MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022535	TTTG	2	8	3869	3876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022535	TTGA	2	8	11210	11217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022535	GGAA	2	8	11220	11227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022535	GAGG	2	8	12275	12282	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022535	CCAG	2	8	37287	37294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022535	GGCC	2	8	45723	45730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022535	TGGC	2	8	48275	48282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022535	TAAA	2	8	56822	56829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022535	GAAC	2	8	57145	57152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022535	GTGA	2	8	57488	57495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022535	TCTT	2	8	58798	58805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022535	AGGT	2	8	59384	59391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022535	AACG	2	8	59818	59825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022535	GCGA	2	8	59955	59962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022535	AGTT	2	8	60348	60355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022535	CGTC	2	8	60653	60660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022535	AAAG	2	8	60776	60783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022535	AGGG	2	8	61430	61437	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022535	AACC	2	8	62331	62338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022535	TCGA	2	8	62438	62445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022535	ATTT	2	8	66758	66765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022535	GAAT	2	8	67953	67960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022535	TATT	2	8	70720	70727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022535	CGGG	2	8	70973	70980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022535	TGCG	2	8	71013	71020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022535	TTTC	2	8	79862	79869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022535	ACAA	2	8	79904	79911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022535	CGCC	2	8	81828	81835	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_022535	GAGC	2	8	88281	88288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022535	CGGA	2	8	88359	88366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022535	GAGG	2	8	97597	97604	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022535	GTTT	2	8	101187	101194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022535	CCCG	2	8	104470	104477	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_022535	CTTG	2	8	105238	105245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022535	GTCA	2	8	109378	109385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022535	GGAA	2	8	109937	109944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022535	TGTC	2	8	111663	111670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022535	TGCC	2	8	117757	117764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022535	CCAC	2	8	120963	120970	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_022535	AAGG	2	8	124332	124339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022535	CCTT	2	8	139456	139463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022535	CCGC	2	8	148922	148929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_022535	GCCG	2	8	163114	163121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022535	TGGC	2	8	163140	163147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022535	TGCC	2	8	163212	163219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022535	AAAT	2	8	163259	163266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022535	CAGC	2	8	164232	164239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022535	GCAG	2	8	171071	171078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022535	TCTG	2	8	171269	171276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022535	CGCC	2	8	175087	175094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_022535	ATGA	2	8	185164	185171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022535	TCAC	2	8	186775	186782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022535	CCGC	2	8	186856	186863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_022535	GATT	2	8	195643	195650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022535	AATC	2	8	208833	208840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_022535	CCGT	2	8	209813	209820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022535	GTTC	2	8	212253	212260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_022535	TAAA	2	8	227267	227274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022535	AAAC	2	8	227312	227319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022535	TTCA	2	8	227470	227477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022535	CGGT	2	8	235128	235135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022535	CAAT	2	8	248408	248415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022535	CAGT	2	8	265276	265283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022535	CTCG	2	8	270172	270179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022535	GACC	2	8	272060	272067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022535	GCCT	3	12	275464	275475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022535	GGCA	2	8	275512	275519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_022535	GATT	2	8	283086	283093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022535	CGTT	2	8	287501	287508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_022535	GAAA	2	8	291387	291394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022535	CCGG	2	8	292765	292772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022535	TGCC	2	8	302655	302662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022535	GTCT	2	8	311998	312005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022535	GCCC	2	8	313903	313910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_022535	CGGG	2	8	314832	314839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_022535	AAGG	2	8	321324	321331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022535	TTTG	2	8	324337	324344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022535	TCTA	2	8	326514	326521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022535	CGTG	2	8	334271	334278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_022535	GCAT	2	8	345164	345171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_022535	GATT	2	8	358189	358196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022535	CTTT	2	8	369373	369380	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022535	TCCG	2	8	371232	371239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022535	GGTA	2	8	375786	375793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022535	ATTT	2	8	375803	375810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022535	TTCT	2	8	376059	376066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022535	GTTT	2	8	378267	378274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022535	GCAC	2	8	380088	380095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022535	CGAA	2	8	380280	380287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_022535	GGTC	2	8	391166	391173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_022535	TGGC	2	8	394258	394265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022535	TTCT	2	8	409190	409197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022535	AAAC	2	8	410062	410069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022535	GCAA	2	8	410126	410133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_022535	CGAG	2	8	414325	414332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022535	TACA	2	8	415632	415639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_022535	TTAG	2	8	415671	415678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022535	GGCA	2	8	417024	