MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 plasmid IRBL74_p

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022536	CCCTG	2	10	16274	16283	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_022536	GGTAG	2	10	50420	50429	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022536	AAGAG	2	10	55313	55322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022536	CGTCC	2	10	61716	61725	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_022536	GTGAT	2	10	81835	81844	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022536	GCAAG	2	10	85333	85342	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022536	GCTGA	2	10	120371	120380	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022536	CGACC	2	10	120945	120954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_022536	CTCCG	2	10	121153	121162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_022536	CGGCT	2	10	147754	147763	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022536	GCTTT	2	10	156511	156520	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022536	TGCAC	2	10	158786	158795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022536	GGCAG	2	10	159061	159070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022536	GGAGT	2	10	162347	162356	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022536	GCAAC	2	10	164048	164057	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_022536	GCAAT	2	10	166392	166401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022536	CACGT	2	10	167291	167300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_022536	CTCCA	2	10	168466	168475	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_022536	GTGTT	2	10	169447	169456	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022536	CCCGG	2	10	169963	169972	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_022536	CCCTG	2	10	191395	191404	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_022536	CTTTG	2	10	206337	206346	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022536	CTTCG	2	10	213615	213624	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_022536	GTTTT	2	10	227254	227263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022536	GTGCC	2	10	230673	230682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022536	GCCGA	2	10	235424	235433	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022536	AGAGC	2	10	251786	251795	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022536	TTTTC	2	10	254455	254464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_022536	TGCCT	2	10	258572	258581	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_022536	CCGCT	2	10	260505	260514	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_022536	ACTTG	2	10	267468	267477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022536	GCCGA	2	10	275641	275650	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022536	CTTTG	2	10	281345	281354	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022536	TTCTG	2	10	299861	299870	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022536	AGAGG	2	10	300015	300024	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022536	AGTTG	2	10	316951	316960	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022536	CACGC	2	10	317083	317092	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_022536	GAAAT	2	10	359254	359263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022536	GTTAT	2	10	396765	396774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022536	GCCGT	2	10	415894	415903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022536	GCGTC	2	10	421708	421717	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022536	CAAAA	2	10	439854	439863	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022536	CGTTT	2	10	439887	439896	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022536	TGCGA	2	10	466623	466632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022536	CCGAC	2	10	474747	474756	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_022536	AAAAC	2	10	491395	491404	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022536	TAACG	2	10	521681	521690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022536	CACTC	2	10	542205	542214	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_022536	TGCTC	2	10	558364	558373	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_022536	TCGCC	2	10	568446	568455	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_022536	GCCTC	2	10	568976	568985	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.