MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	ATATCT	2	12	276	287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683698
2	NC_022550	TTTCTT	2	12	321	332	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683698
3	NC_022550	TTCAAA	2	12	1827	1838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683700
4	NC_022550	AATGAA	2	12	2721	2732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683701
5	NC_022550	AAAAGC	2	12	3401	3412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549683702
6	NC_022550	GTTTTG	2	12	4288	4299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549683702
7	NC_022550	CGATTA	2	12	4396	4407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549683702
8	NC_022550	ATATTA	2	12	5398	5409	50 %	50 %	0 %	0 %	549683703
9	NC_022550	TAAATT	2	12	6249	6260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022550	TATGGA	2	12	7206	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549683704
11	NC_022550	ATTTTT	2	12	8378	8389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683705
12	NC_022550	CCCATT	2	12	8907	8918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549683705
13	NC_022550	TTTTTC	2	12	11699	11710	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683708
14	NC_022550	TTTCTA	2	12	12898	12909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683708
15	NC_022550	AAAAAT	2	12	16043	16054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022550	TATTTA	2	12	16086	16097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683710
17	NC_022550	ATTTTT	2	12	17366	17377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022550	TAAATA	2	12	18488	18499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549683711
19	NC_022550	TTGTGG	2	12	24550	24561	0 %	50 %	50 %	0 %	549683718
20	NC_022550	TTTTGT	2	12	27423	27434	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549683721
21	NC_022550	CTTATT	2	12	27635	27646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683721
22	NC_022550	ATTTAG	2	12	28735	28746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683722
23	NC_022550	TGGTAT	2	12	28808	28819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549683722
24	NC_022550	AAAAAT	2	12	29652	29663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549683723
25	NC_022550	TAGGAA	2	12	29852	29863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683724
26	NC_022550	ATTTTT	2	12	32831	32842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683728
27	NC_022550	AAAAAT	2	12	33889	33900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549683729
28	NC_022550	TTTTAT	2	12	35402	35413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683732
29	NC_022550	CAAATA	2	12	36865	36876	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549683733
30	NC_022550	ACAGAA	2	12	37813	37824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549683734
31	NC_022550	TAATAT	2	12	38089	38100	50 %	50 %	0 %	0 %	549683734
32	NC_022550	GATTCC	2	12	38734	38745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022550	AATTAT	2	12	38797	38808	50 %	50 %	0 %	0 %	549683736
34	NC_022550	AGAAAA	2	12	40487	40498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683736
35	NC_022550	TTAGAT	2	12	42906	42917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683739
36	NC_022550	TGATCA	2	12	43915	43926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549683740
37	NC_022550	TTTTAT	2	12	45862	45873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683741
38	NC_022550	TATTTT	2	12	46249	46260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683741
39	NC_022550	TAGAAA	2	12	47710	47721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683742
40	NC_022550	ATTTTT	2	12	47763	47774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022550	AGAAAA	2	12	48534	48545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683743
42	NC_022550	GGAGAA	2	12	50256	50267	50 %	0 %	50 %	0 %	549683746
43	NC_022550	AAAGAA	2	12	51800	51811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683747
44	NC_022550	TTAAAT	2	12	53610	53621	50 %	50 %	0 %	0 %	549683747
45	NC_022550	ATCTAT	2	12	57626	57637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683751
46	NC_022550	TATTGA	2	12	57926	57937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683751
47	NC_022550	ACAATA	2	12	59416	59427	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549683752
48	NC_022550	TTTCAA	2	12	64881	64892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683755
49	NC_022550	TATTTT	2	12	65949	65960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022550	TATCAA	2	12	66976	66987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683756
51	NC_022550	AAGTAA	2	12	70792	70803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683759
52	NC_022550	ATTTTT	2	12	73333	73344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683761
53	NC_022550	TATTTT	2	12	74815	74826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683763
54	NC_022550	TTTTCT	2	12	74830	74841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683763
55	NC_022550	TTCCTT	2	12	74987	74998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683763
56	NC_022550	TGTTTT	2	12	76367	76378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549683764
57	NC_022550	CATTAA	2	12	77989	78000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683766
58	NC_022550	CTATTC	2	12	78396	78407	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549683766
59	NC_022550	CTTATA	2	12	78988	78999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683767
60	NC_022550	AAGGAA	2	12	81879	81890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549683771
61	NC_022550	TTTAAT	2	12	83819	83830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683773
62	NC_022550	CTTATA	2	12	84427	84438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683774
63	NC_022550	TAATTT	2	12	85552	85563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683775
64	NC_022550	CCTCCA	2	12	85677	85688	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	549683776
65	NC_022550	ATAATG	2	12	88413	88424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683779
66	NC_022550	ACCAAT	2	12	88439	88450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549683779
67	NC_022550	TAAAAG	2	12	88713	88724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683779
68	NC_022550	TTTGGA	2	12	90701	90712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549683779
69	NC_022550	ATAAAA	2	12	91479	91490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022550	AGAAAA	2	12	92157	92168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683782
71	NC_022550	TGAAAT	2	12	92643	92654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683782
