MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae CG43

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022566	GCTGAT	2	12	11336	11347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022566	GCCCTG	2	12	57514	57525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022566	AGCGCG	2	12	69247	69258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022566	TTTTTA	2	12	83652	83663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022566	AAATAT	2	12	142382	142393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022566	TATCTT	2	12	299493	299504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022566	ATTTAT	2	12	299557	299568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022566	TGCTAT	2	12	307723	307734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022566	ATATCG	2	12	315031	315042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022566	GCGCTC	2	12	363778	363789	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022566	TTCCTG	2	12	390674	390685	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022566	AAGACA	2	12	471726	471737	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022566	GGCGAT	2	12	528795	528806	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022566	TTATTT	2	12	541289	541300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022566	CGCTCA	2	12	586305	586316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022566	TCCCTC	2	12	607048	607059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_022566	GAGGGT	2	12	627653	627664	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022566	GGCCAA	2	12	637915	637926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022566	GGATTT	2	12	654830	654841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022566	ACGTTA	2	12	659795	659806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022566	ACAAAA	2	12	669878	669889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022566	TGCAAA	2	12	674997	675008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022566	TTATCG	2	12	683301	683312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022566	CTCCCT	2	12	701513	701524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_022566	ATTGTG	2	12	763676	763687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022566	TGCTCA	2	12	769777	769788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022566	GAAAAA	2	12	774078	774089	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022566	CGCTGG	2	12	782977	782988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022566	AGCGTG	2	12	783094	783105	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022566	TGAAAA	2	12	848526	848537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022566	TTAATA	2	12	959617	959628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022566	GACGTG	2	12	970602	970613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022566	CAAAGG	2	12	1126090	1126101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022566	AGGGAG	2	12	1143792	1143803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022566	ATCGTC	2	12	1240455	1240466	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022566	CTTTTC	2	12	1270187	1270198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022566	ATTTTC	2	12	1301155	1301166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022566	AAAAGC	2	12	1316221	1316232	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022566	GATGCC	2	12	1330535	1330546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022566	TGGTTG	2	12	1332964	1332975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022566	GGGAAA	2	12	1357340	1357351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022566	GGCGCG	2	12	1365181	1365192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022566	AAGGAG	2	12	1404376	1404387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022566	ACGGCG	2	12	1421888	1421899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022566	CGGCAT	2	12	1454404	1454415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022566	CAGCCC	2	12	1504887	1504898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022566	TGGCGC	2	12	1507424	1507435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022566	TCACTG	2	12	1540663	1540674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022566	GCGGTC	2	12	1540760	1540771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022566	GTTAGA	2	12	1609912	1609923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022566	GTGGGC	2	12	1636706	1636717	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022566	GATCAA	2	12	1655530	1655541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022566	CAGGAT	2	12	1677930	1677941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022566	ATCTTT	2	12	1703494	1703505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022566	GAGTAG	2	12	1816574	1816585	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022566	AAACAA	2	12	1821281	1821292	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022566	ATCTGT	2	12	1838029	1838040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022566	AATCTC	2	12	1942313	1942324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022566	ACATAA	2	12	1946624	1946635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022566	GCTAAG	2	12	1947019	1947030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022566	TTTCCC	2	12	1970245	1970256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022566	CTGGCG	2	12	2031218	2031229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022566	TGCCTC	2	12	2049452	2049463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022566	TATGTT	2	12	2070028	2070039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022566	AAAAAG	2	12	2103303	2103314	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022566	CAGCGC	2	12	2104713	2104724	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022566	AACAAT	2	12	2151220	2151231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022566	GTGTAA	2	12	2182591	2182602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022566	ACATAA	2	12	2188592	2188603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022566	CGTCAT	2	12	2210413	2210424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022566	CTGCCG	2	12	2212795	2212806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022566	ATCGTT	2	12	2273016	2273027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022566	GTTTTC	2	12	2320940	2320951	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022566	TCATGG	2	12	2322779	2322790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022566	GGGTAT	2	12	2348167	2348178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022566	GCGGCT	2	12	2355202	2355213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022566	AGCGAC	2	12	2357502	2357513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022566	TCGTCA	2	12	2357683	2357694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022566	TTAAGT	2	12	2365445	2365456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022566	TTATAA	2	12	2365652	2365663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022566	AAACCA	2	12	2393215	2393226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022566	CTTTCA	2	12	2403815	2403826	