MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 8229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022544	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022544	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022544	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022544	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022544	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022544	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022544	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022544	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022544	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022544	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022544	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022544	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_022544	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022544	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022544	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022544	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022544	TTA	2	6	11332	11337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022544	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022544	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022544	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022544	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022544	TTC	2	6	14753	14758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022544	TTG	2	6	14834	14839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022544	CAG	2	6	14877	14882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022544	TAT	2	6	14970	14975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022544	ATG	2	6	16001	16006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022544	CCT	2	6	16022	16027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022544	ATT	2	6	16055	16060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022544	ATT	2	6	17612	17617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022544	GTT	2	6	17704	17709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022544	GTT	2	6	17728	17733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022544	ATC	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022544	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022544	CCA	2	6	20031	20036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_022544	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022544	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022544	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022544	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022544	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022544	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022544	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022544	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022544	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022544	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022544	ATA	2	6	33134	33139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022544	CAT	2	6	33201	33206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022544	TAA	2	6	33255	33260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022544	GTG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022544	ATG	2	6	33327	33332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022544	ATA	3	9	34849	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022544	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022544	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022544	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022544	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022544	TAG	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022544	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022544	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022544	TGT	2	6	35292	35297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022544	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022544	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022544	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022544	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022544	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022544	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022544	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022544	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022544	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022544	AAT	2	6	41628	41633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022544	GTA	2	6	42916	42921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022544	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022544	GTT	2	6	44214	44219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022544	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022544	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022544	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022544	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022544	AAC	2	6	51862	51867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022544	ATT	2	6	51894	51899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022544	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022544	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022544	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022544	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022544	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022544	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022544	TGA	2	6	58771	58776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022544	GAA	2	6	58829	58834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022544	GTC	2	6	58844	58849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022544	CAG	2	6	63635	63640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022544	GCC	2	6	63687	63692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022544	CCG	2	6	63700	63705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_022544	CCG	2	6	63712	63717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022544	CAG	2	6	63758	63763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022544	GCC	2	6	63783	63788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_022544	CAG	3	9	63815	63823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022544	CCA	2	6	63859	63864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022544	CCA	2	6	63943	63948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_022544	CGC	2	6	63949	63954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_022544	CAG	2	6	63989	63994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022544	GCA	3	9	64009	64017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022544	CCA	2	6	64021	64026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_022544	AGC	2	6	64032	64037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022544	ACC	2	6	64038	64043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022544	CGG	2	6	64133	64138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022544	CGC	2	6	64172	64177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_022544	CAG	2	6	64193	64198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_022544	CGC	2	6	64246	64251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_022544	GCC	3	9	64266	64274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_022544	AGT	2	6	64303	64308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022544	GCC	3	9	64353	64361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_022544	CAG	3	9	64364	64372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022544	CAG	2	6	64388	64393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_022544	GCG	2	6	64438	64443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022544	CGT	2	6	64627	64632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_022544	CAG	2	6	64640	64645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022544	AGC	2	6	64692	64697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022544	CCG	2	6	64698	64703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022544	GCA	3	9	64714	64722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022544	CTT	2	6	64736	64741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022544	CAG	4	12	64757	64768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022544	CAG	2	6	64775	64780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022544	ATG	2	6	64782	64787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022544	ACG	2	6	66918	66923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022544	GAC	2	6	66932	66937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022544	TGC	2	6	67024	67029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022544	CCG	2	6	67037	67042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_022544	TAA	2	6	68437	68442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022544	ATT	2	6	68503	68508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022544	TTA	2	6	68510	68515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022544	TCT	2	6	73843	73848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022544	GGC	2	6	73951	73956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_022544	TTC	2	6	74979	74984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_022544	GTT	2	6	75004	75009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022544	TTA	2	6	75395	75400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022544	ATG	2	6	75434	75439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022544	GTT	2	6	75562	75567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022544	GTT	2	6	75572	75577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022544	GCC	2	6	75776	75781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_022544	TAA	2	6	77038	77043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022544	CGG	2	6	80287	80292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022544	TAA	2	6	80412	80417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_022544	CGG	2	6	82539	82544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_022544	ATA	2	6	182692	182697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_022544	CTA	2	6	185763	185768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_022544	ACT	2	6	185769	185774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_022544	CAA	2	6	185806	185811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_022544	GAG	2	6	185838	185843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_022544	TAA	2	6	189377	189382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_022544	TAC	2	6	189413	189418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_022544	TCT	2	6	189477	189482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_022544	TTA	2	6	190088	190093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_022544	CAA	2	6	190171	190176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_022544	GTG	2	6	194188	194193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_022544	ATT	2	6	202126	202131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_022544	CGG	2	6	202220	202225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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299	NC_022544	TAA	2	6	202340	202345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_022544	TTA	2	6	202487	202492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_022544	ACC	2	6	202749	202754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
307	NC_022544	TAT	2	6	202796	202801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_022544	TGG	2	6	202930	202935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_022544	GGT	2	6	294527	294532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_022544	TTA	2	6	294895	294900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_022544	ATT	2	6	294947	294952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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