MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022545	GGTTT	2	10	8280	8289	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022545	GCCCT	2	10	23670	23679	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_022545	GATTG	2	10	25603	25612	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022545	CTTTT	2	10	30049	30058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022545	GCAGG	2	10	35657	35666	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022545	CACCG	2	10	35896	35905	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_022545	CGGCA	2	10	40466	40475	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_022545	CCGGG	2	10	44018	44027	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_022545	AAAGC	2	10	53098	53107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022545	ATTTT	2	10	57937	57946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022545	CTCCC	2	10	110152	110161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_022545	CTGCC	2	10	142753	142762	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_022545	GGCAG	2	10	142883	142892	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022545	TGAAG	2	10	149261	149270	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022545	GTAAT	2	10	156295	156304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022545	CGGAA	2	10	166495	166504	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022545	TACCT	2	10	168014	168023	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022545	CATGA	2	10	173848	173857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022545	CCATT	2	10	180985	180994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022545	TCCAT	2	10	208810	208819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022545	CTTTT	2	10	211615	211624	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_022545	CCGAT	2	10	219256	219265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_022545	CGCGC	2	10	224101	224110	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_022545	ATGCG	2	10	241766	241775	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022545	AACTG	2	10	242273	242282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_022545	TTCCG	2	10	259140	259149	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022545	GGCAG	2	10	260962	260971	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022545	GTTCG	2	10	266803	266812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022545	GGCAA	2	10	267644	267653	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022545	CCCGC	2	10	269086	269095	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_022545	CTGCC	2	10	272683	272692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_022545	CCCTC	2	10	279644	279653	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_022545	TCCGG	2	10	286963	286972	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022545	TTTGA	2	10	294888	294897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022545	CTTCC	2	10	304823	304832	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_022545	TCGTC	2	10	307380	307389	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_022545	TTTTC	2	10	331902	331911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022545	CCAGC	2	10	353601	353610	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_022545	GGCAA	2	10	361924	361933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022545	GGTGA	2	10	387619	387628	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022545	CGCGG	2	10	394954	394963	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022545	CCCCG	2	10	404038	404047	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_022545	TGTCC	2	10	419914	419923	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_022545	CTCTC	2	10	422650	422659	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_022545	ATAAG	2	10	422726	422735	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022545	CATCT	2	10	439777	439786	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_022545	GCGAA	2	10	451655	451664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022545	TCTTT	2	10	458256	458265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022545	TCATA	2	10	500738	500747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022545	GGCAG	2	10	515569	515578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022545	TCACT	2	10	515595	515604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_022545	CCGGG	2	10	525962	525971	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022545	CCCGC	2	10	552706	552715	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_022545	ATGAT	2	10	554943	554952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022545	TTTTA	2	10	561434	561443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022545	TGCAT	2	10	563983	563992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_022545	ATAAA	2	10	574605	574614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022545	TATTT	2	10	574620	574629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022545	CGGAA	2	10	574797	574806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022545	AAAGG	2	10	576161	576170	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022545	GCGCC	2	10	591125	591134	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_022545	GGCGC	2	10	591144	591153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022545	AAAAC	2	10	595310	595319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022545	GCCCG	2	10	598046	598055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_022545	CATTT	2	10	607141	607150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022545	ACGAA	2	10	622169	622178	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022545	ACGAA	2	10	632728	632737	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022545	AGCGA	2	10	639516	639525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022545	CGGCC	2	10	645587	645596	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_022545	TTTCG	2	10	660988	660997	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022545	GACGT	2	10	669083	669092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022545	AACTT	2	10	676219	676228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022545	CCCTG	2	10	700342	700351	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_022545	TTGAA	2	10	711457	711466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022545	ACCGG	2	10	713389	713398	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_022545	ATGGC	2	10	719122	719131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022545	GCTCT	2	10	797677	797686	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_022545	CTGCA	2	10	817120	817129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_022545	CGTCA	2	10	817199	817208	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_022545	GAATG	2	10	818050	818059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022545	CAATG	2	10	832392	832401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022545	GTCAT	2	10	833395	833404	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022545	TTCCG	2	10	841821	841830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022545	GTTTC	2	10	841898	841907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022545	ACAAA	2	10	846622	846631	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022545	TCGCA	2	10	866932	866941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_022545	TCGGC	2	10	874824	874833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_022545	ACTTC	2	10	882323	882332	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022545	AACGA	2	10	882478	882487	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022545	GCCGG	2	10	882531	882540	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_022545	TTTTC	2	10	888551	888560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022545	GACGC	2	10	888702	888711	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_022545	GGCTC	2	10	923316	923325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_022545	TGGCG	2	10	945071	945080	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022545	TTGCA	2	10	963066	963075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022545	GACGT	2	10	978336	978345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022545	ATTTA	2	10	979112	979121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022545	ACAGA	2	10	979258	979267	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022545	TTCAG	2	10	980302	980311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022545	AGCCC	2	10	983472	983481	