MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022545	CTAG	2	8	3648	3655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022545	CCGG	2	8	4367	4374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022545	CGTA	2	8	8207	8214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022545	GCCC	2	8	16746	16753	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_022545	GCGA	2	8	23067	23074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022545	CATC	2	8	23443	23450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022545	CACG	2	8	23818	23825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022545	GGTG	2	8	25306	25313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022545	CCCA	2	8	26045	26052	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_022545	CCAG	2	8	28253	28260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022545	CAGT	2	8	30592	30599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022545	GCCG	2	8	32353	32360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022545	GGCT	2	8	33069	33076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022545	CAGC	2	8	41696	41703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022545	GGTG	2	8	46709	46716	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022545	TGCC	2	8	54244	54251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022545	TCCA	2	8	57879	57886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022545	GCGT	2	8	57957	57964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022545	CATT	2	8	57981	57988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022545	ACGG	2	8	63931	63938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022545	CCGC	2	8	64029	64036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_022545	GCAA	2	8	64161	64168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022545	TTTG	2	8	76629	76636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022545	GAGG	2	8	89924	89931	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022545	TCAT	2	8	92529	92536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022545	TCCA	2	8	94926	94933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022545	GGCG	2	8	111185	111192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022545	GAGC	2	8	116248	116255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022545	CCTG	2	8	128904	128911	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022545	CCGT	2	8	128941	128948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022545	AAAT	2	8	137343	137350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022545	TGCG	2	8	137370	137377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_022545	GAGG	2	8	139954	139961	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022545	TTCA	2	8	142711	142718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022545	GATC	2	8	142851	142858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022545	ACGG	2	8	145796	145803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022545	CGAC	2	8	149293	149300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022545	CCCG	2	8	157905	157912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_022545	GCGG	2	8	157928	157935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022545	CCGG	2	8	165753	165760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022545	CGCC	2	8	169316	169323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_022545	TACA	2	8	178253	178260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022545	AGCA	2	8	180095	180102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022545	ATCG	2	8	185622	185629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022545	CGGC	2	8	190744	190751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022545	TCTG	2	8	190781	190788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022545	CAGG	2	8	191065	191072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022545	CGGG	2	8	191142	191149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022545	GCTT	2	8	192349	192356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022545	CAGC	2	8	192404	192411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022545	GAGG	2	8	192489	192496	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022545	TCCA	2	8	195235	195242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022545	AAAG	2	8	202183	202190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022545	AACT	2	8	203475	203482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022545	AAGG	2	8	208881	208888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022545	CCCG	2	8	211577	211584	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_022545	CGGG	2	8	218683	218690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022545	TTAT	2	8	219307	219314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022545	TCCT	2	8	224193	224200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022545	AAGG	2	8	229954	229961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022545	CCAG	2	8	230005	230012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022545	CCAG	2	8	233680	233687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022545	CCAG	2	8	239161	239168	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022545	CACC	2	8	240522	240529	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_022545	CCCG	2	8	240687	240694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_022545	TTTG	2	8	242248	242255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022545	GGCA	2	8	242411	242418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022545	CGGG	2	8	246432	246439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_022545	TCAA	2	8	248260	248267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022545	GCTC	2	8	249726	249733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022545	CCAG	2	8	249764	249771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022545	GCCC	2	8	257017	257024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_022545	GGCT	2	8	257313	257320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022545	CGGC	2	8	258890	258897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022545	AGGC	2	8	258906	258913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022545	TGCA	2	8	258953	258960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022545	CCAC	2	8	267747	267754	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_022545	AGCC	2	8	270947	270954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022545	CTTT	2	8	271051	271058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022545	CGGG	2	8	272750	272757	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022545	CGCC	2	8	280421	280428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_022545	CCAG	2	8	284670	284677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022545	GGGC	2	8	285277	285284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_022545	GGCC	2	8	302785	302792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022545	GATT	2	8	317559	317566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022545	GCAG	2	8	318678	318685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022545	AAGC	2	8	318708	318715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_022545	TGTC	2	8	318741	318748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022545	AAGA	2	8	331867	331874	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022545	AACT	2	8	359267	359274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022545	CTGT	2	8	364485	364492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022545	CCGG	2	8	364512	364519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022545	CATC	2	8	367426	367433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022545	GTTT	2	8	367490	367497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022545	CGGC	2	8	367568	367575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022545	GCCG	2	8	371092	371099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022545	CACC	2	8	376984	376991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_022545	GAAA	2	8	384240	384247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022545	AGCG	2	8	387476	387483	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022545	CGGC	2	8	389204	389211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022545	GGAT	2	8	391167	391174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022545	CGTT	2	8	391644	391651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_022545	GATT	2	8	403912	403919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022545	