_022568	TGATT	2	10	80894	80903	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022568	AATAA	2	10	82665	82674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022568	TCATT	2	10	84431	84440	20 %	60 %	0 %	20 %	550896259
71	NC_022568	ATTTT	2	10	84683	84692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022568	CTAAA	2	10	86796	86805	60 %	20 %	0 %	20 %	550896261
73	NC_022568	AAGTT	2	10	87222	87231	40 %	40 %	20 %	0 %	550896261
74	NC_022568	GAAAA	2	10	88139	88148	80 %	0 %	20 %	0 %	550896261
75	NC_022568	TGAAA	2	10	88381	88390	60 %	20 %	20 %	0 %	550896261
76	NC_022568	AAATT	2	10	88725	88734	60 %	40 %	0 %	0 %	550896261
77	NC_022568	AGCGG	2	10	89309	89318	20 %	0 %	60 %	20 %	550896261
78	NC_022568	AGTTA	2	10	90718	90727	40 %	40 %	20 %	0 %	550896261
79	NC_022568	GAAAT	2	10	91805	91814	60 %	20 %	20 %	0 %	550896262
80	NC_022568	AAAAG	2	10	92117	92126	80 %	0 %	20 %	0 %	550896262
81	NC_022568	TGAAA	2	10	93114	93123	60 %	20 %	20 %	0 %	550896262
82	NC_022568	TGCAT	2	10	95774	95783	20 %	40 %	20 %	20 %	550896265
83	NC_022568	TTACT	2	10	96020	96029	20 %	60 %	0 %	20 %	550896265
84	NC_022568	GTTTT	2	10	97618	97627	0 %	80 %	20 %	0 %	550896267
85	NC_022568	GAAGT	2	10	97899	97908	40 %	20 %	40 %	0 %	550896267
86	NC_022568	AGCGG	2	10	99218	99227	20 %	0 %	60 %	20 %	550896268
87	NC_022568	ATATC	2	10	105023	105032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022568	TTCCA	2	10	105808	105817	20 %	40 %	0 %	40 %	550896278
89	NC_022568	AAAAG	2	10	107710	107719	80 %	0 %	20 %	0 %	550896280
90	NC_022568	ACGGT	2	10	109254	109263	20 %	20 %	40 %	20 %	550896281
91	NC_022568	GAAAT	2	10	110493	110502	60 %	20 %	20 %	0 %	550896282
92	NC_022568	GAATT	2	10	111134	111143	40 %	40 %	20 %	0 %	550896282
93	NC_022568	AACCA	2	10	115009	115018	60 %	0 %	0 %	40 %	550896285
94	NC_022568	CTTTA	2	10	115338	115347	20 %	60 %	0 %	20 %	550896285
95	NC_022568	CTCGA	2	10	116689	116698	20 %	20 %	20 %	40 %	550896287
96	NC_022568	TTCCA	2	10	117023	117032	20 %	40 %	0 %	40 %	550896287
97	NC_022568	TACTG	2	10	117288	117297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_022568	TCTCT	2	10	117861	117870	0 %	60 %	0 %	40 %	550896288
99	NC_022568	TTTTA	2	10	118221	118230	20 %	80 %	0 %	0 %	550896289
100	NC_022568	AAAAG	2	10	118490	118499	80 %	0 %	20 %	0 %	550896290
101	NC_022568	AAAGT	2	10	119527	119536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022568	TTAGT	2	10	120648	120657	20 %	60 %	20 %	0 %	550896294
103	NC_022568	TGAAC	2	10	121330	121339	40 %	20 %	20 %	20 %	550896296
104	NC_022568	AGATG	2	10	121372	121381	40 %	20 %	40 %	0 %	550896296
105	NC_022568	TTTAT	2	10	123648	123657	20 %	80 %	0 %	0 %	550896297
106	NC_022568	AAGTG	2	10	125670	125679	40 %	20 %	40 %	0 %	550896300
107	NC_022568	GTCAG	2	10	126131	126140	20 %	20 %	40 %	20 %	550896301
108	NC_022568	AATTT	2	10	127412	127421	40 %	60 %	0 %	0 %	550896303
109	NC_022568	TTGTT	2	10	129779	129788	0 %	80 %	20 %	0 %	550896305
110	NC_022568	ATTTT	2	10	131581	131590	20 %	80 %	0 %	0 %	550896307
111	NC_022568	AAAAT	2	10	133083	133092	80 %	20 %	0 %	0 %	550896307
112	NC_022568	AACTT	2	10	134408	134417	40 %	40 %	0 %	20 %	550896310
113	NC_022568	ACAAA	2	10	134510	134519	80 %	0 %	0 %	20 %	550896310
114	NC_022568	TTGGT	2	10	136100	136109	0 %	60 %	40 %	0 %	550896311
115	NC_022568	TTGGT	2	10	136151	136160	0 %	60 %	40 %	0 %	550896311
116	NC_022568	TATGA	2	10	139080	139089	40 %	40 %	20 %	0 %	550896315
117	NC_022568	TTTAT	2	10	139872	139881	20 %	80 %	0 %	0 %	550896316
118	NC_022568	ATTAG	2	10	141103	141112	40 %	40 %	20 %	0 %	550896320
119	NC_022568	ATTTA	2	10	141147	141156	40 %	60 %	0 %	0 %	550896320
120	NC_022568	ATAAA	2	10	142635	142644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022568	ACGGC	2	10	144394	144403	20 %	0 %	40 %	40 %	550896324
