MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022543	TTAAT	2	10	3350	3359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022543	CTTCA	2	10	8085	8094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022543	CCTAT	2	10	22509	22518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_022543	TAAAA	2	10	34684	34693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022543	TTAAT	2	10	48549	48558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022543	ACCAC	2	10	50456	50465	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_022543	AGGCA	2	10	53588	53597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022543	AAGTT	2	10	72221	72230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022543	AATCC	2	10	73395	73404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022543	GACAT	2	10	93050	93059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022543	ATTAT	2	10	118256	118265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022543	TGTTA	2	10	121013	121022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022543	AAATT	2	10	121127	121136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022543	CTTTT	2	10	125180	125189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022543	ATAAG	2	10	131803	131812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022543	ATTAA	2	10	135088	135097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022543	ATTTA	2	10	135202	135211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022543	TTTTA	2	10	135242	135251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022543	ATGGA	2	10	138349	138358	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022543	TGCTC	2	10	162369	162378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022543	GGGTG	2	10	168946	168955	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022543	CTACT	2	10	169826	169835	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_022543	TCAAA	2	10	170193	170202	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022543	GAACA	2	10	170308	170317	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022543	AGCTC	2	10	172996	173005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022543	TTTTC	2	10	202248	202257	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022543	AATAA	2	10	202353	202362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022543	ATTTC	2	10	202371	202380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022543	TTCTT	2	10	207902	207911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022543	ATTGT	2	10	210306	210315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022543	TGATG	2	10	221357	221366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022543	ATTTA	2	10	236638	236647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022543	TTAAA	2	10	236723	236732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022543	TATTT	2	10	237138	237147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022543	ATTTC	2	10	237157	237166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022543	AACTA	2	10	237306	237315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022543	TATTT	2	10	241782	241791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022543	TCATC	2	10	265108	265117	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022543	AGGGA	2	10	268563	268572	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022543	TTTCA	2	10	275017	275026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022543	CTTTT	2	10	292969	292978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022543	AACTT	2	10	293022	293031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022543	AAACT	2	10	310858	310867	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022543	CTAAA	2	10	311026	311035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022543	TAACA	2	10	314876	314885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022543	AAAAT	2	10	320261	320270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022543	ACAAA	2	10	324643	324652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022543	TTACG	2	10	335647	335656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022543	ACATT	2	10	337743	337752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022543	AGACA	2	10	347897	347906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022543	TTGAA	2	10	348053	348062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022543	TTAAT	2	10	352291	352300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022543	AATCA	2	10	393479	393488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022543	TTTAA	2	10	395723	395732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022543	TTAAC	2	10	414194	414203	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022543	AACCC	2	10	426885	426894	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_022543	TGAAT	2	10	454645	454654	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022543	AATGA	2	10	454739	454748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022543	ATTGT	2	10	464513	464522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022543	ATTTT	2	10	464785	464794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022543	ATTTG	2	10	464798	464807	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022543	CCAAA	2	10	468116	468125	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022543	AAAGG	2	10	471798	471807	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022543	CAATT	2	10	526583	526592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022543	AAGGT	2	10	528460	528469	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022543	TGTTT	2	10	539210	539219	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022543	AAAGT	2	10	559198	559207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022543	TTCCA	2	10	561867	561876	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_022543	CGCAG	2	10	567624	567633	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_022543	CTTAA	2	10	568210	568219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022543	CTTTG	2	10	596537	596546	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022543	TTTCA	2	10	598578	598587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022543	TAACC	2	10	604276	604285	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_022543	TTTTA	2	10	618807	618816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022543	TTGTT	2	10	624252	624261	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022543	AAAAC	2	10	626831	626840	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022543	TTGAG	2	10	636870	636879	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022543	ATTAT	2	10	647686	647695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022543	TGTTT	2	10	651165	651174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022543	AAATG	2	10	660275	660284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022543	TTTCT	2	10	668999	669008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022543	TGGTT	2	10	679137	679146	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022543	TTTTC	2	10	687931	687940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022543	AAAAT	2	10	697663	697672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022543	ATTTT	2	10	699514	699523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022543	GTTTT	2	10	716151	716160	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022543	GGAAT	2	10	716837	716846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022543	AACAG	2	10	731250	731259	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_022543	GATTT	2	10	742774	742783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022543	TGAAT	2	10	748197	748206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022543	TGGTT	2	10	751384	751393	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022543	