CGGC	2	8	403951	403958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022545	TCAG	2	8	404094	404101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022545	CCAC	2	8	412838	412845	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_022545	CCGG	2	8	417068	417075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022545	CTGG	2	8	426683	426690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022545	TCCG	2	8	431410	431417	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022545	CAGG	2	8	433969	433976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_022545	GCGG	2	8	440765	440772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022545	GCCG	2	8	445449	445456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022545	CGGT	2	8	448608	448615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022545	GCCT	2	8	450329	450336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022545	TTGA	2	8	458139	458146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022545	AACC	2	8	458228	458235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022545	CTTG	2	8	469128	469135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022545	GGGT	2	8	469285	469292	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022545	GAAA	2	8	475896	475903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022545	GAGG	2	8	478739	478746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022545	GCCT	2	8	482500	482507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022545	AAGG	2	8	482542	482549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022545	GCAA	2	8	488973	488980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022545	CAGG	2	8	507792	507799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022545	GCGG	2	8	509648	509655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022545	CGAT	2	8	509719	509726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022545	GCAG	2	8	509737	509744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022545	TCAA	2	8	513411	513418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022545	ACCG	2	8	515609	515616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022545	GAAT	2	8	521893	521900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022545	AAAC	2	8	522052	522059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022545	ATCA	2	8	531571	531578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022545	GCGG	2	8	532655	532662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022545	CGTT	2	8	533879	533886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022545	CATC	2	8	535339	535346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022545	CGCC	2	8	553542	553549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_022545	CGGG	2	8	556187	556194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022545	GCCA	2	8	557352	557359	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022545	TGCC	2	8	566307	566314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022545	CTTT	2	8	569312	569319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022545	GGCC	2	8	580920	580927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022545	GTCT	2	8	580940	580947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022545	AGGC	2	8	582299	582306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022545	CGGA	2	8	588961	588968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022545	AAAC	2	8	595333	595340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022545	CCGG	2	8	598083	598090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022545	AGTA	2	8	612685	612692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022545	GTGC	2	8	612701	612708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_022545	GCTG	2	8	620091	620098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_022545	CAGG	2	8	630261	630268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022545	AGCG	2	8	631540	631547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_022545	AGCC	2	8	633826	633833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022545	GGCG	2	8	638249	638256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_022545	CTGA	2	8	641350	641357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_022545	GATC	2	8	646879	646886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_022545	CCGG	2	8	659038	659045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022545	TTGA	2	8	660077	660084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_022545	TTCA	2	8	661267	661274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_022545	GCTG	2	8	661325	661332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_022545	GTCA	2	8	662896	662903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_022545	TATT	2	8	670047	670054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022545	TTTA	2	8	676273	676280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022545	AAGA	2	8	676967	676974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022545	AAGG	2	8	680942	680949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022545	ATCC	2	8	685885	685892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_022545	CCCG	2	8	688504	688511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_022545	AATC	2	8	690351	690358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_022545	TGAA	2	8	701444	701451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_022545	CGGG	2	8	704720	704727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
180	NC_022545	GGCA	2	8	711436	711443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
181	NC_022545	TCAT	2	8	714256	714263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_022545	CAGG	2	8	716539	716546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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184	NC_022545	TTCA	2	8	717861	717868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_022545	TTGC	2	8	725001	725008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_022545	CTGC	2	8	728753	728760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_022545	CTTA	2	8	728791	728798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_022545	TTGG	2	8	785879	785886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_022545	TTCG	2	8	797740	797747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_022545	AGTT	2	8	800835	800842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_022545	CGGC	2	8	926790	926797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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237	NC_022545	CTGC	2	8	932884	932891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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239	NC_022545	CTGG	2	8	936921	936928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_022545	ATAA	2	8	1077377	1077384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_022545	AATT	2	8	1089106	1089113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_022545	CGAT	2	8	1090688	1090695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
282	NC_022545	TGCG	2	8	1091194	1091201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
283	NC_022545	GACG	2	8	1109425	1109432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
284	NC_022545	CGGT	2	8	1110172	1110179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_022545	CTCC	2	8	1120255	1120262	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
286	NC_022545	CTTT	2	8	1122892	1122899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_022545	TCGA	2	8	1135825	1135832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_022545	CTGG	2	8	1137445	1137452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
289	NC_022545	GATC	2	8	1140397	1140404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_022545	ATTT	2	8	1140411	1140418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_022545	AGGA	2	8	1141042	1141049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_022545	GCAG	2	8	1141115	1141122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_022545	CTTG	2	8	1142259	1142266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
294	NC_022545	ATTC	2	8	1143365	1143372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
295	NC_022545	GCCG	2	8	1144466	1144473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_022545	GGGA	2	8	1997579	1997586	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
500	NC_022545	GCGG	2	8	1999373	1999380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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