MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halyomorpha halys symbiont DNA

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022547	CAATTT	2	12	1123	1134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022547	AGATTA	2	12	23130	23141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022547	ATATAA	2	12	31161	31172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022547	TTATTT	2	12	31311	31322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022547	CACAAT	2	12	32599	32610	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022547	ACAAAA	2	12	33389	33400	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022547	TACATA	2	12	40249	40260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022547	TATAAA	2	12	40330	40341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022547	AGGGAT	2	12	47906	47917	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022547	CATGGT	2	12	53688	53699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022547	ATATTT	2	12	61655	61666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022547	TATTCA	2	12	65217	65228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022547	ATTTTT	2	12	79756	79767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022547	ATTAGT	2	12	93609	93620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022547	TTGTAA	2	12	96364	96375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022547	ATATGA	2	12	97611	97622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022547	ATTAAA	2	12	104791	104802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022547	CATTAT	2	12	108494	108505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022547	TCAAAT	2	12	109748	109759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022547	AATTTT	2	12	110056	110067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022547	TATAAA	2	12	111754	111765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022547	TAATAT	2	12	115023	115034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022547	GATTAA	2	12	115317	115328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022547	ATTTAA	2	12	118710	118721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022547	TTAAAA	2	12	118768	118779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022547	AAATTT	2	12	133919	133930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022547	TTAATT	2	12	150454	150465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022547	AATTTA	2	12	150826	150837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022547	TAAATT	2	12	155253	155264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022547	ACTATA	2	12	158596	158607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022547	ATTAAG	2	12	158721	158732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022547	CTTTTG	2	12	158828	158839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022547	GACGGA	2	12	159519	159530	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022547	AAAATT	2	12	160064	160075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022547	TTAATA	2	12	161444	161455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022547	TAAAAA	2	12	167601	167612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022547	TAATTT	2	12	187115	187126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022547	TAGTAT	2	12	193126	193137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022547	TTAAAA	2	12	196882	196893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022547	ATTTTT	2	12	221564	221575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022547	TATGTT	2	12	233308	233319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022547	ATTTAT	2	12	236518	236529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022547	TGTTAG	2	12	239163	239174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022547	ATAATG	2	12	239814	239825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022547	ATTCAT	2	12	253939	253950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022547	AAACAA	2	12	269670	269681	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022547	TGAAAT	2	12	288317	288328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022547	AATATA	2	12	289746	289757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022547	TCAATT	2	12	290062	290073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022547	TATAAA	2	12	291218	291229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022547	ATAACT	2	12	304155	304166	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022547	GTCACT	2	12	304873	304884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022547	TAATTT	2	12	315271	315282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022547	TAGATT	2	12	315616	315627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022547	AAATTA	2	12	320612	320623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022547	GATATT	2	12	328636	328647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022547	TAAACA	2	12	346884	346895	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022547	AATAAA	2	12	354011	354022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022547	TGAAAT	2	12	358445	358456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022547	TATACC	2	12	359725	359736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022547	TTTTAA	2	12	372373	372384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022547	AAAATT	2	12	379474	379485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022547	AGATAT	2	12	391742	391753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022547	AATTAA	2	12	394533	394544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022547	TAAATT	2	12	408643	408654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022547	CATAAA	2	12	410574	410585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022547	TATTTA	2	12	418514	418525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022547	TGAATT	2	12	422876	422887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022547	ATTTGT	2	12	426897	426908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022547	ATTATG	2	12	430213	430224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022547	ATTTTT	2	12	430795	430806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022547	TTTATT	2	12	430908	430919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022547	TTTTAT	2	12	432490	432501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022547	ATTTTA	2	12	432680	432691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022547	TTTAAA	2	12	432829	432840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022547	AATTAA	2	12	433009	433020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022547	TTTAAT	2	12	433203	433214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022547	ATTTTT	2	12	435689	435700	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022547	AAAATA	2	12	438025	438036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022547	TGTAAG	2	12	439092	439103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022547	TGATTA	2	12	446185	446196	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022547	TTATAA	2	12	447687	447698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022547	AAATAT	2	12	457967	457978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022547	ATTGAT	2	12	466094	466105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022547	TTGATT	2	12	466210	466221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022547	TTAATG	2	12	466801	466812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022547	AAATTA	2	12	471818	471829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022547	ATTTTT	2	12	479594	479605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022547	ATTTTT	2	12	479636	479647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022547	TTTTAA	2	12	479948	479959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022547	AAAGGG	2	12	491110	491121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022547	TCTGAA	2	12	495069	495080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022547	TAAGAT	2	12	497007	497018	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022547	TATAAA	2	12	503735	503746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022547	AATAAG	2	12	531515	531526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022547	ACTAAT	2	12	534441	534452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022547	AATGGA	2	12	536590	536601	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022547	GCTTCA	2	12	537944	537955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022547	ATTTTT	2	12	547857	547868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022547	ATTTTT	2	12	553725	553736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022547	TATAAT	2	12	557633	557644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022547	TTAAAT	2	12	557653	557664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022547	ATAAAA	2	12	558712	558723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022547	CTATAA	2	12	558746	558757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022547	ATAATG	2	12	558827	558838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022547	ATTTTA	2	12	561814	561825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022547	TAATGA	2	12	566929	566940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022547	ATTTTT	2	12	568110	568121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022547	ATTTAT	2	12	575303	575314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022547	ATTTTT	2	12	576560	576571	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022547	TAATTA	2	12	579007	579018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022547	CTTTTT	2	12	586864	586875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022547	ATTTTT	2	12	609537	609548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022547	GTTAAT	2	12	610323	610334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022547	ATTATA	2	12	611058	611069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022547	TTTAAA	2	12	614745	614756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022547	TTTAAA	2	12	622298	622309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022547	TATAAA	2	12	622424	622435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022547	TTTATA	2	12	622457	622468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022547	ACCATA	2	12	624535	624546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022547	TATCTT	2	12	629127	629138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022547	ATATTT	2	12	632468	632479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022547	ATTAAT	2	12	654605	654616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022547	ATTTTT	2	12	654628	654639	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022547	TTTTTG	2	12	693708	693719	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022547	ATAAAA	2	12	695734	695745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022547	ATTACT	2	12	696717	696728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022547	TCTAGT	2	12	697704	697715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022547	TAGAGC	2	12	702111	702122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022547	AAAATA	2	12	704365	704376	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022547	AATTCA	2	12	720768	720779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022547	ATTTAT	2	12	721752	721763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022547	ATAAAT	2	12	725663	725674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022547	ATAATT	2	12	726679	726690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022547	TACCTG	2	12	728119	728130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022547	ATATTT	2	12	731249	731260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_022547	CTTTTA	2	12	741319	741330	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_022547	AAAATC	2	12	754461	754472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.