MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 61469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022544	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722729
2	NC_022544	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722729
3	NC_022544	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722729
4	NC_022544	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
5	NC_022544	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722730
6	NC_022544	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
7	NC_022544	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
8	NC_022544	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
9	NC_022544	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
10	NC_022544	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
11	NC_022544	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722730
12	NC_022544	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
13	NC_022544	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
14	NC_022544	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
15	NC_022544	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
16	NC_022544	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722730
17	NC_022544	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722730
18	NC_022544	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722730
19	NC_022544	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
20	NC_022544	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
21	NC_022544	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722730
22	NC_022544	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722730
23	NC_022544	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
24	NC_022544	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
25	NC_022544	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722730
26	NC_022544	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722730
27	NC_022544	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722730
28	NC_022544	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722730
29	NC_022544	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722730
30	NC_022544	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722730
31	NC_022544	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
32	NC_022544	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
33	NC_022544	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722730
34	NC_022544	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
35	NC_022544	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722730
36	NC_022544	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722730
37	NC_022544	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722730
38	NC_022544	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
39	NC_022544	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
40	NC_022544	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722730
41	NC_022544	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722730
42	NC_022544	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722730
43	NC_022544	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722730
44	NC_022544	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722730
45	NC_022544	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722730
46	NC_022544	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722730
47	NC_022544	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722730
48	NC_022544	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722731
49	NC_022544	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722731
50	NC_022544	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722731
51	NC_022544	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722731
52	NC_022544	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722731
53	NC_022544	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722731
54	NC_022544	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722731
55	NC_022544	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722731
56	NC_022544	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722731
57	NC_022544	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722731
58	NC_022544	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722731
59	NC_022544	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722731
60	NC_022544	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722731
61	NC_022544	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722731
62	NC_022544	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722732
63	NC_022544	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722732
64	NC_022544	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722732
65	NC_022544	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722732
66	NC_022544	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722732
67	NC_022544	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722732
68	NC_022544	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722732
69	NC_022544	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722732
70	NC_022544	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722732
71	NC_022544	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722732
72	NC_022544	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722732
73	NC_022544	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722732
74	NC_022544	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722732
75	NC_022544	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722732
76	NC_022544	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722732
77	NC_022544	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722732
78	NC_022544	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722732
79	NC_022544	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722732
80	NC_022544	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722732
81	NC_022544	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722732
82	NC_022544	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722732
83	NC_022544	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722732
84	NC_022544	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722732
85	NC_022544	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722733
86	NC_022544	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722733
87	NC_022544	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722733
88	NC_022544	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722733
89	NC_022544	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722733
90	NC_022544	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722733
91	NC_022544	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722733
92	NC_022544	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722733
93	NC_022544	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722733
94	NC_022544	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722733
95	NC_022544	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722733
96	NC_022544	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722734
97	NC_022544	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722734
98	NC_022544	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722734
99	NC_022544	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722734
100	NC_022544	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722734
101	NC_022544	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722734
102	NC_022544	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722734
103	NC_022544	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722734
104	NC_022544	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722734
105	NC_022544	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722734
106	NC_022544	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722734
107	NC_022544	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722734
108	NC_022544	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722734
109	NC_022544	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722734
110	NC_022544	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722734
111	NC_022544	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722734
112	NC_022544	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722734
113	NC_022544	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722735
114	NC_022544	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722735
115	NC_022544	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722735
116	NC_022544	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722735
117	NC_022544	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722735
118	NC_022544	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722735
119	NC_022544	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722735
120	NC_022544	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722735
121	NC_022544	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722735
122	NC_022544	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722735
123	NC_022544	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722735
124	NC_022544	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722735
125	NC_022544	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722736
126	NC_022544	GAG	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722736
127	NC_022544	TGA	2	6	8872	8877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722736
128	NC_022544	GCT	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722736
129	NC_022544	CAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722737
130	NC_022544	GGC	2	6	9580	9585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722737
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255	NC_022544	CTG	2	6	18359	18364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722746
256	NC_022544	CGG	2	6	18433	18438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722746
257	NC_022544	CCG	2	6	18468	18473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722746
258	NC_022544	GTG	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722746
259	NC_022544	GCT	2	6	18625	18630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722746
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261	NC_022544	ACT	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722746
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