72	NC_022550	AAATTT	2	12	94133	94144	50 %	50 %	0 %	0 %	549683783
73	NC_022550	TATGAT	2	12	95506	95517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683784
74	NC_022550	TTTATA	2	12	97465	97476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683786
75	NC_022550	TCAATA	2	12	98383	98394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683786
76	NC_022550	TTAATT	2	12	99723	99734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683787
77	NC_022550	TCTATT	2	12	100460	100471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683788
78	NC_022550	TTATTT	3	18	101015	101032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683788
79	NC_022550	ATATTT	2	12	101066	101077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683788
80	NC_022550	AATATG	2	12	101525	101536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683789
81	NC_022550	TTTCCT	2	12	101809	101820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683789
82	NC_022550	TTTTAT	2	12	102303	102314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022550	AAATTT	2	12	102468	102479	50 %	50 %	0 %	0 %	549683790
84	NC_022550	TTTTAA	2	12	102515	102526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683790
85	NC_022550	ATGTTA	2	12	103587	103598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683791
86	NC_022550	TTGTAT	2	12	109126	109137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549683797
87	NC_022550	AAAATG	2	12	109281	109292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683797
88	NC_022550	TATTCA	2	12	115423	115434	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683803
89	NC_022550	TATAGA	2	12	117279	117290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683804
90	NC_022550	TTTTTA	2	12	118961	118972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683805
91	NC_022550	TCATTA	2	12	119495	119506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683806
92	NC_022550	AAATAT	2	12	121020	121031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549683807
93	NC_022550	AGATAC	2	12	121354	121365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549683807
94	NC_022550	AATATC	2	12	121657	121668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683807
95	NC_022550	AATCCA	2	12	121959	121970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549683808
96	NC_022550	ATTATG	2	12	124593	124604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683811
97	NC_022550	ATTCTA	2	12	125115	125126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683811
98	NC_022550	TTTCTC	2	12	125547	125558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683811
99	NC_022550	TAATTT	2	12	128996	129007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022550	TTTCTA	2	12	130824	130835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683814
101	NC_022550	ATCTTC	2	12	131153	131164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549683814
102	NC_022550	ATTTCT	2	12	131235	131246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683814
103	NC_022550	TAATTT	2	12	131410	131421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683814
104	NC_022550	GATTTT	2	12	131536	131547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549683815
105	NC_022550	TTTATT	2	12	132026	132037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683815
106	NC_022550	ATAGAT	2	12	132213	132224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683815
107	NC_022550	AATAAG	2	12	133959	133970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683817
108	NC_022550	TTTTTA	2	12	134955	134966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683817
109	NC_022550	TTTTCT	2	12	134975	134986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683817
110	NC_022550	TTCCTT	2	12	138577	138588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683821
111	NC_022550	ATAATT	2	12	138776	138787	50 %	50 %	0 %	0 %	549683822
112	NC_022550	TTTATT	2	12	140438	140449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022550	AAATTA	2	12	140556	140567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022550	TCTTTT	2	12	141088	141099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683825
115	NC_022550	AATTTT	2	12	146180	146191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683829
116	NC_022550	TGAATT	2	12	147174	147185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683829
117	NC_022550	TGAAGA	2	12	147377	147388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683829
118	NC_022550	AAGATA	2	12	151307	151318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683834
119	NC_022550	AGGATG	2	12	151559	151570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549683835
120	NC_022550	TGTATT	2	12	155148	155159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022550	ATTTCT	2	12	155187	155198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022550	TTTTCT	2	12	155211	155222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022550	TGTTAT	2	12	155712	155723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022550	GTTTCT	2	12	156717	156728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549683838
125	NC_022550	ATTTTA	2	12	157287	157298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683839
126	NC_022550	AATCAT	2	12	157350	157361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683839
127	NC_022550	AATAGG	2	12	158162	158173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683840
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221	NC_022550	TCCTTA	2	12	267309	267320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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225	NC_022550	ATAAAA	2	12	273364	273375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_022550	ATGAAA	2	12	273703	273714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683962
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239	NC_022550	TATAAA	2	12	282785	282796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549683972
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242	NC_022550	TTTATT	2	12	283860	283871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683973
243	NC_022550	ATTTTT	2	12	285401	285412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683974
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476	NC_022550	TTTCAT	2	12	620331	620342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549684276
477	NC_022550	TTCCCA	2	12	621305	621316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549684278
478	NC_022550	AATCAA	2	12	622186	622197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549684278
479	NC_022550	AAGGAG	2	12	622381	622392	50 %	0 %	50 %	0 %	549684278