MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Halyomorpha halys symbiont DNA

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022547	ATTTTA	2	12	6472	6483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549730542
2	NC_022547	TTCATA	2	12	9006	9017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730545
3	NC_022547	TTGTTC	2	12	11264	11275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549730546
4	NC_022547	TAGTTG	2	12	11395	11406	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549730546
5	NC_022547	TCACGT	2	12	16280	16291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549730549
6	NC_022547	CTAATA	2	12	19004	19015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730550
7	NC_022547	TTGTAT	2	12	21267	21278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549730552
8	NC_022547	TTTACT	2	12	21320	21331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549730552
9	NC_022547	ATACTG	2	12	24107	24118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730553
10	NC_022547	CGTAAT	2	12	24906	24917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730554
11	NC_022547	TTTAAT	2	12	33859	33870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549730557
12	NC_022547	TTTAAA	2	12	33944	33955	50 %	50 %	0 %	0 %	549730557
13	NC_022547	TGCTTT	2	12	38511	38522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549730561
14	NC_022547	TATTAA	2	12	40499	40510	50 %	50 %	0 %	0 %	549730562
15	NC_022547	AGCTAC	2	12	45433	45444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549730566
16	NC_022547	AAATCT	2	12	46988	46999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730567
17	NC_022547	GATTTG	2	12	47415	47426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549730567
18	NC_022547	ATTCAA	2	12	52771	52782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730571
19	NC_022547	ATTAGC	2	12	55870	55881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730573
20	NC_022547	TAATAT	2	12	60878	60889	50 %	50 %	0 %	0 %	549730578
21	NC_022547	ATTTTT	2	12	61841	61852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549730579
22	NC_022547	CAATTA	2	12	61965	61976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730579
23	NC_022547	TTGTTT	2	12	68226	68237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549730584
24	NC_022547	TTCAGC	2	12	70274	70285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549730586
25	NC_022547	ATAAAA	2	12	71036	71047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549730588
26	NC_022547	TAATAT	2	12	72828	72839	50 %	50 %	0 %	0 %	549730590
27	NC_022547	AATTAA	2	12	73386	73397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730591
28	NC_022547	AGGACG	2	12	77527	77538	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549730593
29	NC_022547	ATTTAT	2	12	77574	77585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549730593
30	NC_022547	ATGTTT	2	12	80126	80137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549730595
31	NC_022547	GGAAGT	2	12	84817	84828	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549730601
32	NC_022547	GTAAAC	2	12	85224	85235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549730602
33	NC_022547	TTAAAG	2	12	87378	87389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549730602
34	NC_022547	GCAATA	2	12	88010	88021	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549730602
35	NC_022547	TACATG	2	12	88862	88873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730602
36	NC_022547	TCACGA	2	12	101225	101236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549730611
37	NC_022547	ACCAAT	2	12	101413	101424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549730611
38	NC_022547	ATCAGC	2	12	101938	101949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549730611
39	NC_022547	ATTGTT	2	12	105167	105178	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549730613
40	NC_022547	TATGTC	2	12	107906	107917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730615
41	NC_022547	CATAAC	2	12	108184	108195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549730615
42	NC_022547	ACTATA	2	12	122241	122252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730624
43	NC_022547	ATGCTA	2	12	132403	132414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730635
44	NC_022547	TTTCTT	2	12	139743	139754	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549730641
45	NC_022547	AATTTC	2	12	147926	147937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730646
46	NC_022547	CAGTAT	2	12	161182	161193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730654
47	NC_022547	GTCGCA	2	12	164989	165000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549730658
48	NC_022547	AAAATA	2	12	173422	173433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549730663
49	NC_022547	TGATAT	2	12	173972	173983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730664
50	NC_022547	CTGGTG	2	12	174292	174303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549730664
51	NC_022547	AATAAA	2	12	182643	182654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549730670
52	NC_022547	CAGTGA	2	12	185686	185697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549730672
53	NC_022547	GAAGAT	2	12	188050	188061	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549730673
