MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	TATGG	2	10	38746	38755	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022550	TAAAT	2	10	40613	40622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022550	TAATT	2	10	48912	48921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022550	TTAAA	2	10	64313	64322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022550	ATTTT	2	10	66020	66029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022550	GAATA	2	10	67680	67689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022550	GAATT	2	10	74720	74729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022550	TTAAT	2	10	78477	78486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022550	AATAA	2	10	91500	91509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022550	TAAAA	2	10	106422	106431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022550	AAATG	2	10	106436	106445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022550	ATTTT	2	10	113622	113631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022550	AAAAG	2	10	113647	113656	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022550	ATTTT	2	10	133559	133568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022550	ATTAT	2	10	155693	155702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022550	CTTTA	2	10	166036	166045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022550	TAAAA	2	10	166538	166547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022550	CATAT	2	10	175699	175708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022550	AATTT	2	10	177103	177112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022550	ATTAA	2	10	180124	180133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022550	TATTT	2	10	196536	196545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022550	TAAAA	2	10	207106	207115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022550	TAAGT	2	10	207167	207176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022550	TATAT	2	10	214025	214034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022550	TTGTT	2	10	219642	219651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022550	ACATC	2	10	221913	221922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022550	AAGAG	2	10	232305	232314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022550	ATAAA	3	15	232391	232405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022550	AATTA	2	10	250373	250382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022550	TAAAA	2	10	262670	262679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022550	ATAAA	2	10	263632	263641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022550	TATTT	2	10	269647	269656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022550	TTAGT	2	10	278012	278021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022550	CTTTT	2	10	282331	282340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022550	ATCAT	2	10	282472	282481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022550	TATAT	2	10	287471	287480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022550	AAATA	2	10	288947	288956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022550	GAAAA	2	10	289412	289421	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022550	AGAGA	2	10	290980	290989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022550	GTTTT	2	10	292124	292133	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022550	TTTAG	2	10	294029	294038	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022550	ATTAC	2	10	295843	295852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022550	AGAAA	2	10	315499	315508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022550	TTTTC	2	10	315571	315580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022550	TACTT	2	10	316904	316913	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022550	GTTTG	2	10	316990	316999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022550	ATTAA	2	10	323922	323931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022550	AAAAC	2	10	323952	323961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022550	AACTA	2	10	343901	343910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022550	TTTTA	2	10	392876	392885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022550	AAACA	2	10	394992	395001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022550	TTTTA	2	10	422697	422706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022550	TAAAA	2	10	423673	423682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022550	TGTTT	2	10	441928	441937	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022550	TAAGA	2	10	456819	456828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022550	TTATT	2	10	457236	457245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022550	TTTTG	2	10	457254	457263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022550	ATTTA	2	10	486100	486109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022550	TATAT	2	10	486110	486119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022550	TTCAA	2	10	486138	486147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_022550	ATGTT	2	10	500571	500580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022550	AATTA	2	10	500585	500594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022550	AAATA	2	10	506880	506889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022550	AGATT	2	10	511597	511606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022550	ATCGA	2	10	514866	514875	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022550	GAAAA	2	10	514983	514992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022550	AAAAG	2	10	515065	515074	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022550	AGAAT	2	10	515181	515190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022550	AAATT	2	10	515247	515256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022550	CGGAG	2	10	518315	518324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022550	TAATA	2	10	519433	519442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022550	ATATG	2	10	528653	528662	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022550	TATAT	2	10	531313	531322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022550	ATTCG	2	10	534790	534799	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022550	ATTTT	2	10	535962	535971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022550	AAAAT	2	10	550876	550885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022550	AAAAT	2	10	556183	556192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022550	TAAAT	2	10	584275	584284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022550	TTATT	2	10	600310	600319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022550	TTAAA	2	10	603211	603220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022550	AAAAG	2	10	603292	603301	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022550	TTTCA	2	10	607123	607132	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.