MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 9559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022544	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022544	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	549722730
3	NC_022544	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	549722730
4	NC_022544	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	549722730
5	NC_022544	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	549722730
6	NC_022544	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	549722730
7	NC_022544	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	549722730
8	NC_022544	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	549722730
9	NC_022544	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	549722730
10	NC_022544	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	549722731
11	NC_022544	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	549722731
12	NC_022544	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	549722732
13	NC_022544	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	549722732
14	NC_022544	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	549722732
15	NC_022544	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	549722732
16	NC_022544	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	549722733
17	NC_022544	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	549722733
18	NC_022544	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	549722733
19	NC_022544	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	549722733
20	NC_022544	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	549722734
21	NC_022544	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	549722734
22	NC_022544	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	549722735
23	NC_022544	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	549722735
24	NC_022544	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	549722735
25	NC_022544	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	549722735
26	NC_022544	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	549722735
27	NC_022544	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	549722736
28	NC_022544	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	549722737
29	NC_022544	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	549722738
30	NC_022544	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	549722740
31	NC_022544	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	549722741
32	NC_022544	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	549722741
33	NC_022544	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	549722742
34	NC_022544	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	549722742
35	NC_022544	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	549722742
36	NC_022544	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	549722745
37	NC_022544	GC	3	6	18366	18371	0 %	0 %	50 %	50 %	549722746
38	NC_022544	CT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	0 %	50 %	549722747
39	NC_022544	GC	3	6	20656	20661	0 %	0 %	50 %	50 %	549722747
40	NC_022544	GC	3	6	20776	20781	0 %	0 %	50 %	50 %	549722747
41	NC_022544	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	549722747
42	NC_022544	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	549722747
43	NC_022544	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	549722747
44	NC_022544	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	549722748
45	NC_022544	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	549722748
46	NC_022544	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	549722748
47	NC_022544	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022544	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022544	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	549722750
50	NC_022544	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	549722750
51	NC_022544	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
52	NC_022544	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
53	NC_022544	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
54	NC_022544	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
55	NC_022544	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
56	NC_022544	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
57	NC_022544	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
58	NC_022544	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	549722754
59	NC_022544	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	549722754
60	NC_022544	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	549722754
61	NC_022544	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	549722755
62	NC_022544	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	549722755
63	NC_022544	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	549722755
64	NC_022544	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022544	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	549722759
66	NC_022544	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	549722759
67	NC_022544	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	549722759
68	NC_022544	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	549722760
69	NC_022544	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	549722760
70	NC_022544	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	549722761
71	NC_022544	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	549722761
72	NC_022544	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	549722761
73	NC_022544	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	549722762
74	NC_022544	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	549722763
75	NC_022544	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022544	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022544	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022544	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022544	CG	3	6	40377	40382	0 %	0 %	50 %	50 %	549722764
80	NC_022544	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	549722764
81	NC_022544	GT	3	6	41771	41776	0 %	50 %	50 %	0 %	549722765
82	NC_022544	TG	3	6	42801	42806	0 %	50 %	50 %	0 %	549722765
83	NC_022544	CG	3	6	43316	43321	0 %	0 %	50 %	50 %	549722766
84	NC_022544	TA	3	6	43689	43694	50 %	50 %	0 %	0 %	549722766
85	NC_022544	CA	3	6	44710	44715	50 %	0 %	0 %	50 %	549722767
86	NC_022544	CA	3	6	45002	45007	50 %	0 %	0 %	50 %	549722767
87	NC_022544	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	549722767
88	NC_022544	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022544	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022544	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	549722768
91	NC_022544	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	549722768
92	NC_022544	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	549722768
93	NC_022544	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022544	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	549722769
95	NC_022544	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	549722770
96	NC_022544	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	549722770
97	NC_022544	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	549722770
98	NC_022544	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	549722771
99	NC_022544	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	549722771
100	NC_022544	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	549722772
101	NC_022544	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	549722774
102	NC_022544	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	549722774
103	NC_022544	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
104	NC_022544	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
105	NC_022544	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
106	NC_022544	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
107	NC_022544	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
108	NC_022544	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	549722776
109	NC_022544	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	549722778
110	NC_022544	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	549722778
111	NC_022544	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	549722779
112	NC_022544	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	549722780
113	NC_022544	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	549722781
114	NC_022544	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	549722782
115	NC_022544	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	549722782
116	NC_022544	GC	3	6	64585	64590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022544	GC	3	6	66229	66234	0 %	0 %	50 %	50 %	549722783
118	NC_022544	CG	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	549722783
119	NC_022544	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	549722784
120	NC_022544	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	549722785
121	NC_022544	GC	3	6	69036	69041	0 %	0 %	50 %	50 %	549722786
122	NC_022544	GC	3	6	69610	69615	0 %	0 %	50 %	50 %	549722786
123	NC_022544	AC	3	6	69662	69667	50 %	0 %	0 %	50 %	549722786
124	NC_022544	AG	3	6	69808	69813	50 %	0 %	50 %	0 %	549722787
125	NC_022544	CG	3	6	69887	69892	0 %	0 %	50 %	50 %	549722787
126	NC_022544	GC	3	6	69915	69920	0 %	0 %	50 %	50 %	549722787
127	NC_022544	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	549722788
128	NC_022544	CG	3	6	70824	70829	0 %	0 %	50 %	50 %	549722788
129	NC_022544	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	549722789
130	NC_022544	GC	3	6	71976	71981	0 %	0 %	50 %	50 %	549722789
131	NC_022544	CG	3	6	72211	72216	0 %	0 %	50 %	50 %	549722789
132	NC_022544	GC	3	6	72283	72288	0 %	0 %	50 %	50 %	549722789
133	NC_022544	GC	3	6	72460	72465	0 %	0 %	50 %	50 %	549722790
134	NC_022544	CG	3	6	73321	73326	0 %	0 %	50 %	50 %	549722791
135	NC_022544	GC	3	6	73467	73472	0 %	0 %	50 %	50 %	549722791
136	NC_022544	TC	3	6	73854	73859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022544	GC	3	6	73963	73968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022544	AT	3	6	74898	74903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022544	AT	3	6	75466	75471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022544	CT	3	6	76173	76178	0 %	50 %	0 %	50 %	549722793
141	NC_022544	GC	3	6	77341	77346	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
142	NC_022544	CG	3	6	77477	77482	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
143	NC_022544	CG	3	6	77953	77958	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
144	NC_022544	GC	5	10	78999	79008	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
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146	NC_022544	GC	3	6	79644	79649	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
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