MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea)

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022550	AT	3	6	6356	6361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022550	TC	3	6	6446	6451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022550	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022550	TA	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022550	TA	3	6	33543	33548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022550	AT	4	8	35278	35285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022550	AT	3	6	42108	42113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022550	AT	6	12	48976	48987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022550	TA	3	6	54016	54021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022550	GA	3	6	54121	54126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022550	TA	5	10	64179	64188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022550	AT	5	10	64194	64203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022550	AT	3	6	65827	65832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022550	TA	4	8	65904	65911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022550	TA	3	6	65914	65919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022550	AT	3	6	74779	74784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022550	AT	3	6	74802	74807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022550	TA	3	6	80716	80721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022550	TA	3	6	87550	87555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022550	AT	3	6	104706	104711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022550	TA	4	8	111225	111232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022550	AT	3	6	124551	124556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022550	AT	3	6	135859	135864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022550	AT	4	8	138648	138655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022550	AC	3	6	140484	140489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022550	AT	5	10	147958	147967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022550	TA	3	6	152928	152933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022550	AT	3	6	155409	155414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022550	AT	4	8	155661	155668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022550	AT	3	6	155701	155706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022550	AT	3	6	156924	156929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022550	TA	3	6	166394	166399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022550	TA	3	6	166529	166534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022550	TG	3	6	168081	168086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022550	AT	3	6	170823	170828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022550	AT	3	6	177408	177413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022550	TA	3	6	195050	195055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022550	AT	3	6	196398	196403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022550	TA	4	8	201404	201411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022550	AT	3	6	214041	214046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022550	TA	3	6	217390	217395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022550	CA	4	8	218944	218951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_022550	AT	3	6	218996	219001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022550	AT	3	6	228986	228991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022550	AT	3	6	232238	232243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022550	TA	3	6	262575	262580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022550	GT	3	6	262761	262766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022550	AT	3	6	270783	270788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022550	AT	3	6	273188	273193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022550	TA	3	6	282278	282283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022550	TA	3	6	282346	282351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022550	TA	4	8	287227	287234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022550	TG	3	6	288074	288079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022550	CA	3	6	288105	288110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022550	AC	3	6	288614	288619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022550	AC	3	6	288785	288790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022550	CG	3	6	289072	289077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022550	TA	3	6	289364	289369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022550	AC	3	6	289961	289966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022550	TA	3	6	290257	290262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022550	AT	3	6	290391	290396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022550	AT	3	6	290733	290738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022550	TC	3	6	294067	294072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022550	GA	3	6	294141	294146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022550	AT	3	6	295834	295839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022550	TA	3	6	316960	316965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022550	GA	4	8	320111	320118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022550	TC	3	6	320187	320192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022550	TA	3	6	343916	343921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022550	AT	3	6	351101	351106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022550	AT	3	6	351182	351187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022550	AT	3	6	368862	368867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022550	AT	4	8	377479	377486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022550	AT	3	6	386030	386035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022550	AT	3	6	386048	386053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022550	AT	3	6	389818	389823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022550	AT	3	6	428154	428159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022550	TA	3	6	435435	435440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022550	AT	3	6	437175	437180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022550	TA	3	6	437287	437292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022550	AG	3	6	455347	455352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022550	TA	3	6	457221	457226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022550	AT	4	8	457278	457285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022550	AT	3	6	484200	484205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022550	AT	3	6	484250	484255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022550	TA	3	6	486076	486081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022550	AT	3	6	486084	486089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022550	TA	3	6	491863	491868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022550	AT	3	6	494757	494762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022550	GT	3	6	500390	500395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022550	TC	3	6	500512	500517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022550	TA	3	6	503472	503477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022550	AT	3	6	505556	505561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022550	TA	3	6	505603	505608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022550	TA	3	6	505654	505659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022550	TA	3	6	511624	511629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022550	AT	4	8	514920	514927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022550	TA	3	6	515230	515235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022550	TC	3	6	518399	518404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022550	TA	5	10	527236	527245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022550	AT	6	12	531319	531330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022550	TA	3	6	537375	537380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022550	TA	3	6	549507	549512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022550	TA	3	6	549540	549545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022550	AT	3	6	563549	563554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022550	AT	3	6	606996	607001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022550	TA	3	6	607178	607183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022550	TA	3	6	607306	607311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022550	TA	3	6	607313	607318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.