MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 plasmid IRBL74_p

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022536	AGGA	2	8	2279	2286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022536	TCAG	2	8	5725	5732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022536	TCCT	2	8	13314	13321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022536	AACT	2	8	14064	14071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022536	TAGA	2	8	19120	19127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022536	TGCA	2	8	31178	31185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022536	TAGC	2	8	37095	37102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022536	TGGC	2	8	40472	40479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022536	CCGG	2	8	48978	48985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022536	CCGC	2	8	57292	57299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_022536	GGAA	2	8	58909	58916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022536	TCGC	2	8	59695	59702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022536	ACGC	2	8	59709	59716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022536	CAGT	2	8	64249	64256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022536	TAAC	2	8	66657	66664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022536	TCGA	2	8	67397	67404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022536	GCGG	2	8	69807	69814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022536	TCGA	2	8	70667	70674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022536	GAAA	2	8	75874	75881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022536	TGCT	2	8	84556	84563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022536	CGGA	2	8	85271	85278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022536	TTTC	2	8	85399	85406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022536	CCGG	2	8	86784	86791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022536	AGAA	2	8	86853	86860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022536	TGAT	2	8	88819	88826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022536	GCAA	2	8	89418	89425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022536	GCAT	2	8	90636	90643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022536	TAAT	2	8	91909	91916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022536	ACGG	2	8	94219	94226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022536	GACG	2	8	97044	97051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022536	ACGA	2	8	104969	104976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022536	TCCT	2	8	105991	105998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022536	TTTG	2	8	109173	109180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022536	TCAG	2	8	109338	109345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022536	GGCG	2	8	109375	109382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022536	GTCG	2	8	115754	115761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_022536	CCCT	2	8	115819	115826	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_022536	TCCG	2	8	116955	116962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022536	GCCA	2	8	116975	116982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022536	GGAA	2	8	117026	117033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022536	TTGG	2	8	117067	117074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022536	CCGC	2	8	120298	120305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_022536	TTCT	2	8	120314	120321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022536	CTGG	2	8	120361	120368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022536	CTGC	2	8	120546	120553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022536	TTCG	2	8	120977	120984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022536	TCGG	2	8	121973	121980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022536	TTGA	2	8	121983	121990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022536	GATT	2	8	124050	124057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022536	ACGA	2	8	138818	138825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022536	GATG	2	8	138872	138879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022536	GTCG	2	8	138952	138959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022536	GCCC	2	8	147805	147812	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_022536	ACGC	2	8	154818	154825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022536	GCAT	2	8	154972	154979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022536	GCCA	2	8	156476	156483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022536	GGTT	2	8	159047	159054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022536	CGGT	2	8	159119	159126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022536	GTCG	2	8	163198	163205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022536	GATC	2	8	163823	163830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022536	TGCG	2	8	165617	165624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022536	TCAG	2	8	170347	170354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022536	AATC	2	8	172295	172302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022536	ACCC	2	8	176845	176852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_022536	GTCA	2	8	177914	177921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022536	CGTT	2	8	180344	180351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_022536	GCTT	2	8	182595	182602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022536	ATTG	2	8	189621	189628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022536	GGCC	2	8	201856	201863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022536	AGGG	2	8	209221	209228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022536	GCTG	2	8	211544	211551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_022536	AGCC	2	8	213729	213736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022536	GGCC	2	8	214009	214016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022536	CGGC	2	8	214256	214263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022536	ACCG	2	8	219079	219086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022536	TCAT	2	8	232973	232980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_022536	TGCA	2	8	234542	234549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_022536	CTTC	2	8	235315	235322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022536	CTGC	2	8	236528	236535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022536	TCCG	2	8	236962	236969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022536	AAGA	2	8	237959	237966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022536	TTGG	2	8	245404	245411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022536	GTTG	2	8	249384	249391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022536	CGTC	2	8	249405	249412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022536	TCTT	2	8	249413	249420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_022536	TCAA	2	8	250286	250293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022536	CGCA	2	8	251776	251783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022536	GGTC	2	8	253031	253038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022536	TTTG	2	8	253054	253061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022536	GGCG	2	8	254521	254528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022536	TTAA	2	8	255108	255115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022536	CCCA	2	8	260138	260145	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_022536	CCGG	2	8	260436	260443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022536	GGCC	2	8	260453	260460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022536	GCCC	2	8	264729	264736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_022536	GTAT	2	8	267350	267357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022536	CGAT	2	8	267478	267485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_022536	TGGA	2	8	269401	269408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022536	TTTG	2	8	269417	269424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022536	TCAA	2	8	270707	270714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022536	CTGC	2	8	275615	275622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022536	ATTG	2	8	275754	275761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022536	AGGC	2	8	278199	