417031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_022535	CGGC	2	8	420755	420762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022535	GGGC	2	8	424752	424759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022535	ATGA	2	8	427449	427456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022535	CCGG	2	8	427579	427586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022535	GAAT	2	8	427602	427609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022535	TTGT	2	8	430134	430141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022535	ATGT	2	8	431633	431640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022535	GTTT	2	8	441446	441453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022535	CCTC	2	8	442086	442093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_022535	CAGC	2	8	442253	442260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022535	CGAT	2	8	442725	442732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022535	TAAT	2	8	445769	445776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022535	AGGA	2	8	454565	454572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022535	TCCT	2	8	456970	456977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022535	TTTC	2	8	458916	458923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_022535	CCTT	2	8	458943	458950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022535	GAAA	2	8	458993	459000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022535	GTTG	2	8	460861	460868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022535	TCTT	2	8	460931	460938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_022535	GGAA	2	8	465419	465426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022535	TCTG	2	8	467312	467319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_022535	TCGC	2	8	471249	471256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022535	CCGC	2	8	471264	471271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_022535	ATTT	2	8	471532	471539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022535	CCGG	2	8	477634	477641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022535	CAAG	2	8	486115	486122	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022535	GCCT	2	8	494238	494245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022535	ATGA	2	8	494328	494335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022535	AGAT	2	8	499852	499859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022535	CGGC	2	8	504080	504087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022535	CTCG	2	8	505364	505371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022535	AATA	2	8	505544	505551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022535	TTGG	2	8	505608	505615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022535	CTGT	2	8	507593	507600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_022535	CGAT	2	8	508936	508943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022535	CTTC	2	8	511799	511806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022535	CTTT	2	8	513224	513231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_022535	CAGT	2	8	517029	517036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_022535	TTAT	2	8	518526	518533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022535	GCCT	2	8	522765	522772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022535	GCTT	2	8	528473	528480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022535	CTGG	2	8	528489	528496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022535	AACG	2	8	533938	533945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_022535	GCAG	2	8	535625	535632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022535	ATTG	2	8	552466	552473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022535	CGGG	2	8	552547	552554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022535	TTTG	2	8	553278	553285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022535	GTCC	2	8	553323	553330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022535	GCGG	2	8	553331	553338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_022535	AGGG	2	8	558886	558893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022535	GAGG	2	8	562771	562778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022535	CTGT	2	8	563905	563912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_022535	CCAA	2	8	574553	574560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022535	CCGC	2	8	580573	580580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_022535	CGGC	2	8	580592	580599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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442	NC_022535	TCGG	2	8	1363517	1363524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
443	NC_022535	CTCA	2	8	1363719	1363726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
444	NC_022535	AAAT	2	8	1363833	1363840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_022535	CTAT	2	8	1389619	1389626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
451	NC_022535	GTTA	2	8	1391815	1391822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_022535	ATGG	2	8	1394071	1394078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_022535	ATCT	2	8	1435964	1435971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
460	NC_022535	ATGC	2	8	1435986	1435993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_022535	TCGG	2	8	1444671	1444678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
466	NC_022535	AGCG	2	8	1447430	1447437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_022535	TTCG	2	8	1454146	1454153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
469	NC_022535	TGAT	2	8	1455047	1455054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_022535	GCAG	2	8	1471157	1471164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
475	NC_022535	AACG	2	8	1476297	1476304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
476	NC_022535	ATGG	2	8	1478324	1478331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_022535	GGAC	2	8	1478350	1478357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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479	NC_022535	CCGC	2	8	1489022	1489029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
480	NC_022535	GCCA	2	8	1496357	1496364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_022535	AACA	2	8	1496608	1496615	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_022535	CCTC	2	8	1504116	1504123	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
484	NC_022535	AGCC	2	8	1510155	1510162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_022535	TCGT	2	8	1515837	1515844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_022535	TCAA	2	8	1517368	1517375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_022535	TGTT	2	8	1518386	1518393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_022535	CATC	2	8	1518420	1518427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_022535	GCTG	2	8	1521271	1521278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_022535	TGTC	2	8	1528011	1528018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_022535	TATT	2	8	1535492	1535499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_022535	GCCC	2	8	1535520	1535527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
493	NC_022535	CTTT	2	8	1535666	1535673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_022535	GGCG	2	8	1535708	1535715	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_022535	TTGA	2	8	1537210	1537217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_022535	CAAA	2	8	1538464	1538471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
497	NC_022535	CACC	2	8	1554809	1554816	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
498	NC_022535	GCCT	2	8	1556690	1556697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_022535	AGGC	2	8	1557757	1557764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_022535	CAAC	2	8	1564795	1564802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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