ATCAA	2	10	751444	751453	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022543	CTTTC	2	10	751661	751670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_022543	TGAAT	2	10	755198	755207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022543	TTTGT	2	10	789392	789401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022543	ACACA	2	10	792585	792594	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_022543	AAATA	2	10	794760	794769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022543	TTCAG	2	10	811954	811963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022543	TGCCT	2	10	820442	820451	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_022543	CTTTA	2	10	830611	830620	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022543	CAAAA	2	10	830776	830785	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_022543	TTTGC	2	10	836606	836615	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022543	TTGAT	2	10	839368	839377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022543	AAATG	2	10	845675	845684	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022543	AATTC	2	10	845764	845773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022543	AAACT	2	10	857749	857758	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022543	GGCTG	2	10	858577	858586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022543	GAACC	2	10	865946	865955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_022543	TAAAA	2	10	884485	884494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022543	TGAAA	2	10	886362	886371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022543	GGATA	2	10	904386	904395	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022543	TGGTG	2	10	929464	929473	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022543	AAGGG	2	10	934822	934831	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022543	AAAAC	2	10	947236	947245	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022543	GTGCT	2	10	949820	949829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022543	TTCAC	2	10	964184	964193	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022543	TAAAT	2	10	973684	973693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022543	GTAAT	2	10	990234	990243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022543	AATAA	2	10	1007830	1007839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022543	TTGAA	2	10	1036363	1036372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022543	TACAT	2	10	1062132	1062141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022543	TTTTG	2	10	1069006	1069015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022543	AGACA	2	10	1069086	1069095	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022543	GAACT	2	10	1070850	1070859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022543	CTTTT	2	10	1071952	1071961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022543	GTTTT	2	10	1074852	1074861	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022543	AAAAG	2	10	1078713	1078722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022543	ATTAA	2	10	1079529	1079538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022543	TAGAT	2	10	1079822	1079831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022543	TTTGT	2	10	1080726	1080735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022543	ATTTA	2	10	1081380	1081389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022543	ATTAA	2	10	1085065	1085074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022543	ATTTT	2	10	1088248	1088257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022543	AATAA	2	10	1089060	1089069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022543	CTTAT	2	10	1089080	1089089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022543	TTTCT	2	10	1089974	1089983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022543	CAAAT	2	10	1100944	1100953	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022543	AAAGG	2	10	1101077	1101086	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022543	TGTTT	2	10	1102375	1102384	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022543	ATTGA	2	10	1116731	1116740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022543	AAAGA	2	10	1128387	1128396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022543	TTTTC	2	10	1140342	1140351	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022543	CAATT	2	10	1174042	1174051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022543	ATGAA	2	10	1179322	1179331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022543	GTTTG	2	10	1191387	1191396	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022543	TTTAG	2	10	1226562	1226571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022543	CAACA	2	10	1239852	1239861	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022543	GCAAC	2	10	1243256	1243265	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022543	CAAAG	2	10	1247170	1247179	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_022543	TAACA	2	10	1257612	1257621	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_022543	TTACC	2	10	1261568	1261577	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_022543	AAACT	2	10	1328288	1328297	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_022543	TTAAC	2	10	1384053	1384062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_022543	CTTAA	2	10	1407282	1407291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_022543	TTGTT	2	10	1449800	1449809	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022543	GAACT	2	10	1449878	1449887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_022543	TTTGA	2	10	1456533	1456542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_022543	TCGAG	2	10	1481702	1481711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_022543	AAGCT	2	10	1483248	1483257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_022543	ATTGT	2	10	1488596	1488605	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022543	GTTAC	2	10	1496895	1496904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_022543	TGAAG	2	10	1498581	1498590	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022543	TGATT	2	10	1543375	1543384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_022543	ATAGA	2	10	1564139	1564148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022543	GTCTT	2	10	1576521	1576530	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_022543	CAATG	2	10	1596993	1597002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_022543	TCATA	2	10	1614397	1614406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_022543	TCCAT	2	10	1617933	1617942	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_022543	AAAGC	2	10	1618318	1618327	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_022543	CTAAG	2	10	1641294	1641303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_022543	GAAAG	2	10	1665468	1665477	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022543	TCCTT	2	10	1679314	1679323	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_022543	GCCCA	2	10	1724705	1724714	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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237	NC_022543	GCCAC	2	10	2052282	2052291	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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243	NC_022543	TTGAA	2	10	2139429	2139438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_022543	CCTTC	2	10	2157680	2157689	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
245	NC_022543	AGCAA	2	10	2170546	2170555	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
246	NC_022543	TGAGC	2	10	2207571	2207580	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
247	NC_022543	AGATC	2	10	2209092	2209101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.