MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	ATAG	2	8	6233	6240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022550	GTGA	2	8	6292	6299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022550	AAAG	2	8	6302	6309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022550	TAAA	2	8	6590	6597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022550	TTAT	2	8	6673	6680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022550	TAAA	2	8	17378	17385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022550	TCTT	2	8	33611	33618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022550	AAAT	2	8	33677	33684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022550	TTAA	2	8	37203	37210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022550	TAAA	2	8	42123	42130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022550	CAAT	2	8	47871	47878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022550	TATT	2	8	47895	47902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022550	ATTT	2	8	49982	49989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022550	TTTA	2	8	53684	53691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022550	TATT	2	8	53724	53731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022550	ATTA	2	8	53786	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022550	AATT	2	8	53985	53992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022550	AAAT	2	8	60786	60793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022550	TATT	2	8	63774	63781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022550	ATAC	2	8	64144	64151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022550	TGAA	2	8	64387	64394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022550	GTTT	2	8	65855	65862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022550	TATT	2	8	74676	74683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022550	AATA	2	8	84544	84551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022550	CTAC	2	8	91447	91454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022550	CAAA	2	8	91468	91475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022550	ATAA	2	8	98490	98497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022550	AATA	2	8	98498	98505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022550	ATTT	2	8	106399	106406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022550	TCTA	3	12	110934	110945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022550	AAAT	2	8	112808	112815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022550	ATTT	2	8	112822	112829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022550	TTTA	2	8	116224	116231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022550	AAAT	2	8	129053	129060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022550	AGGT	2	8	147896	147903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022550	TGTT	2	8	148195	148202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022550	ATTC	2	8	151430	151437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022550	TAAA	2	8	155261	155268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022550	ATTT	2	8	155495	155502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022550	TAAA	2	8	155519	155526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022550	ATTT	2	8	156904	156911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022550	TATT	2	8	161407	161414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022550	TTTA	2	8	161418	161425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022550	GTTA	2	8	166500	166507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022550	AACA	2	8	166517	166524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_022550	CCGT	2	8	177180	177187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022550	ATAA	2	8	189895	189902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022550	TTTA	2	8	198515	198522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022550	TTAG	2	8	203207	203214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022550	ATTT	2	8	205968	205975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022550	ACAA	2	8	207192	207199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022550	TAAA	2	8	209270	209277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022550	ATAA	3	12	212726	212737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022550	AATA	2	8	221870	221877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022550	AAAT	2	8	226346	226353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022550	GTTT	2	8	229598	229605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022550	TTCA	2	8	232248	232255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022550	TCAT	2	8	232366	232373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022550	TTTC	2	8	244424	244431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022550	AAAT	2	8	247622	247629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022550	TTAT	2	8	250385	250392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022550	TAAA	3	12	260183	260194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022550	ATCT	2	8	262554	262561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022550	TACT	2	8	262744	262751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022550	TTGT	2	8	262769	262776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022550	AAAT	2	8	270740	270747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022550	TAAA	2	8	273282	273289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022550	AATT	2	8	282509	282516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022550	ACGT	2	8	287516	287523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022550	ACCT	2	8	287525	287532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022550	GCGT	2	8	287631	287638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022550	TTAG	2	8	287643	287650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022550	TGAG	2	8	288050	288057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022550	ATTT	2	8	288234	288241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022550	CGGA	2	8	288421	288428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022550	GATT	2	8	288990	288997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022550	ATTT	2	8	289162	289169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022550	ACAT	2	8	289184	289191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022550	GCGA	2	8	289445	289452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022550	ATCA	2	8	289549	289556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022550	TGTA	2	8	289573	289580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022550	ATTA	2	8	290418	290425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022550	TACT	2	8	290647	290654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022550	ACGG	2	8	290696	290703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_022550	CCTT	2	8	290959	290966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022550	TATT	2	8	293999	294006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022550	ATTT	3	12	295894	295905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022550	TGAT	2	8	320089	320096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022550	ATTT	2	8	320196	320203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022550	TATT	2	8	326941	326948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022550	TTGA	2	8	332533	332540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022550	ATAA	2	8	347097	347104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022550	ATTT	2	8	347117	347124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022550	TCAA	2	8	347140	347147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022550	AATA	2	8	347166	347173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022550	ACCA	2	8	348457	348464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022550	TATT	2	8	355022	355029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022550	TAAA	2	8	363058	363065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022550	ATTA	2	8	365514	365521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022550	GTTC	2	8	366974	366981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022550	AAAT	2	8	399549	399556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022550	TAAA	2	8	399583	399590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022550	TTCA	2	8	400048	400055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022550	ATTT	2	8	404828	404835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022550	TTTA	2	8	412513	412520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022550	CTAA	2	8	422710	422717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022550	AATA	2	8	422728	422735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022550	AAAT	2	8	425877	425884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022550	AATT	2	8	429491	429498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022550	ATAA	2	8	436458	436465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022550	AAAG	2	8	436477	436484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022550	CTTT	2	8	436491	436498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022550	ATTA	2	8	436520	436527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022550	TTTC	2	8	436679	436686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_022550	TGCT	2	8	436725	436732	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022550	TATT	2	8	437273	437280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022550	TTTG	2	8	441911	441918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022550	TTAA	2	8	449851	449858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022550	GTAT	2	8	449920	449927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022550	AATT	2	8	456794	456801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022550	TAAT	2	8	473438	473445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022550	ATGA	2	8	484242	484249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022550	ATCC	2	8	491919	491926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022550	TAAA	2	8	491944	491951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022550	AAAT	2	8	491992	491999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022550	TGAT	2	8	500408	500415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022550	ATAA	2	8	500459	500466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022550	ATTT	2	8	503036	503043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022550	TAAA	2	8	507688	507695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022550	TGTT	2	8	514903	514910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022550	TATT	2	8	514962	514969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022550	ATAG	2	8	515082	515089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022550	TAAG	2	8	515206	515213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022550	AATT	2	8	515292	515299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022550	TTCT	2	8	518588	518595	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022550	GATG	2	8	518618	518625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022550	TATT	2	8	519448	519455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022550	ATAA	2	8	524454	524461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022550	TAAA	2	8	527179	527186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022550	TTTA	2	8	534428	534435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022550	CTTT	2	8	543121	543128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022550	TATT	2	8	549561	549568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022550	AATT	2	8	574275	574282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022550	TAAA	3	12	581576	581587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022550	AAAT	2	8	583053	583060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022550	AAGA	2	8	584347	584354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022550	TTGT	2	8	597019	597026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022550	ACAA	2	8	604222	604229	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022550	CTTT	2	8	606963	606970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_022550	TGAT	2	8	607057	607064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022550	ATAA	2	8	611331	611338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.