MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea) plasmid

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022551	AAT	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022551	ATT	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022551	ATT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022551	TAA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
5	NC_022551	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
6	NC_022551	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
7	NC_022551	TAT	2	6	143	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
8	NC_022551	ATG	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734476
9	NC_022551	ATT	2	6	159	164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
10	NC_022551	TAA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
11	NC_022551	TCT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
12	NC_022551	TTC	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
13	NC_022551	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
14	NC_022551	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022551	TAT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022551	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022551	TGT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022551	TAA	2	6	494	499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022551	AAT	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022551	TTA	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022551	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022551	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
23	NC_022551	ACA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
24	NC_022551	ATT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
25	NC_022551	ATG	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
26	NC_022551	GAT	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
27	NC_022551	AGA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
28	NC_022551	AAT	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
29	NC_022551	ATA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
30	NC_022551	CAA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
31	NC_022551	ATT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
32	NC_022551	TGA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
33	NC_022551	TAG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
34	NC_022551	CTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549734477
35	NC_022551	AGA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
36	NC_022551	AAC	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
37	NC_022551	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
38	NC_022551	TCT	2	6	1998	2003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734477
39	NC_022551	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022551	ATT	2	6	2158	2163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
41	NC_022551	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
42	NC_022551	TTA	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
43	NC_022551	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734478
44	NC_022551	TTA	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
45	NC_022551	ATA	2	6	2501	2506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022551	TAA	3	9	2514	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022551	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022551	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022551	ATT	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734479
50	NC_022551	AAG	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734479
51	NC_022551	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734479
52	NC_022551	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
53	NC_022551	ATA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
54	NC_022551	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734480
55	NC_022551	TGT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022551	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022551	CAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022551	ATG	3	9	3526	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022551	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022551	GAT	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022551	AGA	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.