MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	ATATCT	2	12	276	287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683698
2	NC_022550	TTTCTT	2	12	321	332	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683698
3	NC_022550	TTCAAA	2	12	1827	1838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683700
4	NC_022550	AATGAA	2	12	2721	2732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683701
5	NC_022550	AAAAGC	2	12	3401	3412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549683702
6	NC_022550	GTTTTG	2	12	4288	4299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549683702
7	NC_022550	CGATTA	2	12	4396	4407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549683702
8	NC_022550	ATATTA	2	12	5398	5409	50 %	50 %	0 %	0 %	549683703
9	NC_022550	TATGGA	2	12	7206	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549683704
10	NC_022550	ATTTTT	2	12	8378	8389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683705
11	NC_022550	CCCATT	2	12	8907	8918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549683705
12	NC_022550	TTTTTC	2	12	11699	11710	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683708
13	NC_022550	TTTCTA	2	12	12898	12909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683708
14	NC_022550	TATTTA	2	12	16086	16097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683710
15	NC_022550	TAAATA	2	12	18488	18499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549683711
16	NC_022550	TTGTGG	2	12	24550	24561	0 %	50 %	50 %	0 %	549683718
17	NC_022550	TTTTGT	2	12	27423	27434	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549683721
18	NC_022550	CTTATT	2	12	27635	27646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683721
19	NC_022550	ATTTAG	2	12	28735	28746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683722
20	NC_022550	TGGTAT	2	12	28808	28819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549683722
21	NC_022550	AAAAAT	2	12	29652	29663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549683723
22	NC_022550	TAGGAA	2	12	29852	29863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683724
23	NC_022550	ATTTTT	2	12	32831	32842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683728
24	NC_022550	AAAAAT	2	12	33889	33900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549683729
25	NC_022550	TTTTAT	2	12	35402	35413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683732
26	NC_022550	CAAATA	2	12	36865	36876	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549683733
27	NC_022550	ACAGAA	2	12	37813	37824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549683734
28	NC_022550	TAATAT	2	12	38089	38100	50 %	50 %	0 %	0 %	549683734
29	NC_022550	AATTAT	2	12	38797	38808	50 %	50 %	0 %	0 %	549683736
30	NC_022550	AGAAAA	2	12	40487	40498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683736
31	NC_022550	TTAGAT	2	12	42906	42917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683739
32	NC_022550	TGATCA	2	12	43915	43926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549683740
33	NC_022550	TTTTAT	2	12	45862	45873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683741
34	NC_022550	TATTTT	2	12	46249	46260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683741
35	NC_022550	TAGAAA	2	12	47710	47721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683742
36	NC_022550	AGAAAA	2	12	48534	48545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683743
37	NC_022550	GGAGAA	2	12	50256	50267	50 %	0 %	50 %	0 %	549683746
38	NC_022550	AAAGAA	2	12	51800	51811	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683747
39	NC_022550	TTAAAT	2	12	53610	53621	50 %	50 %	0 %	0 %	549683747
40	NC_022550	ATCTAT	2	12	57626	57637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683751
41	NC_022550	TATTGA	2	12	57926	57937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683751
42	NC_022550	ACAATA	2	12	59416	59427	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549683752
43	NC_022550	TTTCAA	2	12	64881	64892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683755
44	NC_022550	TATCAA	2	12	66976	66987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683756
45	NC_022550	AAGTAA	2	12	70792	70803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683759
46	NC_022550	ATTTTT	2	12	73333	73344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683761
47	NC_022550	TATTTT	2	12	74815	74826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683763
48	NC_022550	TTTTCT	2	12	74830	74841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683763
49	NC_022550	TTCCTT	2	12	74987	74998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683763
50	NC_022550	TGTTTT	2	12	76367	76378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549683764
51	NC_022550	CATTAA	2	12	77989	78000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683766
52	NC_022550	CTATTC	2	12	78396	78407	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549683766
53	NC_022550	CTTATA	2	12	78988	78999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683767
54	NC_022550	AAGGAA	2	12	81879	81890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549683771
55	NC_022550	TTTAAT	2	12	83819	83830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683773
56	NC_022550	CTTATA	2	12	84427	84438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683774
57	NC_022550	TAATTT	2	12	85552	85563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683775
58	NC_022550	CCTCCA	2	12	85677	85688	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	549683776
59	NC_022550	ATAATG	2	12	88413	88424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683779
60	NC_022550	ACCAAT	2	12	88439	88450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549683779
61	NC_022550	TAAAAG	2	12	88713	88724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683779
62	NC_022550	TTTGGA	2	12	90701	90712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549683779