54	NC_022547	TGATAC	2	12	196178	196189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730677
55	NC_022547	TAAATG	2	12	198265	198276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549730679
56	NC_022547	ATCATT	2	12	202038	202049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730682
57	NC_022547	GGTGTA	2	12	205044	205055	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549730686
58	NC_022547	CAAATT	2	12	205976	205987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730686
59	NC_022547	TGATAT	2	12	207102	207113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730687
60	NC_022547	CTGGTG	2	12	207158	207169	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549730687
61	NC_022547	AACGTG	2	12	213403	213414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549730692
62	NC_022547	TAATAC	2	12	213728	213739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549730692
63	NC_022547	TTATAA	2	12	215755	215766	50 %	50 %	0 %	0 %	549730693
64	NC_022547	AATTTA	2	12	216790	216801	50 %	50 %	0 %	0 %	549730694
65	NC_022547	AATGAA	2	12	223364	223375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549730696
66	NC_022547	ATTAAT	2	12	228122	228133	50 %	50 %	0 %	0 %	549730699
67	NC_022547	ATTAAT	2	12	232733	232744	50 %	50 %	0 %	0 %	549730702
68	NC_022547	TGCTAT	2	12	233612	233623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730703
69	NC_022547	ATACGT	2	12	233892	233903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730703
70	NC_022547	CGTTTA	2	12	234609	234620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730703
71	NC_022547	GATTTA	2	12	240191	240202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730705
72	NC_022547	AATTAA	2	12	245918	245929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730709
73	NC_022547	TATTGC	2	12	247385	247396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730710
74	NC_022547	GCTGAA	2	12	248007	248018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549730710
75	NC_022547	GTATTA	2	12	255498	255509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730718
76	NC_022547	TTCAAC	2	12	259699	259710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549730721
77	NC_022547	ACTTTG	2	12	262324	262335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730723
78	NC_022547	CTTAAC	2	12	271017	271028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549730727
79	NC_022547	ATATTA	2	12	272475	272486	50 %	50 %	0 %	0 %	549730728
80	NC_022547	ACTTAT	2	12	278571	278582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730735
81	NC_022547	GTTAAC	2	12	280035	280046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730737
82	NC_022547	CTGATC	2	12	283189	283200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549730738
83	NC_022547	ATTTTT	2	12	283214	283225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549730738
84	NC_022547	TTAGCG	2	12	293986	293997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549730741
85	NC_022547	ATTAAA	2	12	303463	303474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730746
86	NC_022547	TTTTAT	2	12	303651	303662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	549730747
87	NC_022547	CATCTT	2	12	308079	308090	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549730749
88	NC_022547	TGTTTT	2	12	309707	309718	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	549730750
89	NC_022547	AAAGTG	2	12	317797	317808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549730754
90	NC_022547	TGGTTC	2	12	318902	318913	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549730755
91	NC_022547	TGCTAA	2	12	319040	319051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730755
92	NC_022547	TTTTTC	2	12	322478	322489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	549730758
93	NC_022547	AACATA	2	12	322764	322775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549730758
94	NC_022547	TAATTT	2	12	324438	324449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549730760
95	NC_022547	TGATAA	2	12	327152	327163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549730761
96	NC_022547	GCGTTG	2	12	327581	327592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549730761
97	NC_022547	ATAAAA	2	12	329148	329159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	549730762
98	NC_022547	ATTACT	2	12	332464	332475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730768
99	NC_022547	AAGTAA	2	12	337993	338004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549730773
100	NC_022547	GTAAAG	2	12	340602	340613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549730778
101	NC_022547	TAAAGG	2	12	343848	343859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549730786
102	NC_022547	CGTGGT	2	12	348948	348959	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549730795
103	NC_022547	AGCAAA	2	12	349652	349663	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549730796
104	NC_022547	CGATAA	2	12	351425	351436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549730798
105	NC_022547	TAGATT	2	12	362602	362613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730803
106	NC_022547	CCGTTG	2	12	369204	369215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549730808
107	NC_022547	TAGCAG	2	12	369370	369381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549730808