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_022545	CACGA	2	10	983617	983626	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_022545	AGCAT	2	10	985133	985142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022545	AAAGG	2	10	987417	987426	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022545	GGCAG	2	10	1027347	1027356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022545	GCAGG	2	10	1045549	1045558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022545	AAAAT	2	10	1048403	1048412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022545	CGGCG	2	10	1063892	1063901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_022545	TTGGC	2	10	1089169	1089178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_022545	GGCAA	2	10	1096736	1096745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022545	ATCGC	2	10	1111986	1111995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022545	CTGCC	2	10	1113981	1113990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_022545	GGTTG	2	10	1131501	1131510	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022545	CCGGT	2	10	1137429	1137438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_022545	CGAAC	2	10	1147746	1147755	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022545	CGAGC	2	10	1151714	1151723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_022545	AGATT	2	10	1223341	1223350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022545	CTGCG	2	10	1228766	1228775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_022545	TCCGA	2	10	1249620	1249629	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_022545	TGCCG	2	10	1252921	1252930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022545	CCTTT	2	10	1264471	1264480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_022545	ATTTT	2	10	1269585	1269594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022545	CATGC	2	10	1270235	1270244	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_022545	GGTAG	2	10	1279271	1279280	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022545	ATTTC	2	10	1303014	1303023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022545	CGGTT	2	10	1306051	1306060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022545	TAAAA	2	10	1311650	1311659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022545	CGCGG	2	10	1313288	1313297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_022545	TTGCG	2	10	1321949	1321958	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022545	TCGGA	2	10	1347039	1347048	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022545	AAAAG	2	10	1351361	1351370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022545	GATTT	2	10	1357979	1357988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022545	TCGTG	2	10	1359230	1359239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022545	GGGCT	2	10	1359375	1359384	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022545	GAAGA	2	10	1360361	1360370	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022545	ATTGG	2	10	1362236	1362245	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022545	CTGAA	2	10	1362545	1362554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022545	TCTGT	2	10	1363589	1363598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022545	TAAAT	2	10	1363735	1363744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022545	CTCGC	2	10	1418750	1418759	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_022545	TTCAT	2	10	1425045	1425054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022545	GCGGT	2	10	1434906	1434915	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022545	TGCGG	2	10	1439908	1439917	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022545	GCTTC	2	10	1447195	1447204	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_022545	GCCGC	2	10	1470138	1470147	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_022545	ATTTC	2	10	1480125	1480134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022545	CAGGG	2	10	1483460	1483469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022545	GTTTT	2	10	1485722	1485731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022545	CGGCG	2	10	1498383	1498392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022545	GCCGC	2	10	1498396	1498405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_022545	CTTCA	2	10	1515241	1515250	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_022545	GGGCG	2	10	1517988	1517997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
152	NC_022545	TTTGT	2	10	1550772	1550781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022545	AAGCG	2	10	1555319	1555328	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_022545	GCTTT	2	10	1562665	1562674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_022545	CGGGT	2	10	1580571	1580580	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_022545	CTTCG	2	10	1586522	1586531	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
157	NC_022545	GGCAG	2	10	1597044	1597053	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
158	NC_022545	TGACA	2	10	1597365	1597374	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022545	GAGAA	2	10	1634466	1634475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022545	GCGAT	2	10	1654123	1654132	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_022545	AGGAT	2	10	1655461	1655470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022545	TTATG	2	10	1655562	1655571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022545	TCCTG	2	10	1657019	1657028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_022545	CATCG	2	10	1663443	1663452	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_022545	TGCGG	2	10	1690547	1690556	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
166	NC_022545	TCACG	2	10	1690583	1690592	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_022545	TCTCG	3	15	1690593	1690607	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_022545	AGGGG	2	10	1696645	1696654	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022545	CCCCG	2	10	1703442	1703451	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
170	NC_022545	GTCAT	2	10	1743190	1743199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_022545	GATAA	2	10	1778754	1778763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022545	GTCTG	2	10	1790530	1790539	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_022545	CCGTC	2	10	1790819	1790828	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_022545	GTCGG	2	10	1809690	1809699	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
175	NC_022545	CACTA	2	10	1831394	1831403	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_022545	TTTTG	2	10	1869498	1869507	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022545	GGTTT	2	10	1870636	1870645	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022545	AAATA	2	10	1872789	1872798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022545	TCGGG	2	10	1891014	1891023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022545	TAAAT	2	10	1891153	1891162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022545	AGGCG	2	10	1913249	1913258	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_022545	GCTTT	2	10	1938496	1938505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_022545	GGCGT	2	10	1940821	1940830	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
184	NC_022545	GCGCC	2	10	1943056	1943065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
185	NC_022545	GGCAG	2	10	1946664	1946673	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
186	NC_022545	GCGCC	2	10	1956208	1956217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
187	NC_022545	GCCGG	2	10	1979589	1979598	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
188	NC_022545	GGCCG	2	10	1982854	1982863	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
189	NC_022545	GTTTT	2	10	1983102	1983111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022545	TGCCG	2	10	1985051	1985060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_022545	CGAAA	2	10	1997531	1997540	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
192	NC_022545	GGGGA	2	10	1997600	1997609	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022545	GGGGC	2	10	1997646	1997655	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
194	NC_022545	CCCGA	2	10	2025518	2025527	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
195	NC_022545	GGCGC	2	10	2025692	2025701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
196	NC_022545	GGCAA	2	10	2026732	2026741	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.