63	NC_022550	AGAAAA	2	12	92157	92168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	549683782
64	NC_022550	TGAAAT	2	12	92643	92654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683782
65	NC_022550	AAATTT	2	12	94133	94144	50 %	50 %	0 %	0 %	549683783
66	NC_022550	TATGAT	2	12	95506	95517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683784
67	NC_022550	TTTATA	2	12	97465	97476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683786
68	NC_022550	TCAATA	2	12	98383	98394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683786
69	NC_022550	TTAATT	2	12	99723	99734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683787
70	NC_022550	TCTATT	2	12	100460	100471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683788
71	NC_022550	TTATTT	3	18	101015	101032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683788
72	NC_022550	ATATTT	2	12	101066	101077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683788
73	NC_022550	AATATG	2	12	101525	101536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683789
74	NC_022550	TTTCCT	2	12	101809	101820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683789
75	NC_022550	AAATTT	2	12	102468	102479	50 %	50 %	0 %	0 %	549683790
76	NC_022550	TTTTAA	2	12	102515	102526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683790
77	NC_022550	ATGTTA	2	12	103587	103598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683791
78	NC_022550	TTGTAT	2	12	109126	109137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549683797
79	NC_022550	AAAATG	2	12	109281	109292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683797
80	NC_022550	TATTCA	2	12	115423	115434	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683803
81	NC_022550	TATAGA	2	12	117279	117290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683804
82	NC_022550	TTTTTA	2	12	118961	118972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683805
83	NC_022550	TCATTA	2	12	119495	119506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683806
84	NC_022550	AAATAT	2	12	121020	121031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549683807
85	NC_022550	AGATAC	2	12	121354	121365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549683807
86	NC_022550	AATATC	2	12	121657	121668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683807
87	NC_022550	AATCCA	2	12	121959	121970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549683808
88	NC_022550	ATTATG	2	12	124593	124604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683811
89	NC_022550	ATTCTA	2	12	125115	125126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683811
90	NC_022550	TTTCTC	2	12	125547	125558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683811
91	NC_022550	TTTCTA	2	12	130824	130835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683814
92	NC_022550	ATCTTC	2	12	131153	131164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549683814
93	NC_022550	ATTTCT	2	12	131235	131246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549683814
94	NC_022550	TAATTT	2	12	131410	131421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683814
95	NC_022550	GATTTT	2	12	131536	131547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549683815
96	NC_022550	TTTATT	2	12	132026	132037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683815
97	NC_022550	ATAGAT	2	12	132213	132224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549683815
98	NC_022550	AATAAG	2	12	133959	133970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683817
99	NC_022550	TTTTTA	2	12	134955	134966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683817
100	NC_022550	TTTTCT	2	12	134975	134986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683817
101	NC_022550	TTCCTT	2	12	138577	138588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683821
102	NC_022550	ATAATT	2	12	138776	138787	50 %	50 %	0 %	0 %	549683822
103	NC_022550	TCTTTT	2	12	141088	141099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683825
104	NC_022550	AATTTT	2	12	146180	146191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683829
105	NC_022550	TGAATT	2	12	147174	147185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549683829
106	NC_022550	TGAAGA	2	12	147377	147388	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683829
107	NC_022550	AAGATA	2	12	151307	151318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683834
108	NC_022550	AGGATG	2	12	151559	151570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549683835
109	NC_022550	GTTTCT	2	12	156717	156728	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549683838
110	NC_022550	ATTTTA	2	12	157287	157298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549683839
111	NC_022550	AATCAT	2	12	157350	157361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683839
112	NC_022550	AATAGG	2	12	158162	158173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549683840
113	NC_022550	ATTCCA	2	12	160102	160113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549683841
114	NC_022550	TACTAA	2	12	160317	160328	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549683841
115	NC_022550	CAATTG	2	12	160527	160538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549683842
116	NC_022550	ATTATC	2	12	164071	164082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549683844
117	NC_022550	TAAGAA	2	12	164362	164373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549683845
118	NC_022550	CTTTTT	2	12	166092	166103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549683847
119	NC_022550	TGTGTT	2	12	166186	166197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549683847
120	NC_022550	ATTTTT	2	12	166267	166278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683847
121	NC_022550	TTTCCT	2	12	169530	169541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549683849
122	NC_022550	ATTTTT	2	12	170387	170398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549683849
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