122	NC_022568	TTTAA	2	10	144466	144475	40 %	60 %	0 %	0 %	550896324
123	NC_022568	AATTT	2	10	144652	144661	40 %	60 %	0 %	0 %	550896324
124	NC_022568	GATAA	2	10	144819	144828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022568	AATAA	2	10	145921	145930	80 %	20 %	0 %	0 %	550896325
126	NC_022568	GAATA	2	10	147882	147891	60 %	20 %	20 %	0 %	550896328
127	NC_022568	TTTAC	2	10	149081	149090	20 %	60 %	0 %	20 %	550896329
128	NC_022568	AGATG	2	10	149130	149139	40 %	20 %	40 %	0 %	550896329
129	NC_022568	ATATG	2	10	151797	151806	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022568	TCTAA	2	10	154148	154157	40 %	40 %	0 %	20 %	550896332
131	NC_022568	AAATC	2	10	154663	154672	60 %	20 %	0 %	20 %	550896332
132	NC_022568	GGCTG	2	10	154700	154709	0 %	20 %	60 %	20 %	550896332
133	NC_022568	CGAAA	2	10	155278	155287	60 %	0 %	20 %	20 %	550896332
134	NC_022568	AAGAT	2	10	157667	157676	60 %	20 %	20 %	0 %	550896334
135	NC_022568	TGCGC	2	10	157788	157797	0 %	20 %	40 %	40 %	550896334
136	NC_022568	GAATT	2	10	158038	158047	40 %	40 %	20 %	0 %	550896335
137	NC_022568	AAATA	2	10	161093	161102	80 %	20 %	0 %	0 %	550896339
138	NC_022568	TTCTT	2	10	162298	162307	0 %	80 %	0 %	20 %	550896341
139	NC_022568	CTAAA	2	10	162446	162455	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022568	TTCCA	2	10	162849	162858	20 %	40 %	0 %	40 %	550896342
141	NC_022568	AACCT	2	10	164620	164629	40 %	20 %	0 %	40 %	550896343
142	NC_022568	ACAAA	2	10	167344	167353	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022568	ACTTT	2	10	168631	168640	20 %	60 %	0 %	20 %	550896345
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155	NC_022568	ATAGA	2	10	188413	188422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022568	AATTT	2	10	188650	188659	40 %	60 %	0 %	0 %	550896361
157	NC_022568	ATTTG	2	10	189477	189486	20 %	60 %	20 %	0 %	550896362
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192	NC_022568	GAAAA	2	10	226479	226488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022568	GAAAA	2	10	226682	226691	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022568	GAAAA	2	10	226885	226894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022568	AAACA	2	10	226978	226987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_022568	TGATA	2	10	227455	227464	40 %	40 %	20 %	0 %	550896395
197	NC_022568	GAATA	2	10	229974	229983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_022568	AAATT	2	10	231660	231669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_022568	TAATT	2	10	231861	231870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_022568	TCGTG	2	10	239042	239051	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_022568	TTACT	2	10	300716	300725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_022568	ATCTT	2	10	319590	319599	20 %	60 %	0 %	20 %	550896473
254	NC_022568	CTAGA	2	10	320659	320668	40 %	20 %	20 %	20 %	550896474
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257	NC_022568	GGTAG	2	10	321461	321470	20 %	20 %	60 %	0 %	550896474
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259	NC_022568	TGTTA	2	10	324135	324144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_022568	TTGAA	2	10	324576	324585	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_022568	AAATT	2	10	325678	325687	60 %	40 %	0 %	0 %	550896477
262	NC_022568	TGGTT	2	10	326016	326025	0 %	60 %	40 %	0 %	550896477
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268	NC_022568	TTTCG	2	10	331533	331542	0 %	60 %	20 %	20 %	550896482
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403	NC_022568	TTAAT	2	10	518360	518369	40 %	60 %	0 %	0 %	550896671
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