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022566	ATATTT	2	12	2404156	2404167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022566	TAAATA	2	12	2404172	2404183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022566	GAATAA	2	12	2475815	2475826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022566	AGATAA	2	12	2492322	2492333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022566	CGCTTG	2	12	2504438	2504449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022566	CGTTTT	2	12	2519437	2519448	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_022566	AGCGTC	2	12	2580912	2580923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022566	ATCTAA	2	12	2585436	2585447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022566	AATAAA	2	12	2593621	2593632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022566	GATTCG	2	12	2604500	2604511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022566	TTTTCT	2	12	2650864	2650875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022566	TGAATA	2	12	2651659	2651670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022566	CAGCCA	2	12	2651862	2651873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022566	AATGAG	2	12	2657023	2657034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022566	CGCTGC	2	12	2688451	2688462	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022566	ACCGGA	2	12	2688759	2688770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022566	CTGTCC	2	12	2689255	2689266	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022566	TGCAGC	2	12	2689565	2689576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022566	GAAAGT	2	12	2753176	2753187	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022566	CGCTGG	2	12	2754657	2754668	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022566	TGACGG	2	12	2754912	2754923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022566	GAATCG	2	12	2755343	2755354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022566	TCTCGT	2	12	2774321	2774332	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022566	GCAAAA	2	12	2802886	2802897	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022566	CATTAA	2	12	2860866	2860877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022566	GGGGAG	2	12	2863027	2863038	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022566	TGGCCG	2	12	2864211	2864222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022566	AGAAAA	2	12	2884557	2884568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022566	AAAAAC	2	12	2931628	2931639	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022566	CAAGTG	2	12	2940491	2940502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022566	AGCCAC	2	12	2965929	2965940	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022566	CTGCGG	2	12	3058467	3058478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022566	CTTTCA	2	12	3060713	3060724	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022566	CCAGCG	2	12	3060764	3060775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022566	GACGCA	2	12	3062972	3062983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022566	GCGCTG	2	12	3121794	3121805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022566	GCCCTG	2	12	3122037	3122048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022566	GCAGGG	2	12	3126848	3126859	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022566	GCCCGC	2	12	3159590	3159601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022566	GCAGCC	2	12	3168110	3168121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022566	TCCGGC	2	12	3173883	3173894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022566	GCGCTG	2	12	3174240	3174251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022566	GCTGGC	2	12	3195790	3195801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022566	GGTTTA	2	12	3197749	3197760	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022566	GCTGGC	2	12	3198021	3198032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_022566	TCGACA	2	12	3258127	3258138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022566	GTAAGC	2	12	3330552	3330563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022566	AAAGAT	2	12	3463403	3463414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022566	TTGCTA	2	12	3471268	3471279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022566	CGCTCG	2	12	3483591	3483602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022566	ATCGGT	2	12	3512836	3512847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_022566	GCGAAA	3	18	3534476	3534493	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022566	TTCACT	2	12	3575547	3575558	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022566	ATTAAC	2	12	3587888	3587899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022566	CTGTAT	2	12	3600936	3600947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_022566	GTTATC	2	12	3619767	3619778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_022566	AGTCCG	2	12	3649101	3649112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022566	ACGTTT	2	12	3651929	3651940	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022566	AGTTGT	2	12	3727424	3727435	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022566	CGATCC	2	12	3751114	3751125	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022566	AATGAT	2	12	3757350	3757361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022566	CCCTCT	2	12	3759747	3759758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_022566	AACGGG	2	12	3785328	3785339	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_022566	TTTAAA	2	12	3827843	3827854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022566	ACAAAA	2	12	3829228	3829239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_022566	CTGTGC	2	12	3864646	3864657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_022566	GCTTCA	2	12	3911354	3911365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022566	AAGGGA	2	12	3912380	3912391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022566	CAAAAG	2	12	3913504	3913515	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_022566	ATTTTT	2	12	3925080	3925091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022566	CCTTTC	2	12	3928442	3928453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022566	ATGGGG	2	12	3929454	3929465	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022566	CTCTTC	2	12	3958069	3958080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_022566	GTTTTT	2	12	3961847	3961858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022566	GCCATC	2	12	3999810	3999821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_022566	CCTGCG	2	12	4078524	4078535	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022566	CTGTGG	2	12	4107472	4107483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_022566	CATCAC	2	12	4143964	4143975	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_022566	ACGCTG	2	12	4144162	4144173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_022566	TTCCTG	2	12	4231453	4231464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_022566	ATCGCG	2	12	4327369	4327380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.