MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 29404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022545	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728081
2	NC_022545	GCA	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728081
3	NC_022545	ATT	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728081
4	NC_022545	TAT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728081
5	NC_022545	CCG	2	6	528	533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728082
6	NC_022545	CAA	2	6	559	564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728082
7	NC_022545	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728082
8	NC_022545	TTC	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728082
9	NC_022545	GAA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728082
10	NC_022545	GGT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728082
11	NC_022545	GCC	2	6	893	898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728082
12	NC_022545	AGC	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728083
13	NC_022545	GCC	2	6	1158	1163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728083
14	NC_022545	TCA	2	6	1225	1230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728083
15	NC_022545	CAA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728083
16	NC_022545	GCG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728084
17	NC_022545	CAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728084
18	NC_022545	CGA	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728084
19	NC_022545	AGC	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728084
20	NC_022545	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728085
21	NC_022545	CGC	2	6	1993	1998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728085
22	NC_022545	CAA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728085
23	NC_022545	TTC	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728085
24	NC_022545	TGA	2	6	2100	2105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728085
25	NC_022545	GCT	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728085
26	NC_022545	GTC	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728085
27	NC_022545	CAC	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728086
28	NC_022545	ATG	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728086
29	NC_022545	GGC	2	6	2685	2690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728087
30	NC_022545	TTC	2	6	2701	2706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728087
31	NC_022545	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728087
32	NC_022545	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728087
33	NC_022545	GCA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
34	NC_022545	GCA	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
35	NC_022545	GCG	2	6	2989	2994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728088
36	NC_022545	GGC	2	6	3064	3069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728088
37	NC_022545	ACG	2	6	3175	3180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
38	NC_022545	ACG	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
39	NC_022545	GAC	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
40	NC_022545	CTT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728088
41	NC_022545	CAG	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
42	NC_022545	CGG	2	6	3393	3398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728088
43	NC_022545	AGC	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728088
44	NC_022545	GCC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728088
45	NC_022545	TCG	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728089
46	NC_022545	ATC	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728090
47	NC_022545	ACA	2	6	5294	5299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728090
48	NC_022545	AAC	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728090
49	NC_022545	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728090
50	NC_022545	CGT	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728090
51	NC_022545	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728090
52	NC_022545	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728090
53	NC_022545	AGG	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728090
54	NC_022545	CGT	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728091
55	NC_022545	TTG	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728091
56	NC_022545	CGC	2	6	6007	6012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728091
57	NC_022545	TCA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728091
58	NC_022545	CAA	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728092
59	NC_022545	CGC	2	6	6807	6812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728093
60	NC_022545	TGC	2	6	6953	6958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728093
61	NC_022545	GGT	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728093
62	NC_022545	AAG	2	6	7002	7007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728093
63	NC_022545	TTG	2	6	7125	7130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728093
64	NC_022545	CAT	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728094
65	NC_022545	CGG	2	6	7307	7312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728094
66	NC_022545	CGC	2	6	7315	7320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728094
67	NC_022545	CTC	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728094
68	NC_022545	GCC	2	6	7343	7348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728094
69	NC_022545	GTC	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728094
70	NC_022545	CAT	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728094
71	NC_022545	TCA	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728094
72	NC_022545	ATC	2	6	7568	7573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728094
73	NC_022545	CGG	2	6	7581	7586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728094
74	NC_022545	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728094
75	NC_022545	TCA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728094
76	NC_022545	GGC	2	6	8069	8074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728095
77	NC_022545	ACG	2	6	8086	8091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728095
78	NC_022545	CGA	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728096
79	NC_022545	GAA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728096
80	NC_022545	CGG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728096
81	NC_022545	GCC	2	6	8726	8731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728096
82	NC_022545	GGA	2	6	8876	8881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728096
83	NC_022545	TAC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728096
84	NC_022545	AAC	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728096
