MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Adlercreutzia equolifaciens DSM 19450 DNA

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022567	TTTCTA	2	12	204011	204022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022567	AAAATG	2	12	204481	204492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022567	ATTAGC	2	12	262840	262851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022567	TTGGCA	2	12	262907	262918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022567	GGGGCG	2	12	279921	279932	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022567	CTTGCT	2	12	295018	295029	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022567	GCGGGT	2	12	305905	305916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022567	CTCGGC	2	12	328437	328448	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022567	GAGGGG	2	12	329324	329335	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022567	TGCCGC	2	12	359503	359514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022567	ATTGCG	2	12	388076	388087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022567	GTGCTC	2	12	424757	424768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022567	CGACGC	2	12	439793	439804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022567	TTGGCA	2	12	456049	456060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022567	GATCGA	2	12	456867	456878	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022567	TTTTTG	2	12	457322	457333	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022567	GGCTCG	2	12	482492	482503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022567	TTCTCT	2	12	541974	541985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022567	AGAGCG	2	12	593188	593199	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022567	ATCGGA	2	12	614072	614083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022567	GGAAGG	2	12	670358	670369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022567	CGCAGA	2	12	697910	697921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022567	TCGCGA	2	12	697934	697945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022567	ATCGCG	2	12	697972	697983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022567	CGCGAT	2	12	698013	698024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022567	CGAAAA	2	12	766130	766141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022567	GTTGGT	2	12	766215	766226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022567	AGAAAA	2	12	767684	767695	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022567	CGAAGG	2	12	816319	816330	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022567	ATGCGA	2	12	893183	893194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022567	ACCGCG	2	12	893655	893666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022567	CGGCCG	2	12	950269	950280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022567	CCGAAC	2	12	1016636	1016647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022567	CGACCG	2	12	1024565	1024576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022567	AGAGAA	2	12	1041990	1042001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022567	GCGGAG	2	12	1074132	1074143	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022567	GAAGGG	2	12	1084447	1084458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022567	GGGCGC	2	12	1088913	1088924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022567	ATTCGT	2	12	1091087	1091098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022567	GGGCGA	2	12	1186962	1186973	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022567	GCCGCA	2	12	1316414	1316425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022567	GGGAGG	2	12	1316426	1316437	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022567	TGACGT	2	12	1403767	1403778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022567	TCGCCA	2	12	1429844	1429855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022567	ACGGGC	2	12	1446237	1446248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022567	TTGGCC	2	12	1506556	1506567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022567	GCTTCG	2	12	1547812	1547823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022567	AGGACA	2	12	1704709	1704720	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022567	GGAATG	2	12	1743954	1743965	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022567	CGAACC	2	12	1743997	1744008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022567	TTTGCA	2	12	1746439	1746450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022567	GCCGCG	2	12	1771378	1771389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022567	ATGCCA	2	12	1822001	1822012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022567	GCAAGG	2	12	1939940	1939951	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022567	ATCAAC	2	12	1956063	1956074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022567	GCCGCG	2	12	1995676	1995687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022567	ATTGCC	2	12	2016859	2016870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022567	TCTGCG	2	12	2058280	2058291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022567	TACGAC	2	12	2061787	2061798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022567	CCTCGC	2	12	2096794	2096805	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022567	TGTCGC	2	12	2107146	2107157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_022567	CGCGTG	2	12	2157506	2157517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022567	TTGCGA	2	12	2184466	2184477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022567	CGAGCG	2	12	2204315	2204326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022567	CCGATC	2	12	2272775	2272786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022567	GAGAAA	2	12	2397289	2397300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022567	TCCCCC	2	12	2431853	2431864	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
68	NC_022567	TGGAAT	2	12	2446361	2446372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022567	CACCTA	2	12	2487768	2487779	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022567	GACGGC	2	12	2490604	2490615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022567	AAATGC	2	12	2582375	2582386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022567	CCCCTG	2	12	2603516	2603527	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022567	TCGAGC	2	12	2605515	2605526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022567	GGCGCA	2	12	2610600	2610611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022567	CGGCCC	2	12	2639724	2639735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_022567	CGGCCA	2	12	2657416	2657427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022567	CGCCTG	2	12	2686472	2686483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022567	TTCCGA	2	12	2726451	2726462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022567	TGCGGA	2	12	2768446	2768457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022567	CTTCTC	2	12	2789263	2789274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022567	TTATCG	2	12	2805423	2805434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.