108	NC_022547	AAATTT	2	12	371022	371033	50 %	50 %	0 %	0 %	549730809
109	NC_022547	AAAAGC	2	12	373257	373268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549730810
110	NC_022547	CCTAAT	2	12	374173	374184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549730811
111	NC_022547	TTCAAT	2	12	374613	374624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730811
112	NC_022547	ATTGGT	2	12	380598	380609	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549730814
113	NC_022547	AAAATT	2	12	380996	381007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730814
114	NC_022547	ACAAAA	2	12	384702	384713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	549730817
115	NC_022547	AAATAG	2	12	386915	386926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549730820
116	NC_022547	AGCAGA	2	12	389823	389834	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549730822
117	NC_022547	ATGGTT	2	12	392444	392455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549730824
118	NC_022547	TACTAT	2	12	397040	397051	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549730828
119	NC_022547	ATACAA	2	12	399306	399317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549730830
120	NC_022547	ATAAAT	2	12	401935	401946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730832
121	NC_022547	TAAAAT	2	12	403688	403699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549730832
122	NC_022547	GTATTA	2	12	403832	403843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549730832
123	NC_022547	ATTGAC	2	12	407404	407415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549730835
124	NC_022547	AATACC	2	12	413201	413212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	549730839
125	NC_022547	ATCTTT	2	12	424107	424118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549730846
126	NC_022547	ACTGTT	2	12	429489	429500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549730850
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132	NC_022547	ACACAA	2	12	467691	467702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549730878
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215	NC_022547	TCCATC	2	12	689561	689572	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549731050
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218	NC_022547	ATCCAT	2	12	703508	703519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549731058
219	NC_022547	ATATTA	2	12	707460	707471	50 %	50 %	0 %	0 %	549731060
220	NC_022547	GAATAT	2	12	709651	709662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549731063
221	NC_022547	ATCAAG	2	12	712920	712931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549731065
222	NC_022547	TCTAAA	2	12	713186	713197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549731065
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224	NC_022547	GCTTCG	2	12	717678	717689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549731067
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227	NC_022547	TAATTG	2	12	732131	732142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549731075
228	NC_022547	ACATTT	2	12	736841	736852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549731080
229	NC_022547	ATTAGA	2	12	740863	740874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549731082
230	NC_022547	TGCTAA	2	12	744052	744063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549731085
231	NC_022547	ATTTTG	2	12	745005	745016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549731085
232	NC_022547	CGATAA	2	12	745498	745509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549731086
233	NC_022547	TGAAAA	2	12	745546	745557	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549731086
234	NC_022547	GCAATG	2	12	746953	746964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549731087
235	NC_022547	ATTGGT	2	12	748358	748369	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549731088
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262	NC_022547	TATTGA	2	12	855795	855806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549731155
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333	NC_022547	AATATT	2	12	1123912	1123923	50 %	50 %	0 %	0 %	549731345
334	NC_022547	TTAACA	2	12	1124758	1124769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549731345
335	NC_022547	TTAATG	2	12	1127259	1127270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549731347
336	NC_022547	ACCTTT	2	12	1131006	1131017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549731351
337	NC_022547	TGCTAA	2	12	1131828	1131839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549731351
338	NC_022547	TCTAAA	2	12	1132303	1132314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	549731352
339	NC_022547	AATAGC	2	12	1138338	1138349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549731356
340	NC_022547	TGGTCC	2	12	1141475	1141486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549731358
341	NC_022547	AAAATC	2	12	1147292	1147303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549731364
342	NC_022547	CCTAAT	2	12	1147326	1147337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549731364
343	NC_022547	GTGCTA	2	12	1149611	1149622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549731365

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.