85	NC_022545	TCG	2	6	9245	9250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728096
86	NC_022545	AGG	2	6	9366	9371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728096
87	NC_022545	ATT	2	6	9386	9391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728096
88	NC_022545	GAA	2	6	9397	9402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728096
89	NC_022545	ATG	2	6	9405	9410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728096
90	NC_022545	CCT	2	6	9416	9421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728096
91	NC_022545	CGC	2	6	9478	9483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728096
92	NC_022545	TTA	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728096
93	NC_022545	TGC	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728096
94	NC_022545	TCG	2	6	9714	9719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728096
95	NC_022545	AAC	2	6	9826	9831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728096
96	NC_022545	AAG	2	6	9847	9852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728096
97	NC_022545	CAT	2	6	9946	9951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728096
98	NC_022545	CAT	2	6	10367	10372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728097
99	NC_022545	TGT	2	6	10494	10499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728097
100	NC_022545	GAC	2	6	10515	10520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728097
101	NC_022545	GCT	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728097
102	NC_022545	CGT	2	6	10690	10695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728097
103	NC_022545	GCC	2	6	10722	10727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728097
104	NC_022545	TCG	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728097
105	NC_022545	TGC	2	6	10823	10828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728097
106	NC_022545	CTC	2	6	10902	10907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728097
107	NC_022545	GCG	2	6	11057	11062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728097
108	NC_022545	GAA	2	6	11099	11104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728097
109	NC_022545	ACA	2	6	11122	11127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728097
110	NC_022545	CGA	3	9	11149	11157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728097
111	NC_022545	TCA	2	6	11195	11200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728097
112	NC_022545	TGG	2	6	11224	11229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728097
113	NC_022545	TGT	2	6	11282	11287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728097
114	NC_022545	CAC	2	6	11360	11365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728097
115	NC_022545	ACG	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728098
116	NC_022545	GAA	2	6	11647	11652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728098
117	NC_022545	CGG	2	6	11724	11729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728098
118	NC_022545	CGC	2	6	11800	11805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728098
119	NC_022545	GGT	2	6	11873	11878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728098
120	NC_022545	CCG	2	6	11989	11994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728098
121	NC_022545	TGA	2	6	12093	12098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728098
122	NC_022545	ACT	2	6	12187	12192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728098
123	NC_022545	GGA	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728098
124	NC_022545	TTG	2	6	12306	12311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728098
125	NC_022545	GAT	2	6	12407	12412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728098
126	NC_022545	GAT	2	6	12563	12568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728098
127	NC_022545	GGC	2	6	12697	12702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728098
128	NC_022545	TCT	2	6	12715	12720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728098
129	NC_022545	AGC	2	6	12750	12755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728098
130	NC_022545	GAG	2	6	12869	12874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728098
131	NC_022545	TGC	2	6	12906	12911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728098
132	NC_022545	ATT	2	6	13107	13112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728098
133	NC_022545	CCT	2	6	13273	13278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728098
134	NC_022545	TAA	2	6	13312	13317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728098
135	NC_022545	GTC	2	6	13319	13324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728098
136	NC_022545	CTG	2	6	13413	13418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728098
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139	NC_022545	CAA	2	6	13640	13645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728098
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142	NC_022545	TGG	2	6	13833	13838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728098
143	NC_022545	CAA	2	6	13907	13912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728098
144	NC_022545	GCT	2	6	14075	14080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728098
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157	NC_022545	GGC	2	6	15090	15095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728099
158	NC_022545	AGA	2	6	15111	15116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728099
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239	NC_022545	TCG	2	6	24033	24038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728107
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246	NC_022545	CCG	2	6	24462	24467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728107
247	NC_022545	ACC	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728107
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250	NC_022545	GCG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728107
251	NC_022545	TCC	3	9	24832	24840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728108
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253	NC_022545	CCT	2	6	24995	25000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728108
254	NC_022545	CCG	2	6	25104	25109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728108
255	NC_022545	GAT	2	6	25151	25156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728108
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258	NC_022545	GAA	2	6	25687	25692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728110
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270	NC_022545	CGG	2	6	26640	26645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728111
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282	NC_022545	GGA	2	6	27693	27698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728111
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