MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022535	ATCCGG	2	12	61778	61789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022535	TTTTTG	2	12	110205	110216	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022535	ACCCAG	2	12	234449	234460	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022535	GAAAAA	2	12	287266	287277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022535	ATTTTT	2	12	314513	314524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022535	GCCGCG	2	12	319354	319365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022535	TTTTTG	2	12	486016	486027	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022535	TTTGGG	2	12	530436	530447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022535	TTTTGC	2	12	570286	570297	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022535	TACATT	2	12	577721	577732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022535	GAGGGG	2	12	728926	728937	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022535	CGATAT	2	12	789902	789913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022535	CTATCG	2	12	852365	852376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022535	TGTCCC	2	12	929777	929788	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022535	GGGAGA	2	12	948717	948728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022535	CAAAAG	2	12	959177	959188	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022535	CGGTGC	2	12	981548	981559	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022535	CGCTCG	2	12	987954	987965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022535	AGCCGC	2	12	1043074	1043085	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022535	AAGGAA	2	12	1090696	1090707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022535	TTTAAT	2	12	1097735	1097746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022535	ATGCGA	2	12	1132925	1132936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022535	AAGCTA	2	12	1238041	1238052	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022535	GCATCA	2	12	1283894	1283905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022535	AGGGCG	2	12	1316989	1317000	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022535	GGGAAA	2	12	1355055	1355066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022535	GATAAA	2	12	1384994	1385005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022535	CCTTTG	2	12	1389593	1389604	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022535	CATCCC	2	12	1579121	1579132	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_022535	TGTTTT	2	12	1583219	1583230	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022535	CGGCAG	2	12	1640898	1640909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022535	GATGAG	2	12	1660204	1660215	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022535	GCCACG	2	12	1697691	1697702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022535	CACCCC	2	12	1731605	1731616	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
35	NC_022535	CACGCG	2	12	1731624	1731635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022535	TTCTCA	2	12	1772231	1772242	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022535	CTGTCA	2	12	1920962	1920973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022535	GCGCCC	2	12	1943121	1943132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_022535	AAAAAC	2	12	1945233	1945244	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022535	TTTGCC	2	12	1955105	1955116	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022535	CAGGCA	2	12	1955192	1955203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022535	GCTTTG	2	12	2002992	2003003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022535	GTAATT	2	12	2027214	2027225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022535	CGATTC	2	12	2031437	2031448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022535	AGCGGA	2	12	2133583	2133594	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022535	CGGCAT	2	12	2170038	2170049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022535	CATGAA	2	12	2188542	2188553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022535	CGAATG	2	12	2293253	2293264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022535	CGGCCG	2	12	2311388	2311399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022535	TTTTTA	2	12	2323725	2323736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022535	GATTCC	2	12	2328273	2328284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022535	GCAAAC	3	18	2371812	2371829	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022535	AAACCC	2	12	2411838	2411849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022535	CCGGAT	2	12	2519667	2519678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022535	AATCGG	2	12	2609649	2609660	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022535	ACGTAA	2	12	2631627	2631638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022535	ATCGCG	2	12	2648789	2648800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022535	GCACAG	2	12	2812932	2812943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022535	GCCGCA	2	12	2844458	2844469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.