278206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022536	ATCG	2	8	287066	287073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_022536	GGCG	2	8	293134	293141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022536	TGTT	2	8	293979	293986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022536	ACGC	2	8	298964	298971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022536	CCAC	2	8	299324	299331	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_022536	GACC	2	8	299876	299883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022536	AATG	2	8	300090	300097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022536	GAGG	2	8	300122	300129	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022536	GGCT	2	8	313237	313244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_022536	TCAA	2	8	313386	313393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022536	TCCT	2	8	316891	316898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022536	TCTA	2	8	317358	317365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022536	ATTC	2	8	317372	317379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_022536	AAGG	2	8	317450	317457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022536	CACT	2	8	327733	327740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022536	GGGC	2	8	332220	332227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022536	CCTT	2	8	335078	335085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022536	TCAA	2	8	335948	335955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_022536	AACG	2	8	335957	335964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_022536	CGTG	2	8	335977	335984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022536	CCCG	2	8	336005	336012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_022536	CGCA	2	8	338029	338036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022536	CCGA	2	8	344728	344735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022536	GCGG	2	8	350291	350298	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022536	CTGC	2	8	352876	352883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022536	CGGT	2	8	352902	352909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022536	AAGC	2	8	352969	352976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022536	AGGT	2	8	354195	354202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022536	TCCG	2	8	354237	354244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022536	CACG	2	8	362636	362643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022536	CTTT	2	8	365653	365660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_022536	TGAT	2	8	372753	372760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022536	TCGC	2	8	380793	380800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022536	CAAA	2	8	385545	385552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022536	CCTT	2	8	390438	390445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022536	GATC	2	8	403275	403282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022536	GATC	2	8	407900	407907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022536	TCAA	2	8	407919	407926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022536	TGAT	2	8	407990	407997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022536	GGCC	2	8	419772	419779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022536	TGGA	2	8	420539	420546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022536	CAGA	2	8	420669	420676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022536	TCAA	2	8	420804	420811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_022536	CGAA	2	8	421736	421743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022536	GCCC	2	8	421819	421826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_022536	AGCC	2	8	425268	425275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022536	CGAT	2	8	425390	425397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022536	GAGC	2	8	425503	425510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_022536	TCCG	2	8	427510	427517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022536	CCTT	2	8	427662	427669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022536	TCAA	2	8	427958	427965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_022536	CCGC	2	8	430516	430523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
156	NC_022536	TAAA	2	8	430620	430627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022536	AGAA	2	8	430764	430771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022536	CTAC	2	8	430810	430817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_022536	CGCC	2	8	431545	431552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
160	NC_022536	ATGG	2	8	432403	432410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022536	GGGA	2	8	432456	432463	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022536	TTCG	2	8	432541	432548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_022536	ACGG	2	8	433159	433166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_022536	GACA	2	8	435284	435291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_022536	GGCT	2	8	440837	440844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_022536	CAAA	2	8	440939	440946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_022536	TGGT	2	8	443777	443784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022536	GCTG	2	8	445770	445777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_022536	CGGT	2	8	446725	446732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_022536	TGAA	2	8	450182	450189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022536	ATAA	2	8	457096	457103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022536	CGTC	2	8	462740	462747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
173	NC_022536	TAAT	2	8	462917	462924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022536	TCCA	2	8	465568	465575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_022536	AACA	2	8	468239	468246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_022536	CGGA	2	8	489581	489588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_022536	AGTC	2	8	491370	491377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_022536	AGAC	2	8	492368	492375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_022536	GTCC	2	8	492404	492411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
180	NC_022536	GAAA	2	8	495376	495383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022536	CATG	2	8	497985	497992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_022536	GAGG	2	8	498010	498017	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022536	TCGT	2	8	506833	506840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_022536	GCGG	2	8	507053	507060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
185	NC_022536	CATC	2	8	507118	507125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_022536	GCTT	2	8	521707	521714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
187	NC_022536	CGGG	2	8	525260	525267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
188	NC_022536	TCTT	2	8	532695	532702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_022536	TCCA	2	8	552789	552796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_022536	ATTT	2	8	554914	554921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022536	GTCT	2	8	557645	557652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_022536	GCAT	2	8	559086	559093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_022536	ATTC	2	8	561225	561232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_022536	CTAC	2	8	561392	561399	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
195	NC_022536	CGAA	2	8	561627	561634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
196	NC_022536	ATGA	2	8	562385	562392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_022536	GCTC	2	8	568138	568145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
198	NC_022536	CGCC	2	8	568156	568163	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
199	NC_022536	TCGA	2	8	568955	568962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
200	NC_022536	TCCT	2	8	572404	572411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
201	NC_022536	GCAT	2	8	575906	575913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
202	NC_022536	ACAG	2	8	577206	577213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
203	NC_022536	TCAA	2	8	577214	577221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
204	NC_022536	CATT	2	8	583470	583477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.